| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-18页 |
| ·植物抗病基因简介 | 第10-15页 |
| ·NBS-LRR | 第13-14页 |
| ·LRR-TM | 第14页 |
| ·STK | 第14页 |
| ·LRR-TM-STK | 第14-15页 |
| ·其他 | 第15页 |
| ·植物抗病基因的进化 | 第15-16页 |
| ·水稻抗病基因的研究进展 | 第16页 |
| ·Pi2/9遗传座位 | 第16-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-28页 |
| ·材料 | 第18-20页 |
| ·所用BAC克隆 | 第18页 |
| ·载体 | 第18页 |
| ·菌种 | 第18-19页 |
| ·主要试剂、酶类和试剂盒 | 第19页 |
| ·主要仪器 | 第19-20页 |
| ·方法 | 第20-28页 |
| ·BAC DNA的小量制备 | 第20页 |
| ·制备好的BAC DNA的酶切 | 第20-21页 |
| ·杂交 | 第21-23页 |
| ·转膜 | 第21页 |
| ·探针标记 | 第21页 |
| ·预杂交 | 第21-22页 |
| ·杂交 | 第22页 |
| ·洗膜 | 第22页 |
| ·信号检测 | 第22-23页 |
| ·BAC DNA的大量抽提 | 第23页 |
| ·BAC测序亚库的构建 | 第23-24页 |
| ·超声打断 | 第23页 |
| ·插入片段的回收与连接 | 第23-24页 |
| ·连接产物的回收与转化 | 第24页 |
| ·亚克隆文库的保存 | 第24页 |
| ·亚克隆DNA的抽提 | 第24-25页 |
| ·测序反应 | 第25-26页 |
| ·测序PCR | 第25-26页 |
| ·测序产物的回收及上样 | 第26页 |
| ·序列组装 | 第26页 |
| ·序列空缺的填补 | 第26页 |
| ·序列分析 | 第26-27页 |
| ·进化树绘制 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-48页 |
| ·Oryza nivara、Oryza rufipogon、Oryza minuta中覆盖Pi2/9遗传座位的BAC克隆的筛选 | 第28-33页 |
| ·BAC末端序列的同源搜索 | 第28-29页 |
| ·候选BAC克隆的鉴定 | 第29-33页 |
| ·BAC克隆的完全酶切 | 第29-30页 |
| ·Southern杂交确定代测BAC克隆中NBS-LRR基因的分布情况 | 第30-31页 |
| ·供试BAC克隆的指纹分析 | 第31-33页 |
| ·OR_BBA0100B19和OM_BA0024C01两个BAC克隆测序亚克隆文库的构建与序列测定 | 第33-40页 |
| ·高纯度BAC DNA的抽提 | 第33-34页 |
| ·BAC DNA的超声打断和末端补平 | 第34页 |
| ·所需片段的回收及连接 | 第34-35页 |
| ·所需亚克隆文库大小的估计 | 第35-37页 |
| ·亚克隆文库测序样品的制备 | 第37-38页 |
| ·序列测定 | 第38页 |
| ·序列组装 | 第38-40页 |
| ·Oryza minuta中Pi2/9遗传座位的延伸 | 第40-43页 |
| ·延伸克隆的同源搜索 | 第40-41页 |
| ·BAC克隆OM_Ba0178G06和OM_Ba0103F07的鉴定 | 第41-43页 |
| ·Southern杂交确定OM_Ba0178G06和OM_Ba0103F07中NBS-LRR基因的分布情况 | 第41页 |
| ·OM_Ba0103F07和OM_Ba0024C01的指纹分析 | 第41页 |
| ·杂交确定OM_Ba0103F07中是否含有NIP基因 | 第41-43页 |
| ·Oryza punctata中覆盖Pi2/9遗传座位的BAC克隆测序缺口的补平 | 第43-45页 |
| ·Oryza punctata、Oryza officinalis、Oryza minuta中Pi2/9遗传座位的初步分析 | 第45-48页 |
| ·遗传座位中包含的NBS-LRR基因的预测 | 第45-46页 |
| ·预测出的NBS-LRR基因及基因类似物的进化分析 | 第46-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| ·水稻BES和EST数据库的应用 | 第48页 |
| ·Shot-gun法测定BAC克隆的序列 | 第48-49页 |
| ·序列的初步分析 | 第49-50页 |
| 5 参考文献 | 第50-53页 |
| 6 附录 | 第53-56页 |
| 7 致谢 | 第56页 |
