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基于基因组信息的大黄鱼(Pseudosciaena crocea)微卫星标记开发及应用

摘要第1-10页
Abstract第10-16页
第一章 文献综述第16-26页
   ·鱼类遗传多样性的研究方法第16-19页
     ·形态学水平的研究第16页
     ·染色体及其组型研究第16-17页
     ·生化遗传学第17页
     ·分子标记第17-19页
   ·微卫星分子标记概述及其在遗传多样性研究中的应用第19-26页
     ·微卫星 DNA 的发现第19-20页
     ·微卫星 DNA 的分布第20页
     ·微卫星的产生以及突变机理第20-21页
     ·微卫星的功能第21-22页
     ·微卫星的检测方法第22-23页
     ·微卫星序列的获取第23-24页
     ·微卫星标记在鱼类遗传多样性中应用第24-25页
     ·本研究的内容、目的及意义第25-26页
第二章 基于基因组信息的大黄鱼(Pseudosciaena crocea)微卫星重复序列特征分析第26-36页
   ·材料与方法第26-27页
     ·基因组测序和全基因组信息获取第26-27页
     ·微卫星序列获得第27页
     ·全基因组微卫星序列的特征分析第27页
   ·实验结果第27-33页
     ·对大黄鱼基因组微卫星序列各重复类型的分析第27页
     ·大黄鱼基因组微卫星各优势重复单元的碱基组成第27-28页
     ·大黄鱼基因组微卫星长度及变异分析第28-32页
     ·大黄鱼基因组微卫星中 AT 含量与不同重复单元微卫星的序列总数、累积长度以及平均拷贝数之间的相关性分析第32-33页
   ·讨论第33-36页
     ·大黄鱼全基因组微卫星各优势重复单元的碱基组成第33-34页
     ·不同重复单元微卫星的长度与拷贝数以及变异系数之间的关系第34页
     ·大黄鱼基因组微卫星中 AT 含量的分析第34-36页
第三章 基于基因组信息的大黄鱼(Pseudosciaena crocea)微卫星标记引物的快速筛选与评价第36-53页
   ·实验材料第36-39页
     ·实验材料第36页
     ·实验仪器和试剂第36-37页
     ·实验试剂第37-39页
   ·实验方法第39-44页
     ·大黄鱼微卫星基因组 DNA 的提取第39-40页
     ·大黄鱼微卫星引物的设计第40-42页
     ·PCR 扩增第42页
     ·聚丙烯胶凝胶电泳检测 PCR 产物第42-43页
     ·实验数据处理第43-44页
   ·实验结果与分析第44-50页
     ·琼脂糖凝胶电泳结果第44页
     ·大黄鱼微卫星扩增和电泳结果第44-45页
     ·大黄鱼微卫星多态性分析第45-50页
   ·讨论第50-53页
     ·基于全基因组微卫星标记开发的高效性分析第50页
     ·大黄鱼自然群体微卫星多态性特征第50-52页
     ·大黄鱼微卫星中影子带的探讨第52-53页
第四章 微卫星标记在大黄鱼(Pseudosciaena crocea)群体遗传中的应用第53-64页
   ·实验材料第54页
     ·实验材料第54页
     ·实验仪器与试剂第54页
   ·实验方法第54-56页
     ·基因组 DNA 的提取第54页
     ·PCR 扩增第54-56页
     ·聚丙烯胶凝胶电泳检测 PCR 产物第56页
     ·实验数据处理第56页
   ·实验结果第56-61页
     ·琼脂糖电泳检测大黄鱼基因组 DNA 结果第56页
     ·聚丙烯凝胶电泳检测不同群体大黄鱼微卫星标记的结果第56-57页
     ·大黄鱼群体遗传多样性第57-60页
     ·大黄鱼群体之间的遗传距离和聚类分析第60-61页
   ·讨论第61-64页
     ·群体之间遗传多样性分析第61-62页
     ·大黄鱼群体遗传分化的探讨第62-64页
结论第64-66页
参考文献第66-76页
致谢第76-77页
在读期间发表的学术论文及研究成果第77页

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