| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-12页 |
| 一、论文的研究背景和立题依据及意义 | 第9-10页 |
| 二、本论文的研究内容 | 第10页 |
| 三、研究方法和技术路线 | 第10-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-32页 |
| 一、 干细胞特性 | 第12-18页 |
| (一) 胚胎干细胞概况 | 第12-15页 |
| (二) 间充质干细胞概况 | 第15-18页 |
| 二、真核生物染色质的结构和染色质重塑 | 第18-26页 |
| (一) 染色质重塑与转录调控 | 第18-19页 |
| (二) 蛋白密码假说 | 第19-24页 |
| (三) DNA甲基化、组蛋白去乙酰化、H3 K9甲基化间相互关系与基因沉默 | 第24-26页 |
| 三、基因芯片技术 | 第26-32页 |
| (一) 基因芯片的原理 | 第26页 |
| (二) 基因芯片的技术支持 | 第26-28页 |
| (三) 基因芯片的分类 | 第28-32页 |
| 第二部分 实验材料与方法 | 第32-44页 |
| 一、实验材料 | 第32页 |
| (一) 细胞培养及其培养试剂 | 第32页 |
| (二) RT-PCR 相关试剂 | 第32页 |
| (三) 染色质免疫沉淀相关试剂 | 第32页 |
| (四) 芯片及杂交相关试剂 | 第32页 |
| (五) 实验设备及仪器 | 第32页 |
| 二、实验方法 | 第32-44页 |
| (一) 人间充质干细胞培养及成骨分化诱导鉴定 | 第32-33页 |
| (二) Real-time RT PCR检测 | 第33-35页 |
| (三) 细胞核蛋白的提取 | 第35-36页 |
| (四) SDS-PAGE电泳和Western Blotting | 第36-38页 |
| (五) 免疫荧光分析 | 第38页 |
| (六) 染色质免疫沉淀实验 | 第38-40页 |
| (七) 基因表达谱芯片杂交及归一化 | 第40-42页 |
| (八) ChIP on chip芯片杂交及归一化 | 第42-43页 |
| (九) 生物信息学相关分析 | 第43-44页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第44-63页 |
| 一、人骨髓来源MSCs组蛋白H3-Lys9 表观修饰和基因表达状态在基因组水平研究 | 第44-49页 |
| (一) 人骨髓MSCs的分离、鉴定 | 第44页 |
| (二) 在人骨髓MSCs中，ChIP on chip数据的获得及归一化分析 | 第44-46页 |
| (三) 在人骨髓MSCs中，基因表达谱芯片数据的获得及其与ChIP on chip所得数据的相关性分析 | 第46-49页 |
| 二、人骨髓MSCs成骨分化过程中，组蛋白H3-Lys9 表观修饰和基因表达状态在基因组水平研究 | 第49-63页 |
| (一) 人骨髓MSCs的成骨诱导分化 | 第49-50页 |
| (二) 在MSCs成骨分化过程中组蛋白H3-Lys9整体乙酰化下降，而整体二甲基化水平上升 | 第50-51页 |
| (三) MSCs 成骨分化过程，基因芯片数据的获得，整理及相关生物学功能分析 | 第51-63页 |
| 第四部分 讨论 | 第63-67页 |
| 一、 间充质干细胞成骨分化体系和启动子芯片的选择 | 第63页 |
| 二、基因启动子区H3-Lys9 乙酰化和二甲基化所控制的基因的激活与抑制，对于维持人骨髓MSCs的自我更新和增殖状态至关重要 | 第63-64页 |
| 三、 间充质干细胞成骨分化过程可能伴随着异染色质形成 | 第64页 |
| 四、在MSCs成骨分化过程，VDR参与组蛋白H3K9位赖氨酸的去乙酰化和二甲基化过程 | 第64-65页 |
| 五、只有少量基因mRNA变化与其启动子区域组蛋白H3K9位赖氨酸乙酰化和二甲基化变化相关 | 第65页 |
| 六、在MSCs成骨分化过程，组蛋白H3K9位赖氨酸修饰调控的基因可能参与许多重要的细胞分化相关生物学事件 | 第65-67页 |
| 主要结论 | 第67-68页 |
| 主要创新点 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第80页 |
