DNA计算编码设计优化方法研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-19页 |
| ·课题背景和意义 | 第12-13页 |
| ·研究现状综述 | 第13-18页 |
| ·DNA计算问题研究 | 第13-15页 |
| ·DNA编码问题研究 | 第15-16页 |
| ·DNA编码算法研究现状 | 第16-18页 |
| ·本文的主要工作 | 第18页 |
| ·本文的内容安排 | 第18-19页 |
| 第2章 DNA编码原理 | 第19-30页 |
| ·DNA计算基本理论 | 第19-20页 |
| ·DNA编码的生物学基础 | 第20-22页 |
| ·DNA编码的定义 | 第22-23页 |
| ·DNA编码的约束条件 | 第23-30页 |
| ·汉明距离约束条件 | 第23-24页 |
| ·相似度约束条件 | 第24-25页 |
| ·H-measure约束条件 | 第25页 |
| ·序列3’端H-measure约束条件 | 第25页 |
| ·重叠子序列约束(最小子串约束) | 第25页 |
| ·发卡结构约束条件 | 第25-26页 |
| ·连续性约束条件 | 第26-27页 |
| ·GC含量约束条件 | 第27页 |
| ·解链温度约束条件 | 第27-28页 |
| ·化学自由能约束条件 | 第28页 |
| ·限定子序列约束条件 | 第28-29页 |
| ·DNA模板序列约束条件 | 第29-30页 |
| 第3章 多目标优化DNA编码约束模型建立 | 第30-35页 |
| ·DNA编码问题及复杂性分析 | 第30-31页 |
| ·DNA编码约束约束条件分析 | 第31-32页 |
| ·DNA编码约束条件 | 第32-33页 |
| ·H-measure约束改进 | 第32页 |
| ·相似度约束(Similarity) | 第32页 |
| ·连续性(Continuity) | 第32页 |
| ·发卡结构(Hairpin) | 第32页 |
| ·解链温度(Tm) | 第32-33页 |
| ·GC含量(GC) | 第33页 |
| ·DNA编码约束数学模型 | 第33-34页 |
| ·建立DNA编码约束数学模型 | 第33-34页 |
| ·DNA编码序列的适应度函数 | 第34页 |
| ·小结 | 第34-35页 |
| 第4章 基于全局人工鱼群的DNA编码序列算法 | 第35-45页 |
| ·引言 | 第35页 |
| ·全局人工鱼群优化算法设计 | 第35-37页 |
| ·相关定义 | 第35页 |
| ·人工鱼的行为描述 | 第35-36页 |
| ·人工鱼视野和步长调整方法 | 第36页 |
| ·全局人工鱼群优化算法实现流程 | 第36-37页 |
| ·基于全局人工鱼群的编码序列优化算法设计 | 第37-38页 |
| ·DNA编码序列的编码方式 | 第37-38页 |
| ·组合优化适应度函数 | 第38页 |
| ·GAFSA算法流程 | 第38页 |
| ·实验结果与分析 | 第38-44页 |
| ·与遗传算法的实验比较 | 第38-40页 |
| ·和多目标进化算法的实验比较 | 第40-42页 |
| ·和遗传粒子群算法的编码比较 | 第42-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 第5章 综合编码系统 | 第45-54页 |
| ·系统整体框架设计 | 第45-46页 |
| ·系统体系架构设计 | 第45-46页 |
| ·程序运行流程图 | 第46页 |
| ·系统应用举例 | 第46-52页 |
| ·小结 | 第52-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录A 攻读学位期间主要研究成果 | 第62页 |
