| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-14页 |
| ·课题背景 | 第8-12页 |
| ·蛋白质组学研究概述 | 第9-12页 |
| ·蛋白质复合体的概念 | 第12页 |
| ·蛋白质互作数据存在的问题 | 第12页 |
| ·国内外研究现状 | 第12-13页 |
| ·课题研究的目的和意义 | 第13页 |
| ·课题研究内容和来源 | 第13-14页 |
| 第2章 基于计算的蛋白质互作方法研究 | 第14-23页 |
| ·基于网络固有motif的蛋白质互作预测 | 第14-18页 |
| ·概述 | 第14页 |
| ·推荐系统——Suggest | 第14-15页 |
| ·相似性定义 | 第15-16页 |
| ·各种方法的对比 | 第16-18页 |
| ·算法小结 | 第18页 |
| ·基于缺陷团的蛋白质互作预测 | 第18-22页 |
| ·概述 | 第18-19页 |
| ·方法基本思想 | 第19页 |
| ·寻找defective cliques的基本方法 | 第19-20页 |
| ·使用最大cliques的改进方法 | 第20-22页 |
| ·算法小结 | 第22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 评估蛋白质互作对稳定性的IG2 方法 | 第23-33页 |
| ·概述 | 第23-24页 |
| ·基于拓扑结构的蛋白质互作稳定性评估方法 | 第24-28页 |
| ·IG2 方法基本思想 | 第24-26页 |
| ·IG2 方法的计算过程 | 第26-28页 |
| ·建立蛋白质互作网的算法 | 第28-29页 |
| ·查找特定拓扑结构的算法 | 第29-31页 |
| ·计算特征向量的算法 | 第31-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第4章 评估蛋白质复合体稳定性的方法 | 第33-45页 |
| ·评估蛋白质复合体稳定性的基本方法 | 第33-34页 |
| ·基本评估方法思想 | 第33页 |
| ·基本评估公式 | 第33页 |
| ·方法流程 | 第33-34页 |
| ·评估蛋白质复合体稳定性的改进方法 | 第34-41页 |
| ·改进评估方法思想 | 第34-36页 |
| ·改进评估公式 | 第36页 |
| ·分类算法 | 第36-40页 |
| ·方法流程 | 第40-41页 |
| ·基于类别的稳定性评估方法 | 第41-44页 |
| ·基于类别评估方法基本思想 | 第41-42页 |
| ·数据的预处理 | 第42页 |
| ·基于类别评估方法流程 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第5章 蛋白质复合体稳定性评估系统的实现 | 第45-52页 |
| ·程序主框架 | 第46页 |
| ·各模块介绍 | 第46页 |
| ·实验数据来源 | 第46-47页 |
| ·实验结果分析 | 第47-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 致谢 | 第58页 |