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基于聚类分析的蛋白质质谱数据分析研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
第1章 绪论第9-18页
   ·研究背景及意义第9-10页
   ·基于蛋白质组学的癌症研究第10-11页
   ·质谱数据特征选择以及特征提取算法研究现状第11-16页
     ·过滤法第12-14页
     ·缠绕法第14页
     ·嵌入法第14-15页
     ·其他特征选择算法第15-16页
   ·本文主要工作第16-18页
     ·本文主要内容第16-17页
     ·本文组织结构第17-18页
第2章 SELDI 蛋白质谱技术及分析算法第18-35页
   ·SELDI 质谱技术第18-22页
     ·质谱技术第18-19页
     ·SELDI 质谱分析技术第19-22页
   ·质谱数据分析算法第22-34页
     ·预处理算法第22-25页
     ·聚类分析第25-28页
       ·层次聚类与划分聚类第25-27页
       ·互斥聚类、重叠聚类与模糊聚类第27-28页
       ·完全聚类与部分聚类第28页
     ·主成分分析(PCA)第28-30页
     ·线性判别分析(LDA)第30-31页
     ·零空间线性判别分析(NLDA)第31页
     ·支持向量机分类算法第31-34页
   ·本章小结第34-35页
第3章 基于聚类分析的肿瘤分类研究第35-50页
   ·聚类分析在高通量数据分析中的应用第35-36页
   ·实验数据集描述和数据预处理步骤第36-39页
     ·公共卵巢癌 OC-WCX2a、OC-WCX2b 样本数据集第36-38页
     ·医院乳腺癌 BC-WCX2a 样本数据第38-39页
   ·实验算法及实验流程第39-44页
     ·T-test 降维算法第39-40页
     ·近邻传播聚类分析算法(AP Clustering)第40-41页
     ·SVM-RFE 特征选择算法第41-42页
     ·实验流程概述第42-44页
   ·实验结果及其结果分析第44-49页
     ·分类性能及结果分析第44-48页
     ·特征相关性第48-49页
   ·本章小结第49-50页
第4章 基于聚类分析的质谱数据生物标记物挑选第50-60页
   ·样本描述与预处理第50-51页
     ·前列腺癌公共样本数据集 PC-H4第50-51页
     ·公共卵巢癌 OC-WCX2a、OC-WCX2b 样本数据第51页
     ·医院乳腺癌 BC-WCX2a 样本数据第51页
   ·实验算法及实验流程第51-52页
   ·实验结果与分析第52-58页
     ·公共卵巢癌 OC-WCX2a、OC-WCX2b 样本和公共前列腺癌 PC-H4 样本第52-56页
     ·医院乳腺癌 BC-WCX2a 样本第56-58页
   ·本章小结第58-60页
第5章 总结与展望第60-62页
致谢第62-63页
参考文献第63-70页
附录第70页

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