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鸡FATP1/FATP4基因的克隆、表达及其与屠体性状的关联分析

中文文摘第1-12页
Abstract第12-16页
Chapter one Introduction第16-39页
   ·Transport of fatty acid第16-19页
     ·LCFA uptake into heart and skeletal muscle第16-18页
     ·LCFA uptake in health and disease第18-19页
   ·FATPs family第19-30页
     ·FATP1第20-24页
     ·FATP4第24-25页
     ·Other members of FATP family第25-27页
     ·Regulation of FATP expression第27-28页
     ·Mechanism of FATP action第28-30页
   ·Real-time PCR第30-35页
     ·Principle of real-time PCR process第30-31页
     ·Advantage and limitation of real-time PCR第31-33页
     ·Fields of real-time PCR application第33-35页
     ·Future development of real-time PCR第35页
   ·Gene polymorphism第35-38页
     ·Single nucleotide polymorphism(SNP)第36-37页
     ·Methods for SNP analysis第37-38页
   ·The purpose and meaning of the study第38-39页
Chapter Two Molecular cloning and character of chicken FATP4 gene第39-60页
   ·Introduction第39-40页
   ·Material and methods第40-45页
     ·RNA extraction第40页
     ·RNA integrity and purity第40页
     ·Reverse Transcription(RT)第40-41页
     ·Primer design and PCR amplification第41-42页
     ·PCR product purification第42-43页
     ·Cloning of FATP4 gene第43-45页
     ·Sequence analysis第45页
   ·Results第45-57页
     ·Data extraction of cDNA sequence and nucleotide sequence analysis第45-47页
     ·Analysis of the homologies for nucleotide sequences and animo acid sequences第47-51页
     ·Character of the chicken FATP4gene第51-52页
     ·Analysis of FATP4 signal peptide第52-53页
     ·Analysis of transmembrane domain of chicken FATP4第53-54页
     ·Analysis of glyeosylation site第54-55页
     ·Analysis of phosphorylation第55页
     ·Analysis of hydrophobicity第55-56页
     ·Predict the second structure of chicken FATP4 protein第56-57页
     ·Phylogenetic tree constructed from FATP4第57页
   ·Discussion第57-60页
Chapter three Expression of FATP4 in chickens by quantitative RT-PCR第60-77页
   ·Introduction第60-61页
   ·Material and Methods第61-63页
     ·Animals and tissue collection第61页
     ·RNA extraction and purification第61页
     ·Primer design第61-62页
     ·First strand cDNA synthesis第62页
     ·Quantitative RT-PCR第62-63页
     ·Statistical analysis第63页
   ·Results第63-73页
     ·Quality of RNA and PCR detection第63-64页
     ·Standard curves and melting curves of FATP4 and house-keeping gene第64-65页
     ·The expression of FATP1 and FATP4 in different breeds第65-66页
     ·Expression of FATP1 and FATP4 in different tissues at the same time第66-70页
     ·Ontogenic expression of chicken FATP1 and FATP4第70-73页
     ·The ration of relative quantity of FATP1 gene to relative quantity of FATP4 gene at different growth points第73页
   ·Discussion第73-77页
Chapter four Association of SNP in FATP1 gene with carcass traits and abdominal fat第77-118页
   ·Introduction第77页
   ·Material and Methods第77-82页
     ·Sample collection第77-78页
     ·Phenotyping for Carcass Traits第78页
     ·DNA extraction第78-79页
     ·DNA yield and Purity第79页
     ·Primer design and amplification by PCR第79-80页
     ·PCR-SSCP第80-81页
     ·Gene sequencing第81页
     ·Statistical analysis第81-82页
   ·Results第82-114页
     ·SNP detection in FATP1 gene第82-85页
     ·Genotype and allele frequencies in chicken populations of 70d and 91d第85-89页
     ·Comparison of carcass traits among different genotypes of 70d and 91d第89-92页
     ·Construction of haplotypes and their associations with chicken carcass traits of 70d and 91d第92-97页
     ·Frequencies of genotypes and alleles of all chicken第97-100页
     ·Association of SNPs in FATP1 gene with carcass traits among different breeds第100-107页
     ·Association between genotypes and carcass traits of all chicken第107-109页
     ·Construction of haplotypes and their frequencies in all population第109-110页
     ·Association of the haplotypes with carcass traits in all chicken population第110-114页
   ·Discussion第114-118页
     ·FATP1 SNP genotype第114-115页
     ·Association of SNP in FATP1 gene with certain economical traits第115-116页
     ·Association of haplotype with carcass traists第116-118页
Chapter five Association of SNP in FATP4 gene with carcass traits and abdominal fat第118-156页
   ·Introduction第118-119页
   ·Material and Methods第119-121页
     ·Sample collection第119页
     ·DNA extraction and primers design第119-120页
     ·PCR-SSCP and gene sequencing第120-121页
     ·Statistical analysis第121页
   ·Results第121-153页
     ·SNP detection in FATP4 gene第121-124页
     ·Genotype and allele frequencies in chicken populations of 70d and 91d第124-131页
     ·Association of SNP with carcass traits of chicken 70d and 91d第131-135页
     ·Construction of haplotypes and their associations with chicken carcass traits第135-141页
     ·Frequencies of genotypes and alleles of all chicken第141-144页
     ·Association of FATP4 SNPs with carcass traits第144-147页
     ·Construction of haplotypes and their frequencies in all population第147-148页
     ·Association of the haplotypes with carcass traits第148-153页
   ·Discussion第153-156页
Chapter Six General Conclusions第156-159页
References第159-172页
Acknowledgement第172-173页
Articles published and submitted第173-174页
Appendix Ⅰ第174页
Appendix Ⅱ第174-176页
Appendix Ⅲ 中文目录第176-181页
Appendix Ⅳ 第章中文概述第181-189页

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