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嗜酸氧化亚铁硫杆菌适应与活化元素硫的分子机制研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-14页
第一章 文献综述第14-31页
   ·金属硫化矿的生物浸出第14-15页
   ·元素硫的化学特性与生物浸出的关联性第15-16页
   ·嗜酸硫氧化细菌系统多样性第16-20页
   ·嗜酸硫氧化细菌对元素硫的生物化学氧化第20-28页
     ·硫的化学形态第20-21页
     ·嗜酸硫氧化细菌硫氧化系统的特点第21-28页
   ·本论文的研究目的和意义第28-30页
   ·本论文的主要研究内容第30页
   ·论文课题来源第30-31页
第二章 典型阴离子对嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化表观活性的影响第31-38页
   ·引言第31页
   ·材料和方法第31-32页
     ·菌株、培养基和培养条件第31-32页
     ·细菌在不同浓度阴离子溶液中生长行为的观察第32页
     ·A.ferrooxidans细胞总蛋白质的提取及双向电泳展示第32页
   ·结果与讨论第32-37页
     ·不同浓度NO_3~-对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响第32-33页
     ·不同浓度Cl~-对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响第33-34页
     ·不同浓度SO_4~(2-)对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响第34页
     ·不同浓度PO_4~(3-)对A.ferrooxidans生长和硫氧化的影响第34-35页
     ·高浓度PO_4~(3-)胁迫下A.ferrooxidans细胞总蛋白表达差异谱展示第35-37页
   ·本章小结第37-38页
第三章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌适应元素硫基质的细胞表面特性变化第38-48页
   ·引言第38页
   ·材料和方法第38-40页
     ·菌株、培养基和培养条件第38-39页
     ·硫的预处理第39页
     ·细菌在元素硫和硫代硫酸盐生长基质中生长行为的观察第39页
     ·硫粒和细菌表面亲疏水性测定第39页
     ·元素硫和细菌表面的傅里叶红外(FT-IR)光谱测定第39-40页
   ·结果与讨论第40-47页
     ·A.ferrooxidans在S~0和S_2O_3~(2-)生长基质中的生长曲线第40页
     ·硫粒与细菌相互作用前后的亲疏水性差异分析第40-42页
     ·在S~0和S_2O_3~(2-)中生长的细菌形态差异第42-43页
     ·硫粒与细菌相互作用的显微镜检分析第43-45页
     ·FT-IR光谱分析硫粒与细菌相互作用前后表面成分变化第45-47页
   ·本章小结第47-48页
第四章 硫基质中嗜酸氧化亚铁硫杆菌特化空间蛋白质的分离与展示第48-58页
   ·引言第48页
   ·材料与方法第48-52页
     ·菌株、培养基和培养条件第48-49页
     ·A.ferrooxidans特化空间蛋白质的提取与分离第49-50页
     ·蛋白质双向电泳操作第50-52页
   ·结果与讨论第52-56页
     ·A.ferrooxidans胞外蛋白质电泳展示第52-53页
     ·A.ferrooxidans细胞周质空间蛋白质电泳展示第53-56页
   ·本章小结第56-58页
第五章 硫基质中嗜酸氧化亚铁硫杆菌胞外高表达蛋白质组的初步研究第58-76页
   ·引言第58页
   ·材料与方法第58-61页
     ·菌株、培养基和培养条件第58页
     ·胞外蛋白质表达差异实验的技术流程第58-59页
     ·不同能源基质生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的提取第59页
     ·A.ferrooxidans胞外蛋白质的傅里叶红外光谱测定第59页
     ·不同能源基质中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质差异展示第59页
     ·胶内酶解与质谱分析第59-60页
     ·数据库检索鉴定蛋白质第60-61页
   ·结果与讨论第61-75页
     ·在S~0、S_2O_3~(2-)和Fe~(2+)中生长的A.ferrooxidans细胞FT-IR光谱分析第61-62页
     ·在S~0、S_2O_3~(2-)和Fe~(2+)中生长的A.ferrooxidans胞外物质FT-IR分析第62-63页
     ·在Fe~(2+)和S~0中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的电泳展示第63-65页
     ·MALDI-TOF/TOF分析及数据库查询第65-70页
     ·在元素硫基质中生长的A.ferrooxidans胞外蛋白质的分类与分析第70-75页
   ·本章小结第75-76页
第六章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌元素硫活化/氧化相关谷胱苷肽还原酶的表达与纯化及特征分析第76-87页
   ·引言第76-77页
   ·材料与方法第77-81页
     ·菌株与生长条件第77页
     ·主要试剂及配制第77-78页
     ·DNA提取第78-79页
     ·引物和PCR扩增第79页
     ·表达载体的构建和SDS-PAGE检测第79-80页
     ·GR蛋白质的纯化第80页
     ·重组谷胱苷肽还原酶的分析第80-81页
   ·结果与讨论第81-86页
     ·A.ferrooxidans中gr基因的克隆与表达载体的构建第81-82页
     ·表达产物的SDS-PAGE第82页
     ·重组GR融合蛋白质的活性检测第82-83页
     ·GR序列分析第83-86页
   ·本章小结第86-87页
第七章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌元素硫活化/氧化相关二硫键形成蛋白的表达与纯化及特征分析第87-100页
   ·引言第87-88页
   ·材料和方法第88-93页
     ·菌株与培养基第88页
     ·主要试剂及配制第88页
     ·DNA提取与质粒提取第88-89页
     ·引物和PCR扩增第89-90页
     ·表达载体的构建和SDS-PAGE检测第90页
     ·构建带有点突变位点的重组质粒第90-92页
     ·蛋白质的纯化第92页
     ·二硫键异构酶活性测试第92页
     ·DsbG蛋白质的分子建模第92-93页
   ·结果与讨论第93-98页
     ·dsbG基因的克隆与表达载体构建第93页
     ·重组DsbG融合蛋白质以及突变DsbG融合蛋白质的纯化第93-95页
     ·DsbG二硫键异构酶活性测定第95-98页
     ·DsbG蛋白的结构模型第98页
   ·本章小节第98-100页
第八章 嗜酸氧化亚铁硫杆菌硫氧化相关doxDA操纵子的鉴定与分析第100-108页
   ·引言第100页
   ·材料和方法第100-102页
     ·菌株、培养基和培养条件第100页
     ·细菌DNA和RNA提取以及cDNA合成第100-101页
     ·引物设计与PCR反应第101-102页
     ·序列分析第102页
   ·结果第102-106页
     ·doxDA-1和doxDA-2操纵子中开放阅读框的生物信息学分析第102-104页
     ·doxDA-1和doxDA-2操纵子中开放阅读框的共转录分析第104页
     ·doxDA-1和doxDA-2操纵子中启动子序列分析第104-106页
   ·讨论第106-107页
   ·小结第107-108页
第九章 全文结论第108-110页
参考文献第110-121页
致谢第121-122页
攻读学位期间主要的研究成果第122-123页

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