| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 第一章 综述 | 第13-28页 |
| 第一节 短尾次目系统发生概况 | 第13-22页 |
| 一、短尾次目在十足目中的进化地位 | 第13-14页 |
| 二、短尾次目的起源 | 第14-16页 |
| 三、短尾类内部的系统发育研究 | 第16-18页 |
| 四、肢孔派内部的系统发育 | 第18-22页 |
| 第二节 后生动物线粒体基因组研究进展 | 第22-26页 |
| 一、线粒体基因组特征 | 第22-23页 |
| 二、线粒体基因组在甲壳动物进化中的应用 | 第23页 |
| 三、短尾类线粒体基因组特征 | 第23-26页 |
| 第三节 本研究的目的和意义 | 第26-28页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第28-39页 |
| 第一节 实验材料 | 第28-32页 |
| 一、主要仪器设备 | 第28页 |
| 二、实验主要试剂 | 第28-30页 |
| 三、研究对象介绍 | 第30-32页 |
| 第二节 实验方法 | 第32-39页 |
| 一、样品采集和基因组DNA的提取 | 第32-33页 |
| 二、Long-PCR扩增及步移法测序 | 第33-36页 |
| 三、序列分析及基因预测 | 第36页 |
| 四、比较线粒体基因组学分析 | 第36-37页 |
| 五、系统发生分析 | 第37-39页 |
| 第三章 实验结果和讨论 | 第39-77页 |
| 第一节 线粒体基因组的基本特征 | 第39-72页 |
| 一、基因组的结构 | 第39-44页 |
| 二、基因组碱基组成和偏好性 | 第44-46页 |
| 三、蛋白编码基因 | 第46-47页 |
| 四、密码子使用偏好 | 第47-52页 |
| 五、同义替换和非同义替换 | 第52-53页 |
| 六、线粒体基因相似性分析 | 第53-55页 |
| 七、Sliding window分析线粒体基因核苷酸多样性 | 第55-56页 |
| 八、转运RNA和核糖体RNA | 第56-64页 |
| 九、非编码区 | 第64-70页 |
| 十、基因的排列和重排机制 | 第70-72页 |
| 第二节 基于线粒体全序列探讨短尾类的系统发生 | 第72-77页 |
| 第四章 小结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-91页 |
| 作者简历 | 第91-92页 |
| 硕士期间发表的学术论文与研究成果 | 第92-93页 |