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中国山羊、黄牛线粒体DNA遗传多样性与起源进化

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 动物遗传多样性及其研究方法第13-25页
   ·遗传多样性的概念第13页
   ·我国家养动物遗传多样性研究的重要性和必要性第13-14页
   ·动物遗传多样性研究的原理和方法第14-21页
     ·形态学方法第15页
     ·细胞学方法第15页
     ·同工酶和蛋白质电泳技术第15-16页
     ·DNA多态性分析技术第16-21页
   ·线粒体 DNA在家畜遗传多样性研究中的应用第21-25页
     ·家畜mtDNA的基本特征第21-23页
     ·mtDNA在家畜遗传育种中的应用第23-25页
第二章 山羊的起源与遗传多样性研究概况第25-34页
   ·山羊的起源与中国山羊的种质资源第25-27页
     ·山羊的起源第25-26页
     ·中国山羊的种质资源第26-27页
   ·山羊遗传多样性的研究概况第27-31页
     ·形态学水平的遗传多样性第27页
     ·染色体水平的遗传多样性第27-28页
     ·蛋白质水平的遗传多样性第28-29页
     ·分子遗传学方面的研究第29-31页
   ·线粒体 DNA在山羊遗传多样性及系统进化研究中的应用第31-34页
第三章 中国黄牛的起源及其遗传多样性研究概况第34-47页
   ·中国黄牛的起源与进化第34-36页
   ·中国黄牛的遗传资源简介第36页
   ·中国黄牛遗传多样性研究第36-42页
     ·中国黄牛的形态标记第36-37页
     ·中国黄牛的细胞学标记第37-38页
     ·中国黄牛的蛋白质标记第38-40页
     ·中国黄牛的 DNA标记第40-42页
   ·黄牛的mtDNA多态性研究第42-47页
     ·黄牛的mtDNA RFLP研究第42-44页
     ·黄牛mtDNA的序列多态性研究第44-47页
第四章 DNA序列数据的分析方法第47-62页
   ·引言第47-48页
   ·两序列间核苷酸差异的估计方法第48-53页
     ·P距离第48页
     ·核苷酸替代的数学模型第48页
     ·Jukes-Cantor距离第48-50页
     ·Kimura双参数距离(Kimura’s 2-parameter diatance)第50页
     ·Tamura距离第50-51页
     ·Tajima-Nei距离第51页
     ·Tamura-Nei距离第51页
     ·Γ距离第51-53页
   ·分子系统发生树的构建第53-60页
     ·系统发生树的种类第54-55页
     ·分子系统发生树的构建方法第55-60页
   ·网络法第60-62页
第五章 利用mtDNA研究中国山羊的遗传多样性与起源分化第62-86页
   ·材料与方法第62-66页
     ·样品的采集和 DNA提取第62-63页
     ·基因组 DNA的提取第63-64页
     ·扩增和测序反应的引物设计第64页
     ·mtDNA D-loop序列扩增第64-65页
     ·PCR产物的回收和纯化第65-66页
     ·mtDNA D-loop序列测定第66页
   ·数据处理第66-67页
     ·序列编辑(sequence edit)第66页
     ·序列比对(sequence alignment )第66页
     ·MEGA2.0软件的应用第66页
     ·Alrequin 2.0软件的应用第66-67页
     ·网络分析第67页
   ·中国家山羊mtDNAD-loop的遗传多样性第67-75页
     ·测序结果第67页
     ·山羊线粒体 DNA控制区序列变异第67-75页
   ·中国家山羊单倍型间的系统发育分析第75-77页
     ·二叉树第75页
     ·支系间的网络结构第75-77页
   ·中国家山羊品种间的亲缘关系分析第77-81页
   ·群体扩张第81-82页
   ·讨论第82-86页
     ·中国山羊的遗传多样性第82-83页
     ·中国山羊的母系起源第83页
     ·支系 B的中国起源探讨第83-86页
第六章 贵州黄牛mtDNA遗传多样性研究第86-102页
   ·材料与方法第87-89页
     ·样品采集和 DNA提取第87页
     ·线粒体 DNA控制区全序列的扩增、纯化和序列测定第87-89页
     ·数据处理第89页
   ·结果与分析第89-101页
     ·PCR片段扩增图第89-90页
     ·序列特征与多态性第90-92页
     ·单倍型的系统发育关系第92-95页
     ·贵州黄牛群体的遗传结构分析第95-98页
     ·贵州黄牛的起源与进化分析第98-101页
   ·讨论第101-102页
     ·贵州黄牛的起源第101页
     ·mtDNA核苷酸多样度与黄牛群体遗传分化的关系第101-102页
第七章 利用 GenBank资源研究中国黄牛的起源与进化第102-122页
   ·材料与方法第102-104页
     ·实验样品的来源第103页
     ·数据处理第103-104页
   ·中国黄牛系统发育分析第104-118页
     ·中国黄牛线粒体 DNAD-loop区的单倍型分析第104-118页
     ·中国黄牛mtDNA遗传多样性第118页
   ·讨论第118-122页
     ·关于中国黄牛的血统类型第118-120页
     ·瘤牛的系统发生分析第120页
     ·关于中国黄牛中普通牛血统的起源第120-122页
第八章 结论第122-123页
致谢第123-124页
参考文献第124-136页
作者简介第136页

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