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一个在四倍体棉花中差异表达的AP2/ERF家族基因的克隆、鉴定和进化分析

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
本文所用主要缩略词第10-11页
第一部分 文献综述第11-24页
 1 基因差异表达(gene differential expression)与杂种优势关系研究第11-12页
 2 基因克隆技术的研究和进展第12-16页
   ·序列克隆第12-13页
     ·根据已知基因的序列进行同源克隆第12-13页
     ·根据网上提供的序列进行电子克隆第13页
   ·差异表达分析第13-15页
     ·mRNA差异显示第13-14页
     ·抑制消减杂交第14-15页
   ·图位克隆第15页
   ·转座子或T-DNA标签法第15页
   ·cDNA微阵列(cDNA Array)分析第15-16页
   ·问题与展望第16页
 3 植物中的转录因子基因第16-17页
 4 植物ERF类(Ethylene-Responsive Elemental Binding Factor)转录因子的研究进展第17-23页
   ·ERF转录因子的结构特征第18-20页
   ·与ERF转录因子结合的顺式作用元件第20页
   ·ERF在信号传导途径中的作用及生物学功能第20-22页
   ·植物中ERF转录因子研究进展第22-23页
 5 棉花中ERF的研究进展第23-24页
本研究的目的和意义第24-25页
第二部分 研究报告第25-64页
 引言第25页
 1 实验材料第25-27页
   ·植物材料第25-26页
   ·菌株与培养基第26页
   ·酶与生化试剂第26页
   ·引物第26-27页
 2 实验方法第27-42页
   ·总RNA的提取第27-29页
     ·纤维、胚珠和叶片RNA的提取第27页
     ·根和茎RNA的提取第27-29页
   ·总RNA消化、反转及RT-PCR第29-30页
     ·总RNA中DNA的消化第29-30页
     ·mRNA反转录第30页
     ·RT-PCR第30页
   ·DNA的提取第30-32页
   ·目的基因的克隆第32-33页
     ·GhERF1及GhERF7全长cDNA的获得第32页
     ·GhERF1及GhERF7启动子的获得第32-33页
   ·扩增产物的回收、克隆及测序第33-35页
     ·扩增产物的回收第33页
     ·目的片断的连接第33-34页
     ·感受态细胞的制备第34页
     ·大肠杆菌的转化第34页
     ·阳性克隆的测序第34-35页
   ·序列的生物信息学分析第35页
   ·Southern杂交分析第35-38页
     ·基因组DNA的酶切第35-36页
     ·试剂及其配制第36页
     ·Southern印迹第36-37页
     ·DIG标记探针第37页
     ·杂交第37-38页
     ·洗膜与显色第38页
   ·基因组来源及进化分析第38-40页
     ·基因组来源分析第38页
     ·GhERF7基因进化分析第38-40页
   ·基因的染色体定位第40-41页
   ·目的基因与产量构成因子的相关分析第41-42页
 3 结果与分析第42-60页
   ·GhERF1/7基因的克隆与序列分析第42-46页
     ·GhERF1和GhERF7基因cDNA序列的克隆第42-43页
     ·基因序列分析第43-44页
     ·GhERF7基因与其他同源基因的聚类分析第44-46页
   ·GhERF1/7基因的表达分析第46-47页
   ·GhERF1和GhERF7基因部分启动子的克隆与分析第47-50页
   ·GhERF1/7 Southern杂交分析第50-51页
   ·GhERF1/7基因组来源和进化分析第51-56页
     ·GhERF1/7基因组来源分析第51-52页
     ·GhERF7基因的进化分析第52-56页
   ·GhERF1和GhERF7的染色体定位第56-58页
   ·GhERF7与产量构成因子的相关分析第58-60页
 4 讨论第60-64页
   ·GhERF7基因与GhERF1基因的比较第60-61页
   ·GhERF7基因的进化、定位及与杂种优势的关系第61-64页
全文结论第64-65页
参考文献第65-75页
致谢第75页

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