分子构象多模态优化算法设计及实现
摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-11页 |
第1章 绪论 | 第11-17页 |
·研究背景和意义 | 第11-12页 |
·国内外研究现状与发展趋势 | 第12-15页 |
·研究内容 | 第15-16页 |
·结构安排 | 第16-17页 |
第2章 蛋白质能量模型 | 第17-30页 |
·力场作用项的一般式 | 第17-19页 |
·力场发展 | 第19-23页 |
·涵盖周期表元素的力场 | 第23-24页 |
·特殊力场 | 第24-25页 |
·ECEPP/3力场 | 第25-26页 |
·笛卡尔坐标与二面角转换方法 | 第26-28页 |
·模型转换 | 第28-29页 |
·本章小结 | 第29-30页 |
第3章 构象空间退火算法设计及实现 | 第30-43页 |
·引言 | 第30-32页 |
·集结过程 | 第30-31页 |
·遗传算法 | 第31页 |
·蒙特卡罗方法 | 第31-32页 |
·构象空间退火算法 | 第32-36页 |
·算法流程 | 第32-34页 |
·退火策略 | 第34页 |
·选择seed | 第34-35页 |
·获取trial个体 | 第35-36页 |
·更新Bank | 第36页 |
·案例研究 | 第36-41页 |
·算法结果分析 | 第41-42页 |
·本章小结 | 第42-43页 |
第4章 改进的构象空间退火算法CSA-DE | 第43-58页 |
·差分进化算法(DE) | 第43-45页 |
·混合优化算法CSA-DE | 第45-50页 |
·退火策略 | 第46页 |
·选择种子 | 第46-47页 |
·扰动策略 | 第47页 |
·更新策略 | 第47-48页 |
·算法描述 | 第48-50页 |
·数值研究 | 第50-55页 |
·测试问题 | 第50-51页 |
·评价指标 | 第51-52页 |
·结果分析 | 第52-55页 |
·案例研究 | 第55-57页 |
·本章小结 | 第57-58页 |
第5章 总结与展望 | 第58-59页 |
·研究工作总结 | 第58页 |
·展望 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-63页 |
致谢 | 第63-64页 |
攻读学位期间参加的科研项目和成果 | 第64页 |