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四种蝗虫线粒体基因组测序及系统发生分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第1章 前言第10-20页
   ·线粒体结构的基本特征第10-13页
     ·核糖体RNA第10-11页
     ·转运RNA第11页
     ·蛋白编码基因第11-12页
     ·非编码区第12-13页
   ·线粒体DNA在系统发生中的应用第13-14页
   ·本研究所测四种蝗虫介绍第14-18页
     ·贵州蹦蝗第16-17页
     ·峨眉小蹦蝗第17页
     ·太白秦岭蝗第17-18页
     ·青海屹蝗第18页
   ·本研究的目的意义第18-20页
第2章 材料与方法第20-30页
   ·实验材料第20页
     ·实验所用材料的采集与物种种名鉴定第20页
   ·实验方法第20-23页
     ·线粒体基因组全序列测定第20-23页
   ·基于线粒体基因的直翅目昆虫系统发生关系分析第23-30页
     ·数据来源第23-25页
     ·PAUP~*软件及使用第25-26页
     ·分子系统发生学的方法论第26-27页
     ·系统发生分析的策略与步骤第27-30页
第3章 四种蝗虫全线粒体基因序列测定第30-70页
   ·峨眉小蹦蝗线粒体基因组全序列第30-40页
     ·线粒体基因组的基本组成特征第30-32页
     ·蛋白质编码基因第32-34页
     ·tRNA基因第34-36页
     ·rRNA基因第36页
     ·A+T丰富区第36-40页
   ·贵州蹦蝗线粒体基因组全序列第40-50页
     ·贵州蹦蝗线粒体基因组的基本组成特征第40-42页
     ·蛋白质编码基因第42-44页
     ·tRNA基因第44-46页
     ·rRNA基因第46页
     ·A+T丰富区第46-50页
   ·太白秦岭蝗线粒体基因组全序列第50-60页
     ·太白秦岭蝗线粒体基因组的基本组成特征第50-52页
     ·蛋白质编码基因第52-53页
     ·tRNA基因第53-56页
     ·rRNA基因第56页
     ·A+T丰富区第56-60页
   ·青海屹蝗线粒体基因组全序列第60-70页
     ·青海屹线粒体基因组的基本组成特征第60-62页
     ·蛋白质编码基因第62-64页
     ·tRNA基因第64-66页
     ·rRNA基因第66页
     ·A+T丰富区第66-70页
第4章 斑腿蝗科线粒体基因组比较研究第70-78页
   ·13个线粒体蛋白基因的长度变异及序列分化第70-74页
     ·长度变异第70-71页
     ·核苷酸和氨基酸序列变异第71-73页
     ·遗传P-距离分析第73-74页
   ·线粒体蛋白基因碱基组成的链间偏向性第74-75页
   ·全线粒体基因组分区域的碱基组成比较第75-77页
     ·A+T含量(AT%)第75-76页
     ·AT-偏斜和GC-偏斜第76-77页
   ·线粒体各蛋白基因的碱基组成第77页
     ·A+T含量(AT%)第77页
   ·A+T丰富区的比较第77-78页
第5章 网翅蝗科线粒体基因组比较研究第78-90页
   ·13个线粒体蛋白基因的长度变异及序列分化第78-84页
     ·长度变异第78-79页
     ·核苷酸和氨基酸序列变异第79-82页
     ·遗传P-距离分析第82-84页
   ·线粒体蛋白基因碱基组成的链间偏向性第84-87页
   ·全线粒体基因组分区域的碱基组成比较第87-88页
     ·A+T含量(AT%)第87页
     ·AT-偏斜和GC-偏斜第87-88页
   ·线粒体各蛋白基因的碱基组成第88-89页
     ·A+T含量(AT%)第88-89页
   ·A+T丰富区的比较第89-90页
第6章 直翅目系统发生重建第90-110页
   ·数据准备第90-91页
   ·建树第91-95页
     ·贝叶斯系统发育推论法第91-92页
     ·简约法建树(Maximum Parsimony Method,MP)第92-93页
     ·最大似然法建树(Maximum Likelihood,ML)第93-95页
   ·建树结果第95-110页
     ·13个PCG基因联合数据集构建的系统发育树第95-101页
     ·2个rRNA基因联合数据集构建的系统发育树第101-107页
     ·全线粒体基因组37个基因联合数据集构建的系统发育树第107-110页
总结第110-114页
参考文献第114-126页
致谢第126-128页
攻读博士学位期间研究成果第128-129页

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