| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 缩略词表(ABBREVIATIONS) | 第13-15页 |
| 第一章 问题提出与研究进展 | 第15-33页 |
| ·课题的提出 | 第15-16页 |
| ·前人研究进展 | 第16-32页 |
| ·植物反转录转座子的研究进展 | 第16-25页 |
| ·植物反转录转座子的类型与结构 | 第16-17页 |
| ·反转录转座子的分布特点 | 第17-18页 |
| ·反转录转座子的传递和起源进化 | 第18页 |
| ·反转录转座子的高异质性 | 第18-19页 |
| ·反转录转座子的活性 | 第19页 |
| ·反转录转座子在植物基因组结构和进化中的作用 | 第19-20页 |
| ·反转录转座子分子标记 | 第20-25页 |
| ·植物系统发育与柑橘类果树种质进化的研究进展 | 第25-27页 |
| ·植物系统发育研究 | 第25页 |
| ·柑橘类果树种质的研究进展 | 第25-27页 |
| ·果树芽变及芽变分子机理研究进展 | 第27-32页 |
| ·柑橘芽变的概念及其在果树育种中的地位 | 第27-30页 |
| ·柑橘芽变分子机理研究进展 | 第30-32页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第32-33页 |
| 第二章 柑橘反转录转座子反转录酶基因克隆及逆境胁迫下反转录转座子甲基化分析 | 第33-60页 |
| ·前言 | 第33-34页 |
| ·材料与方法 | 第34-39页 |
| ·柑橘种内种间及相应柑橘属的copia-like反转录转座子的研究 | 第35-37页 |
| ·引物合成、PCR扩增、电泳 | 第35页 |
| ·PCR扩增产物的克隆与测序 | 第35页 |
| ·copia-like反转录转座子的Southern杂交 | 第35-37页 |
| ·copia-like反转录转座子的点杂交分析 | 第37页 |
| ·copia-like反转录转座子序列比较分析、同源性比较及进化树分析 | 第37页 |
| ·逆境条件下柑橘gypsy-like反转录转座子的甲基化研究 | 第37-39页 |
| ·秋水仙素处理默科特橘橙胚性愈伤组织 | 第37页 |
| ·流式细胞仪分析 | 第37页 |
| ·RAPD分析 | 第37-38页 |
| ·RAPD差异片段的回收、克隆与测序 | 第38页 |
| ·gypsy-like反转录转座子的Southern杂交分析及甲基化分析 | 第38页 |
| ·序列分析 | 第38-39页 |
| ·结果与分析 | 第39-54页 |
| ·copia-like反转录转座子的研究 | 第39-48页 |
| ·copia-like反转录转座子的反转录酶序列克隆 | 第39页 |
| ·copia-like反转录转座子的RT序列比较及分类 | 第39-45页 |
| ·copia-like反转录转座子的的拷贝数分析 | 第45-48页 |
| ·逆境条件下柑橘gypsy-like反转录转座子的甲基化变异研究 | 第48-54页 |
| ·流式细胞仪倍性检测 | 第48-49页 |
| ·RAPD分析 | 第49页 |
| ·gypsy-like反转录转座子的Mckre序列分析 | 第49-51页 |
| ·gypsy-like反转录转座子Mckre的Southern杂交分析 | 第51页 |
| ·逆境引起的gypsy-like反转录转座子Mckre甲基化变异 | 第51-54页 |
| ·讨论 | 第54-60页 |
| ·反转录转座子是柑橘基因组的重要组成部分 | 第54-55页 |
| ·柑橘反转录转座子的活性及其对基因组的影响 | 第55-57页 |
| ·柑橘反转录转座子活性的抑制因素 | 第55页 |
| ·柑橘反转录转座子活性的激活因素 | 第55-57页 |
| ·反转录转座子活性调节影响柑橘基因组变化 | 第57页 |
| ·反转录转座子是柑橘变异的重要作用成分 | 第57-58页 |
| ·基于本研究的后续工作 | 第58-60页 |
| 第三章 柑橘IRAP和REMAP标记开发及多态性分析 | 第60-75页 |
| ·前言 | 第60-61页 |
| ·材料与方法 | 第61-64页 |
| ·材料 | 第61-62页 |
| ·DNA提取 | 第62页 |
| ·引物设计 | 第62-63页 |
| ·PCR扩增及产物检测 | 第63-64页 |
| ·数据统计和聚类分析 | 第64页 |
| ·结果与分析 | 第64-69页 |
| ·IRAP和REMAP多态性水平检测 | 第64-67页 |
| ·相似系数和聚类分析 | 第67-69页 |
| ·讨论 | 第69-75页 |
| ·柑橘IRAP和REMAP引物的开发 | 第69-70页 |
| ·IRAP和REMAP与常规分子标记的比较 | 第70-72页 |
| ·与PCR-RFLP及RAPD的比较 | 第70-71页 |
| ·与核基因组SSR及AFLP的比较 | 第71-72页 |
| ·柑橘属中及其近缘属若干重要生物型的起源探讨 | 第72-74页 |
| ·宜昌橙 | 第72页 |
| ·金柑 | 第72页 |
| ·枳和早实枳 | 第72-73页 |
| ·枸橼和柠檬 | 第73页 |
| ·葡萄柚 | 第73页 |
| ·酸橙和甜橙 | 第73-74页 |
| ·运用IRAP和REMAP标记的局限性及应用潜力 | 第74-75页 |
| 第四章 分子标记对柑橘芽变品种间多态性分析 | 第75-90页 |
| ·前言 | 第75页 |
| ·材料和方法 | 第75-83页 |
| ·材料 | 第75-76页 |
| ·DNA的提取 | 第76页 |
| ·RAPD分析 | 第76页 |
| ·SSR分析 | 第76-78页 |
| ·AFLP分析 | 第78-81页 |
| ·SSAP分析 | 第81-82页 |
| ·ISTR分析 | 第82-83页 |
| ·差异片段回收 | 第83页 |
| ·DNA序列分析 | 第83页 |
| ·结果和分析 | 第83-88页 |
| ·几种分子标记的多态性比较 | 第83-84页 |
| ·柑橘芽变品种的遗传多态性分析 | 第84-86页 |
| ·RAPD分析结果 | 第84页 |
| ·SSR分析结果 | 第84-85页 |
| ·ISTR分析结果 | 第85页 |
| ·AFLP分析结果 | 第85页 |
| ·SSAP分析结果 | 第85-86页 |
| ·片段测序结果 | 第86-88页 |
| ·讨论 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-108页 |
| 附录Ⅰ 相似系数 | 第108-109页 |
| 附录Ⅱ 博士期间发表的论文 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
