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盐藻多糖合成关键酶—尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(DsUGD)基因分析及耐盐相关性研究

中文摘要第1-8页
英文摘要第8-10页
前言第10-12页
第一章 盐藻在不同盐浓度胁迫条件下多糖产量的变化第12-19页
 1 材料和方法第12-14页
   ·材料第12-13页
     ·藻种第12页
     ·仪器第12页
     ·试剂第12页
     ·盐藻培养基第12-13页
   ·方法第13-14页
     ·盐藻培养第13页
     ·盐藻的胁迫培养第13页
     ·盐藻多糖的提取第13页
     ·盐藻多糖浓度的测定第13页
     ·标准曲线的建立第13-14页
 2.结果及分析第14-17页
   ·盐藻生长状况测定第14页
   ·多糖测定标准曲线的建立第14-15页
   ·盐藻总多糖变化趋势第15页
   ·盐藻胞外多糖变化趋势第15-16页
   ·盐藻胞内多糖变化趋势第16-17页
 3.讨论第17-19页
   ·苯酚-硫酸法测定多糖浓度的原理及注意要点第17页
   ·高盐胁迫与盐藻多糖之间的关系第17-19页
第二章 盐藻尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(DSUGD)基因序列分析第19-32页
 1 分析方法第19-21页
   ·核苷酸序列分析第19-20页
     ·起始ATG的预测第19页
     ·加A信号位点预测第19页
     ·序列相似性比对第19页
     ·序列ORF(open reading frame finder)读框分析第19-20页
   ·蛋白质序列分析第20-21页
     ·蛋白质性质分析第20页
     ·DsUGD保守区段的分析第20页
     ·蛋白质序列跨膜结构分析及信号肽预测第20页
     ·高级结构(二级和三级结构)预测第20页
     ·蛋白家族分析第20页
     ·系统发育分析第20-21页
 2 结果第21-30页
   ·核酸序列分析第21-25页
     ·起始ATG的预测第21页
     ·加A信号位点预测第21-22页
     ·序列相似性比对第22-24页
     ·序列开放阅读框(ORF)分析第24-25页
   ·蛋白质序列分析第25-30页
     ·蛋白质性质分析第25页
     ·DsUGD Conserved domain(CD)的分析第25页
     ·蛋白质序列跨膜结构及信号肽的预测第25-26页
     ·高级结构预测第26-28页
     ·蛋白家族分析第28-29页
     ·进化树的构建第29-30页
 3 讨论第30-32页
   ·生物信息学分析的方法第30页
   ·DsUGD的结构和功能预测第30-32页
第三章 DSUGD原核表达及蛋白纯化第32-57页
 1.材料和方法第32-47页
   ·材料第32-37页
     ·菌种、藻种第32页
     ·载体第32页
     ·酶制剂第32页
     ·试剂盒第32-33页
     ·培养基:第33页
     ·试剂第33-37页
     ·实验仪器设备第37页
   ·方法第37-44页
     ·盐藻的培养第37页
     ·盐藻总RNA的提取第37-38页
     ·盐藻cDNA的制备第38页
     ·盐藻DsUGD基因的克隆第38-39页
     ·DsUGD测序验证第39-40页
     ·DsUGD大肠杆菌表达载体的构建第40-41页
     ·重组质粒的转化第41-42页
     ·阳性克隆转化子的筛选及验证第42-44页
   ·重组蛋白的表达第44-45页
     ·融合蛋白的诱导表达第44页
     ·融合蛋白可溶性的鉴定第44-45页
     ·融合蛋白的大量表达第45页
   ·SDS—PAGE蛋白质凝胶电泳第45-46页
     ·制胶第45页
     ·样品处理及电泳第45-46页
   ·洗涤包涵体及蛋白纯化第46-47页
 2.结果和分析第47-52页
   ·盐藻总RNA的提取第47页
   ·原核表达工程菌的构建第47-49页
     ·DsUGD基因的克隆第47-48页
     ·DsUGD表达载体的构建第48-49页
   ·DsUGD在大肠杆菌中的表达第49-51页
     ·融合蛋白的诱导表达第49-50页
     ·融合蛋白可溶性的鉴定第50-51页
   ·包涵体的制备及纯化第51-52页
 3.讨论第52-57页
   ·RNA提取中RNase污染的排除第52页
   ·高保真酶使用注意事项第52-53页
   ·重组质粒的构建第53页
   ·SDS-PAGE蛋白质凝胶电泳第53-55页
     ·SDS-PAGE原理第53-54页
     ·SDS-PAGE蛋白质凝胶电泳中的常见问题及解决办法:第54-55页
   ·表达条件的优化第55-56页
     ·表达载体的选择第55页
     ·诱导条件的优化第55-56页
   ·融合蛋白纯化第56-57页
第四章 DSUGD抗体制备及其在盐胁迫下的表达差异分析第57-67页
 1.材料和方法第57-63页
   ·材料第57-59页
     ·动物第57页
     ·藻种第57页
     ·培养基第57页
     ·试剂第57-59页
     ·实验仪器设备第59页
   ·方法第59-63页
     ·多克隆抗体的制备第59-61页
     ·盐藻的胁迫培养第61页
     ·盐藻细胞总蛋白的提取第61-62页
     ·盐藻蛋白质含量测定第62页
     ·Western杂交第62-63页
 2.结果和分析第63-64页
   ·抗体效价的检测第63页
   ·BSA标准曲线的建立第63页
   ·盐藻总蛋白含量的测定第63页
   ·SDS—PAGE蛋白质凝胶电泳第63-64页
   ·Western杂交结果第64页
     ·重组蛋白的Western杂交第64页
     ·高盐处理后盐藻藻体蛋白在表达水平差异第64页
 3.讨论第64-67页
   ·上样量的一致性第64-65页
   ·盐胁迫对DsUGD表达的影响第65-67页
结论第67-68页
参考文献第68-71页
攻读硕士期间发表的论文第71-73页
致谢第73-74页
综述第74-96页

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