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绒山羊绒毛生长相关基因的筛选、鉴定和多态性分析

摘要第1-6页
Abstract第6-17页
1 引言第17-38页
   ·绒山羊绒毛生长与调控第17-19页
     ·绒山羊毛被组成及生长规律第17-18页
     ·影响绒山羊毛被生长的因素第18-19页
   ·毛囊周期形态及周期性变化规律第19-24页
     ·绒山羊皮肤毛囊结构,形态及变化规律第19-20页
     ·参与毛囊调控的信号通路第20-24页
   ·影响绒山羊产绒性状的重要功能基因第24-28页
     ·角蛋白基因第24页
     ·成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因第24-25页
     ·绒山羊内分泌激素类基因研究进展第25-28页
   ·山羊经济性状候选基因研究的意义第28页
     ·遗传多样性研究有助于保护优质品种资源第28页
     ·标记辅助选择有助于培育山羊新品种第28页
   ·本论文用到的主要分子生物技术第28-35页
     ·PCR-SSCP技术第28-30页
     ·基因芯片技术第30-33页
     ·实时定量RT-PCR第33-35页
   ·本研究的目的和意义第35-36页
   ·技术路线第36-38页
     ·绒山羊内分泌激素类基因SNP研究第36-37页
     ·利用基因芯片技术筛选绒山羊皮肤差异表达基因的筛选第37-38页
2 研究一 绒山羊内分泌激素类基因SNP研究第38-71页
   ·实验材料第38-40页
     ·实验样品第38页
     ·主要仪器设备第38页
     ·本研究主要试剂及溶液的配植第38-40页
     ·主要分子生物学软件及相关网站第40页
   ·实验方法第40-44页
     ·基因组DNA的提取与检测第40-41页
     ·PCR反应第41-42页
     ·绒山羊产绒性状候选基因的PCR-SSCP分析第42-44页
   ·数据分析第44-45页
     ·等位基因频率第44页
     ·基因型频率第44页
     ·多态信息含量、基因纯合度、基因杂合度和有效等位基因数第44页
     ·群体Hardy-Weinberg平衡状态的检验第44-45页
     ·方差分析第45页
   ·结果与分析第45-66页
     ·基因组DNA的提取与检测结果第45页
     ·PRL及PRLR基因的多态性分析第45-52页
     ·MLTR基因的多态性分析第52-59页
     ·IGF-1基因的多态性分析第59-61页
     ·TG基因的多态性分析第61-66页
   ·讨论第66-70页
     ·PRL、PRLR基因与绒山羊体重和产绒性状的关系第66-68页
     ·MLTR基因与绒山羊体重和产绒性状的关系第68-69页
     ·TG基因与绒山羊体重和产绒性状的关系第69页
     ·关于各基因位点的群体遗传学分析第69-70页
   ·小结第70-71页
3 研究二 利用基因芯片技术筛选绒山羊皮肤差异表达基因的研究第71-91页
   ·试验材料及其来源第71-72页
     ·试验羊及样品采集第71页
     ·主要试剂及仪器第71-72页
     ·芯片第72页
   ·实验方法第72-82页
     ·样品总RNA的提取第72-73页
     ·RNA质检,RNA甲醛变性胶电泳第73页
     ·RNA纯化第73-74页
     ·反转录合成单链cDNA第74-75页
     ·体外转录合成cRNA第75-76页
     ·aRNA纯化第76-77页
     ·cRNA反转录第77-78页
     ·cDNA纯化第78-79页
     ·荧光标记第79-80页
     ·芯片杂交第80-81页
     ·芯片清洗第81页
     ·芯片扫描第81页
     ·芯片图像的采集和数据分析第81-82页
     ·聚类分析第82页
   ·试验结果第82-88页
     ·绒山羊皮肤组织总RNA提取结果第82页
     ·基因芯片杂交结果第82-85页
     ·绒山羊皮肤组织差异表达基因筛选结果第85-88页
     ·聚类分析结果第88页
   ·讨论第88-90页
     ·关于实验羊的选择和采样第88-89页
     ·关于基因芯片技术第89-90页
     ·关于芯片杂交结果的分析第90页
   ·小结第90-91页
4 研究三 差异表达基因的GO和PATHWAY分析第91-99页
   ·研究方法第91页
   ·结果与分析第91-96页
     ·基因功能分类分析(gene ontology)第91-94页
     ·Pathway信号通路分析第94-96页
   ·讨论第96-98页
   ·小结第98-99页
5 研究四 Realtime RT-PCR验证芯片结果的准确性第99-110页
   ·试验材料及其来源第99-100页
     ·试验羊及样品采集第99页
     ·主要试剂及仪器第99-100页
   ·实验方法第100-104页
     ·引物设计第100页
     ·样品总RNA的提取及质量检测第100页
     ·DNase Ⅰ消化基因组DNA第100页
     ·Total RNA纯化第100-101页
     ·Total RNA纯化效果验证第101页
     ·Total RNA消化效果验证第101-102页
     ·RNA逆转录第102-103页
     ·RealTime PCR反应第103-104页
     ·数据分析方法第104页
   ·结果第104-109页
     ·绒山羊皮肤组织总RNA提取结果第104-105页
     ·看家基因GAPDH基因的Real time PCR结果第105-106页
     ·待测基因PAX6基因的Real time PCR结果第106-108页
     ·待测基因CSN2基因的Real time PCR结果第108-109页
   ·讨论第109-110页
   ·小结第110页
6 结论第110-111页
7 本论文的创新之处第111-112页
致谢第112-113页
参考文献第113-125页
作者简介第125页

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