| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·前言 | 第8页 |
| ·DNA 分类算法现状及评价 | 第8-11页 |
| ·统计方法 | 第9页 |
| ·神经网络方法 | 第9-10页 |
| ·其他方法 | 第10页 |
| ·对以上算法的分析评价 | 第10-11页 |
| ·本文的核心思想与内容组织 | 第11-12页 |
| 第二章 多序列比对软件简介 | 第12-21页 |
| ·多序列比对的概念 | 第12-13页 |
| ·序列综合分析类生物软件 | 第13-18页 |
| ·clustal | 第13-15页 |
| ·TreeView | 第15页 |
| ·MEGA | 第15-16页 |
| ·Jalview | 第16-17页 |
| ·Jellyfish | 第17-18页 |
| ·DNA 序列分析的数学软件 | 第18-20页 |
| ·DNA 序列的直观工具--Z 曲线 | 第18-19页 |
| ·Matlab 的生物信息工具箱 | 第19-20页 |
| ·小结 | 第20-21页 |
| 第三章 DNA 分类中的多序列比对 | 第21-34页 |
| ·从DNA 进化树的角度分析 | 第21-23页 |
| ·从氨基酸角度分析 | 第23-28页 |
| ·从氨基酸的进化树分析 | 第23-24页 |
| ·从氨基酸的极性分类分析 | 第24-25页 |
| ·从氨基酸的自定义分类分析 | 第25-27页 |
| ·存在问题 | 第27-28页 |
| ·从Z 曲线角度分析 | 第28-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第四章 分类遗传算法简介 | 第34-40页 |
| ·分类的概念和标准 | 第34页 |
| ·基本遗传算法 | 第34-37页 |
| ·分类遗传算法 | 第37-39页 |
| ·小结 | 第39-40页 |
| 第五章 DNA 分类中的遗传算法 | 第40-46页 |
| ·实验系统设计的目的 | 第40页 |
| ·基于基本遗传算法的分类系统 | 第40-41页 |
| ·基于基本遗传算法的分类算法实验结果分析 | 第41-42页 |
| ·基于优化遗传算法的分类系统 | 第42-43页 |
| ·基于优化遗传算法的分类算法实验结果分析 | 第43-45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 第六章 总结 | 第46-48页 |
| ·本文的主要工作 | 第46页 |
| ·进一步的研究方向 | 第46-47页 |
| ·结束语 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-52页 |
| 附录A 40 个人工序列和182 个自然数据 | 第52-55页 |
| 附录B 遗传密码子表 | 第55-56页 |
| 附录C A 类 B 类的 Z 曲线画图的 Matlab 程序 | 第56-59页 |
| 附录D 遗传算法的核心代码 | 第59-63页 |
| 个人简历 在读期间发表的学术论文 | 第63页 |