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松杉灵芝漆酶基因的克隆及其qRT-PCR分析

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
前言第13-27页
 1 松杉灵芝概述第13-14页
   ·松杉灵芝简介第13页
   ·松杉灵芝的生物学特性第13-14页
     ·形态特征第13页
     ·生长特性第13-14页
 2 漆酶概述第14-18页
   ·漆酶简介第14-15页
   ·漆酶在食用菌中的生物功能第15-16页
   ·漆酶基因克隆第16-17页
   ·TAIL-PCR第17-18页
 3 qRT-PCR第18-25页
   ·原理第19-20页
   ·检测模式第20-21页
     ·SYBR Green I 检测模式第20页
     ·TaqMan 探针检测模式第20-21页
   ·定量方法第21-22页
     ·绝对定量第21页
     ·相对定量第21-22页
   ·qRT-PCR 试验结果的影响因素第22-25页
     ·RNA 的纯度和完整性第22页
     ·基因组 DNA 污染第22-23页
     ·反转录效率第23页
     ·PCR 扩增第23页
     ·内参基因的选择第23-25页
   ·qRT-PCR 应用第25页
 4 本课题研究的目的和意义第25-27页
第一章 松杉灵芝漆酶基因的克隆第27-53页
 1 材料与方法第27-37页
   ·材料第27-29页
     ·供试菌株第27页
     ·培养基第27页
     ·试剂第27-29页
     ·仪器第29页
   ·方法第29-37页
     ·供试菌株的活化及菌丝收集第29-30页
     ·松杉灵芝基因组 DNA 的提取第30-31页
     ·松杉灵芝 RNA 的提取第31页
     ·漆酶基因的 PCR 扩增第31-36页
     ·胶回收目的片段第36页
     ·胶回收片段与 T-载体的连接第36页
     ·质粒的转化第36-37页
     ·阳性克隆的筛选第37页
     ·质粒提取第37页
     ·测序第37页
 2 结果与分析第37-51页
   ·松杉灵芝基因组 DNA 的提取第37-38页
   ·松杉灵芝 RNA 的提取第38页
   ·松杉灵芝漆酶基因部分序列的获得第38-43页
     ·简并 PCR第38-39页
     ·扩增片段的胶回收纯化第39页
     ·阳性克隆的筛选第39-40页
     ·阳性克隆的测序第40-43页
   ·松杉灵芝漆酶基因 5'端和 3'端侧翼序列的获得第43-48页
     ·松杉灵芝漆酶基因 5'端侧翼序列的扩增第43-44页
     ·松杉灵芝漆酶基因 3'端侧翼序列的扩增第44页
     ·扩增片段的胶回收纯化第44-45页
     ·阳性克隆的筛选第45-46页
     ·阳性克隆的测序第46-48页
   ·松杉灵芝漆酶基因组 DNA 全序列的获得第48页
   ·松杉灵芝漆酶 cDNA 序列的获得第48-50页
     ·松杉灵芝漆酶 cDNA 序列的扩增第48页
     ·阳性克隆的筛选第48-49页
     ·阳性克隆的测序第49-50页
   ·松杉灵芝漆酶基因的序列分析第50-51页
 3 小结与讨论第51-53页
第二章 松杉灵芝实时荧光定量 PCR 内参基因的筛选第53-71页
 1 材料与方法第53-58页
   ·材料第53-55页
     ·供试菌株第53页
     ·培养基第53-54页
     ·试剂第54页
     ·仪器第54-55页
   ·方法第55-58页
     ·供试菌株的活化及菌丝收集第55页
     ·松杉灵芝 RNA 的提取第55页
     ·内参基因引物的设计和合成第55-56页
     ·cDNA 第一链合成第56页
     ·各内参基因的普通 PCR 扩增第56页
     ·各内参基因的 qRT-PCR 扩增第56-57页
     ·胶回收目的片段第57页
     ·胶回收片段与 T-载体的连接第57页
     ·质粒的转化第57页
     ·阳性克隆的筛选第57页
     ·质粒提取第57页
     ·测序第57-58页
 2 结果与分析第58-69页
   ·松杉灵芝 RNA 的提取第58-59页
   ·内参基因引物特异性分析第59-62页
     ·内参基因片段的普通 PCR 扩增第59-60页
     ·内参基因片段的测序第60-61页
     ·融解曲线第61-62页
   ·内参基因的 qRT-PCR 分析第62-69页
     ·内参基因标准曲线的制备第62-67页
     ·内参基因的选择第67-69页
 3 小结与讨论第69-71页
第三章 qRT-PCR 分析松杉灵芝漆酶基因的表达水平第71-81页
 1 材料与方法第71-74页
   ·材料第71-72页
     ·供试菌株第71页
     ·培养基第71页
     ·试剂第71-72页
     ·仪器第72页
   ·方法第72-74页
     ·供试菌株的活化及菌丝的培养第72页
     ·ABTS 法测定漆酶酶活第72-73页
     ·松杉灵芝 RNA 的提取第73页
     ·目的基因引物的设计和合成第73页
     ·cDNA 第一链合成第73页
     ·目的基因的普通 PCR 扩增第73页
     ·目的基因的 qRT-PCR 扩增第73-74页
     ·胶回收目的片段第74页
     ·胶回收片段与 T-载体的连接第74页
     ·质粒的转化第74页
     ·阳性克隆的筛选第74页
     ·质粒提取第74页
     ·测序第74页
 2 结果与分析第74-79页
   ·ABTS 法测定漆酶酶活第74-75页
   ·目的基因引物的特异性分析第75-77页
     ·目的基因片段的普通 PCR 扩增第75页
     ·目的基因片段的测序第75-76页
     ·融解曲线第76-77页
   ·目的基因表达的 qRT-PCR 分析第77-79页
     ·目的基因标准曲线的制备第77-78页
     ·目的基因在不同营养培养条件中的转录水平分析第78-79页
 3 小结与讨论第79-81页
参考文献第81-87页
致谢第87页

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