| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 引言 | 第10-18页 |
| ·奶牛乳房炎简介 | 第10-12页 |
| ·奶牛乳房炎分类 | 第10页 |
| ·奶牛体细胞数(SCC)和体细胞评分(SCS) | 第10-11页 |
| ·SCC和SCS在奶牛乳房炎抗病育种中的作用 | 第11-12页 |
| ·奶牛乳房炎抗性基因及分子标记 | 第12-14页 |
| ·趋化性细胞因子受体基因CXCR2 | 第12页 |
| ·Toll样受体基因TLR4 | 第12-13页 |
| ·锌指蛋白基因家族之一FEZL | 第13-14页 |
| ·影响奶牛体细胞评分的其他因素 | 第14-15页 |
| ·牛的年龄与胎次 | 第14页 |
| ·泌乳阶段 | 第14-15页 |
| ·季节 | 第15页 |
| ·管理因素 | 第15页 |
| ·营养状况 | 第15页 |
| ·试验中所涉及的分子标记方法 | 第15-16页 |
| ·单核苷酸多态性(Single-Nucleotide Polymorphisms,SNPs) | 第15-16页 |
| ·限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP) | 第16页 |
| ·单链构象多态性(Single-Strand Conformational Polymorphism,SSCP) | 第16页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第16-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-29页 |
| ·试验材料 | 第18-20页 |
| ·试验牛来源及采样方法和数据资料来源: | 第18页 |
| ·主要仪器设备 | 第18-19页 |
| ·主要分析工具软件 | 第19页 |
| ·药品和酶 | 第19页 |
| ·溶液试剂配制 | 第19-20页 |
| ·试验方法 | 第20-26页 |
| ·牛血液DNA的提取 | 第20-21页 |
| ·DNA浓度和纯度的检测 | 第21-22页 |
| ·引物设计 | 第22-23页 |
| ·PCR扩增 | 第23页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第23-24页 |
| ·三个候选基因的多态性筛查方法 | 第24-26页 |
| ·统计分析方法 | 第26-29页 |
| ·基因频率和基因型频率计算 | 第26-27页 |
| ·连锁不平衡(Linkage Disequlibirium,LD)的计算及分析 | 第27页 |
| ·统计分析模型建立 | 第27-29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-39页 |
| ·牛基因组DNA和PCR产物结果 | 第29-30页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第29页 |
| ·PCR产物的扩增结果 | 第29-30页 |
| ·奶牛TLR4、FEZL和CXCR2三个基因多态性筛查结果 | 第30-34页 |
| ·TLR4基因外显子ⅢPCR-RFLP检测结果 | 第30-31页 |
| ·FEZL基因外显子Ⅰ缺失突变筛查结果 | 第31-32页 |
| ·CXCR2基因多态性检测结果 | 第32-34页 |
| ·群体遗传学统计分析结果 | 第34-36页 |
| ·所研究群体各位点基因型频率和等位基因频率分析 | 第34-35页 |
| ·CXCR2基因各位点的连锁不平衡分析 | 第35-36页 |
| ·最小二乘统计分析结果 | 第36-39页 |
| ·不同牛场、胎次和产犊季节对奶牛体细胞评分的影响 | 第36页 |
| ·TLR4外显子ⅢRFLP-Bbvl2Ⅰ酶切位点多态性与奶牛体细胞评分的相关分析 | 第36-37页 |
| ·CXCR2基因SNPs不同基因型与奶牛体细胞评分的相关分析 | 第37页 |
| ·不同因素对奶牛产奶量、乳脂率和乳蛋白率的影响 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-47页 |
| ·奶牛血液样品的采样、保存 | 第39页 |
| ·影响PCR扩增反应的因素 | 第39-40页 |
| ·模板的质量 | 第39页 |
| ·引物的设计、选择和保存 | 第39-40页 |
| ·退火温度 | 第40页 |
| ·扩增产物的GC含量 | 第40页 |
| ·PCR产物的污染及对策 | 第40页 |
| ·关于本试验研究所用的SNPs筛查方法 | 第40-42页 |
| ·PCR-RFLP方法 | 第41页 |
| ·PCR产物直接聚丙烯酰胺凝胶电泳检测缺失突变 | 第41页 |
| ·PCR-SSCP方法 | 第41-42页 |
| ·PCR产物直接测序法 | 第42页 |
| ·关于FEZL基因GCC缺失突变筛查结果 | 第42页 |
| ·TLR4外显子ⅢRFLP-Bbvl2Ⅰ酶切位点多态性与SCS的相关 | 第42-43页 |
| ·CXCR2基因六个SNPs与奶牛体细胞评分的相关 | 第43页 |
| ·最小二乘线性模型对影响奶牛体细胞评分其它因素的分析 | 第43-44页 |
| ·奶牛体细胞数对产奶量的影响 | 第44-45页 |
| ·体细胞数对乳脂率和乳蛋白率的影响 | 第45页 |
| ·最小二乘法对影响产奶量,乳脂率和乳蛋白率因素的分析 | 第45-47页 |
| 5 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 附录 | 第54-57页 |
| 个人简介 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 附件 | 第59-65页 |
