基因调控网络的构建及聚类分析
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-9页 |
第一章 绪论 | 第9-12页 |
·引言 | 第9-10页 |
·研究任务与论文内容安 | 第10-12页 |
第二章 基因芯片数据处理与复杂网络概述 | 第12-23页 |
·生物信息学 | 第12-14页 |
·生物信息学基本概念 | 第12-13页 |
·生物信息学的研究目标和任务 | 第13-14页 |
·生物信息学的研究意义 | 第14页 |
·基因芯片 | 第14-18页 |
·基因芯片技术 | 第15-16页 |
·基因芯片的数据挖掘 | 第16-18页 |
·复杂网络 | 第18-22页 |
·复杂网络背景及意义 | 第18-19页 |
·复杂网络的基本特性 | 第19-22页 |
·本章小结 | 第22-23页 |
第三章 基因调控网络的构建 | 第23-38页 |
·基因调控网络 | 第23-25页 |
·数据来源及预处理 | 第25-28页 |
·数据来源 | 第25页 |
·数据集的过滤预处理 | 第25-28页 |
·基因调控网络的构建方法 | 第28-37页 |
·假设检验 | 第29-31页 |
·相似性的度量 | 第31-32页 |
·P值置换检验计算 | 第32-34页 |
·网络构建中边的产生 | 第34-35页 |
·置换计算P值方法的合理性 | 第35-37页 |
·本章小结 | 第37-38页 |
第四章 基因调控网络的聚类分析 | 第38-52页 |
·聚类分析方法 | 第38-41页 |
·聚类算法 | 第38-39页 |
·快速分裂算法 | 第39-41页 |
·基因调控网络的聚类分析 | 第41-44页 |
·聚类系数 | 第42-43页 |
·Motif 统计方法 | 第43-44页 |
·网络比较 | 第44-50页 |
·急性骨髓白血病和正常白细胞网络的初步比较 | 第44-45页 |
·聚类系数及聚类结果比较 | 第45-46页 |
·motif 数目比较 | 第46-47页 |
·网络共有部分分析及特有部分比较 | 第47-50页 |
·本章小结 | 第50-52页 |
第五章 总结与展望 | 第52-55页 |
参考文献 | 第55-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
攻读硕士期间已发表或录用的论文 | 第59-62页 |
上海交通大学学位论文答辩决议书 | 第62页 |