| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-21页 |
| ·植物抗病机制 | 第13-14页 |
| ·植物固有内含物及结构对病害的抵抗机制 | 第13页 |
| ·感染后诱导的植物对病害的抵抗机制 | 第13-14页 |
| ·植物免疫系统 | 第14页 |
| ·植物抗病基因特征 | 第14-16页 |
| ·NBS-ENCODING基因的结构域 | 第15页 |
| ·基因组水平NBS-LRR基因分析研究进展 | 第15-16页 |
| ·黄瓜黑星病研究进展 | 第16-17页 |
| ·基因的图位克隆 | 第17-18页 |
| ·基因的精细定位与图位克隆 | 第17页 |
| ·抗病基因的图位克隆进展 | 第17页 |
| ·目前已经克隆到的NBS-encoding抗病基因 | 第17-18页 |
| ·基因表达谱 | 第18-19页 |
| ·表达谱技术 | 第18-19页 |
| ·表达谱的应用 | 第19页 |
| ·本研究的目的意义与技术路线 | 第19-21页 |
| ·研究目的与意义 | 第19-20页 |
| ·技术路线 | 第20-21页 |
| 第二章 黄瓜全基因组水平NBS-ENCODING抗病基因分析 | 第21-32页 |
| ·材料与方法 | 第21-23页 |
| ·试验材料 | 第21页 |
| ·方法 | 第21-23页 |
| ·结果 | 第23-30页 |
| ·黄瓜中NBS-encoding基因概况 | 第23-24页 |
| ·黄瓜9930中NBS-encoding基因在黄瓜七条染色体上的分布 | 第24页 |
| ·NBS-encoding基因的保守结构域分析 | 第24-30页 |
| ·讨论 | 第30-32页 |
| ·黄瓜全基因组NBS-encoding基因存在数目少的显著特点 | 第30页 |
| ·黄瓜NBS-encoding基因结构及其与其它模式植物保守结构域的比较 | 第30-31页 |
| ·三个黄瓜种中R基因的比较 | 第31-32页 |
| 第三章 黄瓜抗黑星病基因的精细定位 | 第32-45页 |
| ·材料与方法 | 第32-35页 |
| ·试验材料 | 第32页 |
| ·试验方法 | 第32-35页 |
| ·结果 | 第35-43页 |
| ·抗黑星病性状遗传分析 | 第35页 |
| ·抗黑星病基因的初步定位 | 第35-36页 |
| ·黄瓜抗黑星病基因精细定位标记的开发 | 第36-37页 |
| ·黄瓜抗黑星病基因的精细定位 | 第37-43页 |
| ·讨论 | 第43-45页 |
| ·黄瓜抗黑星病基因区域 | 第43页 |
| ·精细定位标记开发策略 | 第43-44页 |
| ·黄瓜抗黑星病基因的精细定位 | 第44-45页 |
| 第四章 黄瓜CCU区域的分析与候选基因的图位克隆 | 第45-64页 |
| ·材料与方法 | 第45-47页 |
| ·试验材料 | 第45-46页 |
| ·试验方法 | 第46-47页 |
| ·结果 | 第47-61页 |
| ·黄瓜Ccu区域及三个黄瓜品种9930、Gy14、Hardwikii之间Ccu区域NBS-LRR直系同源基因之间的比较 | 第47-57页 |
| ·黄瓜Ccu基因区域和一个包含抗病基因簇的甜瓜BAC序列具有共线性 | 第57页 |
| ·Ccu区域NBS-encoding抗病基因簇与几个物种中同源抗病基因簇的比较 | 第57-58页 |
| ·黄瓜品种9110gtBAC文库的构建及BAC克隆的筛选 | 第58-60页 |
| ·包含候选Ccu基因的亚克隆文库构建 | 第60-61页 |
| ·讨论 | 第61-64页 |
| ·三个黄瓜种9110gt、gy14、9930中包含Ccu抗病基因簇比较 | 第61-62页 |
| ·黄瓜Ccu基因区域由一个较古老的抗病基因簇进化而来 | 第62页 |
| ·黄瓜9110gt材料BAC文库及亚克隆文库的构建 | 第62-64页 |
| 第五章 黄瓜与黑星菌互作表达谱分析 | 第64-94页 |
| ·材料与方法 | 第64-65页 |
| ·试验材料 | 第64页 |
| ·试验方法 | 第64-65页 |
| ·结果 | 第65-90页 |
| ·RNA测序前质量检测结果 | 第65-67页 |
| ·序列质量评估 | 第67-70页 |
| ·11个样品中差异表达基因的筛选 | 第70-77页 |
| ·差异表达基因的Go分类分析 | 第77-84页 |
| ·差异表达基因代谢途径(KEGG)分类分析：抗病品种Gy14在接种24小时内全面启动了抗病程序，而感病品种未启动抗病程序。 | 第84-90页 |
| ·讨论 | 第90-94页 |
| ·材料的选取及测序的质量 | 第90-91页 |
| ·表达谱设计思路 | 第91页 |
| ·五组样品的Go分类分析 | 第91页 |
| ·通过KEGG分类找到Gy14抗病机制 | 第91-94页 |
| 第六章 全文总结 | 第94-95页 |
| ·对黄瓜全基因组编码NBS-LRR结构抗病基因进行了分析，通过手工注释的方法找出了三个黄瓜种中NBS-LRR直系同源基因之间的差异。 | 第94页 |
| ·精细定位了CCU基因，图位克隆了CCU的候选基因。 | 第94页 |
| ·发现黄瓜CCU区域存在一个紧密连锁的古老的抗病基因簇。 | 第94页 |
| ·黄瓜与黑星病菌的亲和与不亲和互作表达谱研究发现了黄瓜抗黑星病的抗病机制。 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-102页 |
| 附录 | 第102-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
| 作者简历 | 第107页 |
| 个人简历 | 第107页 |
| 博士期间发表文章 | 第107页 |
