摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-14页 |
第一章 文献综述 | 第14-31页 |
·金属硫化矿的生物浸出 | 第14-15页 |
·元素硫的化学特性与生物浸出的关联性 | 第15-16页 |
·嗜酸硫氧化细菌系统多样性 | 第16-20页 |
·嗜酸硫氧化细菌对元素硫的生物化学氧化 | 第20-28页 |
·硫的化学形态 | 第20-21页 |
·嗜酸硫氧化细菌硫氧化系统的特点 | 第21-28页 |
·本论文的研究目的和意义 | 第28-30页 |
·本论文的主要研究内容 | 第30页 |
·论文课题来源 | 第30-31页 |
第二章 典型阴离子对嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化表观活性的影响 | 第31-38页 |
·引言 | 第31页 |
·材料和方法 | 第31-32页 |
·菌株、培养基和培养条件 | 第31-32页 |
·细菌在不同浓度阴离子溶液中生长行为的观察 | 第32页 |
·A.ferrooxidans细胞总蛋白质的提取及双向电泳展示 | 第32页 |
·结果与讨论 | 第32-37页 |
·不同浓度NO_3~-对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响 | 第32-33页 |
·不同浓度Cl~-对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响 | 第33-34页 |
·不同浓度SO_4~(2-)对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响 | 第34页 |
·不同浓度PO_4~(3-)对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响 | 第34-35页 |
·高浓度PO_4~(3-)胁迫下A.ferrooxidans细胞总蛋白表达差异谱展示 | 第35-37页 |
·本章小结 | 第37-38页 |
第三章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌适应元素硫基质的细胞表面特性变化 | 第38-48页 |
·引言 | 第38页 |
·材料和方法 | 第38-40页 |
·菌株、培养基和培养条件 | 第38-39页 |
·硫的预处理 | 第39页 |
·细菌在元素硫和硫代硫酸盐生长基质中生长行为的观察 | 第39页 |
·硫粒和细菌表面亲疏水性测定 | 第39页 |
·元素硫和细菌表面的傅里叶红外(FT-IR)光谱测定 | 第39-40页 |
·结果与讨论 | 第40-47页 |
·A.ferrooxidans在S~0和S_2O_3~(2-)生长基质中的生长曲线 | 第40页 |
·硫粒与细菌相互作用前后的亲疏水性差异分析 | 第40-42页 |
·在S~0和S_2O_3~(2-)中生长的细菌形态差异 | 第42-43页 |
·硫粒与细菌相互作用的显微镜检分析 | 第43-45页 |
·FT-IR光谱分析硫粒与细菌相互作用前后表面成分变化 | 第45-47页 |
·本章小结 | 第47-48页 |
第四章 硫基质中嗜酸氧化亚铁硫杆菌特化空间蛋白质的分离与展示 | 第48-58页 |
·引言 | 第48页 |
·材料与方法 | 第48-52页 |
·菌株、培养基和培养条件 | 第48-49页 |
·A.ferrooxidans特化空间蛋白质的提取与分离 | 第49-50页 |
·蛋白质双向电泳操作 | 第50-52页 |
·结果与讨论 | 第52-56页 |
·A.ferrooxidans胞外蛋白质电泳展示 | 第52-53页 |
·A.ferrooxidans细胞周质空间蛋白质电泳展示 | 第53-56页 |
·本章小结 | 第56-58页 |
第五章 硫基质中嗜酸氧化亚铁硫杆菌胞外高表达蛋白质组的初步研究 | 第58-76页 |
·引言 | 第58页 |
·材料与方法 | 第58-61页 |
·菌株、培养基和培养条件 | 第58页 |
·胞外蛋白质表达差异实验的技术流程 | 第58-59页 |
·不同能源基质生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的提取 | 第59页 |
·A.ferrooxidans胞外蛋白质的傅里叶红外光谱测定 | 第59页 |
·不同能源基质中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质差异展示 | 第59页 |
·胶内酶解与质谱分析 | 第59-60页 |
·数据库检索鉴定蛋白质 | 第60-61页 |
·结果与讨论 | 第61-75页 |
·在S~0、S_2O_3~(2-)和Fe~(2+)中生长的A.ferrooxidans细胞FT-IR光谱分析 | 第61-62页 |
·在S~0、S_2O_3~(2-)和Fe~(2+)中生长的A.ferrooxidans胞外物质FT-IR分析 | 第62-63页 |
·在Fe~(2+)和S~0中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的电泳展示 | 第63-65页 |
·MALDI-TOF/TOF分析及数据库查询 | 第65-70页 |
·在元素硫基质中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的分类与分析 | 第70-75页 |
·本章小结 | 第75-76页 |
第六章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌元素硫活化/氧化相关谷胱苷肽还原酶的表达与纯化及特征分析 | 第76-87页 |
·引言 | 第76-77页 |
·材料与方法 | 第77-81页 |
·菌株与生长条件 | 第77页 |
·主要试剂及配制 | 第77-78页 |
·DNA提取 | 第78-79页 |
·引物和PCR扩增 | 第79页 |
·表达载体的构建和SDS-PAGE检测 | 第79-80页 |
·GR蛋白质的纯化 | 第80页 |
·重组谷胱苷肽还原酶的分析 | 第80-81页 |
·结果与讨论 | 第81-86页 |
·A.ferrooxidans中gr基因的克隆与表达载体的构建 | 第81-82页 |
·表达产物的SDS-PAGE | 第82页 |
·重组GR融合蛋白质的活性检测 | 第82-83页 |
·GR序列分析 | 第83-86页 |
·本章小结 | 第86-87页 |
第七章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌元素硫活化/氧化相关二硫键形成蛋白的表达与纯化及特征分析 | 第87-100页 |
·引言 | 第87-88页 |
·材料和方法 | 第88-93页 |
·菌株与培养基 | 第88页 |
·主要试剂及配制 | 第88页 |
·DNA提取与质粒提取 | 第88-89页 |
·引物和PCR扩增 | 第89-90页 |
·表达载体的构建和SDS-PAGE检测 | 第90页 |
·构建带有点突变位点的重组质粒 | 第90-92页 |
·蛋白质的纯化 | 第92页 |
·二硫键异构酶活性测试 | 第92页 |
·DsbG蛋白质的分子建模 | 第92-93页 |
·结果与讨论 | 第93-98页 |
·dsbG基因的克隆与表达载体构建 | 第93页 |
·重组DsbG融合蛋白质以及突变DsbG融合蛋白质的纯化 | 第93-95页 |
·DsbG二硫键异构酶活性测定 | 第95-98页 |
·DsbG蛋白的结构模型 | 第98页 |
·本章小节 | 第98-100页 |
第八章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化相关doxDA操纵子的鉴定与分析 | 第100-108页 |
·引言 | 第100页 |
·材料和方法 | 第100-102页 |
·菌株、培养基和培养条件 | 第100页 |
·细菌DNA和RNA提取以及cDNA合成 | 第100-101页 |
·引物设计与PCR反应 | 第101-102页 |
·序列分析 | 第102页 |
·结果 | 第102-106页 |
·doxDA-1和doxDA-2操纵子中开放阅读框的生物信息学分析 | 第102-104页 |
·doxDA-1和doxDA-2操纵子中开放阅读框的共转录分析 | 第104页 |
·doxDA-1和doxDA-2操纵子中启动子序列分析 | 第104-106页 |
·讨论 | 第106-107页 |
·小结 | 第107-108页 |
第九章 全文结论 | 第108-110页 |
参考文献 | 第110-121页 |
致谢 | 第121-122页 |
攻读学位期间主要的研究成果 | 第122-123页 |