| 第一章 文献综述 | 第1-33页 |
| 1 虎生活习性 | 第14-15页 |
| 2 虎相关疾病研究 | 第15页 |
| 3 华南虎与东北虎 | 第15-16页 |
| 4 华南虎分布 | 第16-17页 |
| 5 野生华南虎种群数量 | 第17-19页 |
| 6 华南虎保护 | 第19-23页 |
| 7 华南虎其它相关研究 | 第23-30页 |
| ·圈养种群管理 | 第23-28页 |
| ·虎物种特异性鉴定 | 第28-29页 |
| ·虎 SOX基因家族 | 第29页 |
| ·系统进化分析 | 第29-30页 |
| ·其它 | 第30页 |
| 8 华南虎研究和保护展望 | 第30-33页 |
| 第二章 本研究的提出和研究内容 | 第33-38页 |
| 1 研究背景 | 第33-35页 |
| ·圈养华南虎的生存危机 | 第33-34页 |
| ·野生华南虎资源 | 第34-35页 |
| 2 研究方案和研究内容 | 第35-36页 |
| ·应用微卫星标记进行亲子鉴定和种群遗传结构分析 | 第35页 |
| ·应用线粒体标记进行华南虎系统进化和分类研究 | 第35-36页 |
| 3 研究技术路线和研究方法 | 第36-38页 |
| ·全面搜集和整理现存华南虎资料 | 第36-37页 |
| ·建立华南虎样品库 | 第37页 |
| ·应用Dynal磁珠富集技术筛选华南虎微卫星高变异序列 | 第37页 |
| ·借助微卫星标记和线粒体标记进行检测和参数估计 | 第37页 |
| ·综合分析研究 | 第37-38页 |
| 第三章 华南虎基因资源库的建立 | 第38-52页 |
| 1 材料与方法 | 第38-43页 |
| ·药品和器具 | 第38-39页 |
| ·药品试剂 | 第38-39页 |
| ·器材 | 第39页 |
| ·华南虎采样调查内容 | 第39-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-46页 |
| ·华南虎组织样品库建立 | 第43-45页 |
| ·华南虎DNA的提取与保存 | 第45-46页 |
| 3 讨论 | 第46-52页 |
| ·华南虎资源保存的必要性 | 第46-48页 |
| ·华南虎基因资源库建立技术问题 | 第48-52页 |
| ·组织样品库 | 第48-50页 |
| ·基因资源数据库 | 第50-52页 |
| 第四章 华南虎微卫星方法建立和探针设计 | 第52-64页 |
| 1 材料与方法 | 第53-58页 |
| ·材料 | 第53-54页 |
| ·方法 | 第54-58页 |
| ·华南虎基因组 DNA的提取与回收 | 第54-55页 |
| ·用Dynal磁珠富集微卫星片段 | 第55-56页 |
| ·构建富集微卫星小片段插入文库 | 第56-57页 |
| ·微卫星阳性克隆筛选 | 第57-58页 |
| ·微卫星序列鉴定和引物设计 | 第58页 |
| ·微卫星标记的多态性检测 | 第58页 |
| 2 结果 | 第58-60页 |
| ·富集文库筛选 | 第58-59页 |
| ·阳性克隆数 | 第59-60页 |
| ·微卫星 DNA序列分析 | 第60页 |
| ·微卫星引物的多态性 | 第60页 |
| 3 讨论 | 第60-64页 |
| 第五章 华南虎遗传多样性研究 | 第64-85页 |
| 1 材料与方法 | 第64-69页 |
| ·仪器与试剂 | 第64-65页 |
| ·样品采集 | 第65-67页 |
| ·粪便与毛发采集 | 第65页 |
| ·血样采集 | 第65页 |
| ·组织样采集 | 第65页 |
| ·口腔上皮细胞采集 | 第65-67页 |
| ·DNA提取 | 第67-68页 |
| ·PCR扩增 | 第68页 |
| ·统计分析 | 第68-69页 |
| 2 结果与分析 | 第69-82页 |
| ·20 个华南虎多态性微卫星位点的等位基因大小及数量 | 第69-71页 |
| ·20 个华南虎多态性微卫星位点的基因型和等位基因频率 | 第71-80页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验 | 第80-81页 |
| ·基因杂合度 | 第81-82页 |
| ·多态信息含量 | 第82页 |
| ·有效等位基因数 | 第82页 |
| 3 讨论 | 第82-85页 |
| ·华南虎等位基因数量 | 第82-83页 |
| ·华南虎基因杂合度 | 第83-84页 |
| ·华南虎等位基因频率分布 | 第84-85页 |
| 第六章 华南虎亲子鉴定 | 第85-92页 |
| 1 材料与方法 | 第85-87页 |
| ·材料 | 第85页 |
| ·DNA提取 | 第85页 |
| ·PCR反应 | 第85-86页 |
| ·亲子鉴定分析 | 第86-87页 |
| 2 结果与分析 | 第87-88页 |
| ·父亲鉴定排除概率 | 第87-88页 |
| ·父亲鉴定的置信度 | 第88页 |
| 3 讨论 | 第88-92页 |
| 第七章 虎细胞核中线粒体序列(NUMT)的发现及其应用 | 第92-103页 |
| 1 材料与方法 | 第92-95页 |
| ·材料来源和总DNA提取 | 第92-93页 |
| ·线粒体分离 | 第93页 |
| ·线粒体 DNA提取 | 第93-94页 |
| ·PCR扩增 | 第94页 |
| ·产物回收和测序 | 第94页 |
| ·重组质粒的PCR鉴定 | 第94-95页 |
| ·序列分析及进化树构建 | 第95页 |
| 2 结果与分析 | 第95-100页 |
| ·目的序列扩增 | 第95-96页 |
| ·重组克隆鉴定 | 第96页 |
| ·序列分析 | 第96-97页 |
| ·Blast同源搜索 | 第97页 |
| ·系统进化树分析 | 第97-100页 |
| 3 讨论 | 第100-103页 |
| ·似D-loop的核中线粒体序列的发现 | 第100页 |
| ·Numt的应用 | 第100-101页 |
| ·估计 Numt的转移时间 | 第101-103页 |
| 第八章 华南虎、东北虎及孟加拉虎系统进化研究 | 第103-109页 |
| 1 材料与方法 | 第103-104页 |
| ·材料来源和总DNA提取 | 第103-104页 |
| ·PCR扩增 | 第104页 |
| ·产物回收和测序 | 第104页 |
| ·系统进化树 | 第104页 |
| 2 结果与分析 | 第104-107页 |
| ·D-loop | 第104-105页 |
| ·NO5 | 第105-106页 |
| ·系统进化树 | 第106-107页 |
| 3 讨论 | 第107-109页 |
| ·D-loop和 NO5在虎类研究中的适用性 | 第107页 |
| ·华南虎、东北虎与孟加拉虎之间的进化关系 | 第107-109页 |
| 第九章 华南虎种群管理和保护策略研究 | 第109-123页 |
| 1 种群管理 | 第109-118页 |
| ·影响遗传多样性保护的因素 | 第109-111页 |
| ·近交衰退 | 第109页 |
| ·遗传漂变、奠基者与系谱瓶颈 | 第109-110页 |
| ·种群大小和保护时间 | 第110页 |
| ·种群结构 | 第110-111页 |
| ·遗传分析 | 第111-116页 |
| ·莫基者 | 第111页 |
| ·存活个体遗传重要性 | 第111-113页 |
| ·近交系数 | 第113-114页 |
| ·有效种群大小 | 第114-116页 |
| ·种群结构分析 | 第116-118页 |
| ·种群增长率 | 第116页 |
| ·年龄/性别结构 | 第116-117页 |
| ·繁殖率 | 第117-118页 |
| ·种群承载力 | 第118页 |
| 2 圈养华南虎保护策略研究 | 第118-123页 |
| ·系谱管理 | 第119-120页 |
| ·数据收集 | 第119页 |
| ·编制系谱 | 第119-120页 |
| ·亲子鉴定 | 第120页 |
| ·扩张种群规模 | 第120页 |
| ·适当延长世代间隔 | 第120页 |
| ·按照种群结构和亲缘系数安排配对，减少基因丢失 | 第120-122页 |
| ·确定奠基者贡献指标 | 第121页 |
| ·依据奠基者遗传贡献指标提出每只华南虎的繁育指标 | 第121页 |
| ·依据种群年度增长目标提出每只华南虎的配种建议 | 第121页 |
| ·依据配种建议制定配种计划 | 第121-122页 |
| ·充分应用各种繁殖技术 | 第122页 |
| ·统一管理、加强协作 | 第122-123页 |
| 第十章 结论 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-138页 |
| 博士期间进行的研究课题 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-141页 |
