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基因调控网络的构建及聚类分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 绪论第9-12页
   ·引言第9-10页
   ·研究任务与论文内容安第10-12页
第二章 基因芯片数据处理与复杂网络概述第12-23页
   ·生物信息学第12-14页
     ·生物信息学基本概念第12-13页
     ·生物信息学的研究目标和任务第13-14页
     ·生物信息学的研究意义第14页
   ·基因芯片第14-18页
     ·基因芯片技术第15-16页
     ·基因芯片的数据挖掘第16-18页
   ·复杂网络第18-22页
     ·复杂网络背景及意义第18-19页
     ·复杂网络的基本特性第19-22页
   ·本章小结第22-23页
第三章 基因调控网络的构建第23-38页
   ·基因调控网络第23-25页
   ·数据来源及预处理第25-28页
     ·数据来源第25页
     ·数据集的过滤预处理第25-28页
   ·基因调控网络的构建方法第28-37页
     ·假设检验第29-31页
     ·相似性的度量第31-32页
     ·P值置换检验计算第32-34页
     ·网络构建中边的产生第34-35页
     ·置换计算P值方法的合理性第35-37页
   ·本章小结第37-38页
第四章 基因调控网络的聚类分析第38-52页
   ·聚类分析方法第38-41页
     ·聚类算法第38-39页
     ·快速分裂算法第39-41页
   ·基因调控网络的聚类分析第41-44页
     ·聚类系数第42-43页
     ·Motif 统计方法第43-44页
   ·网络比较第44-50页
     ·急性骨髓白血病和正常白细胞网络的初步比较第44-45页
     ·聚类系数及聚类结果比较第45-46页
     ·motif 数目比较第46-47页
     ·网络共有部分分析及特有部分比较第47-50页
   ·本章小结第50-52页
第五章 总结与展望第52-55页
参考文献第55-58页
致谢第58-59页
攻读硕士期间已发表或录用的论文第59-62页
上海交通大学学位论文答辩决议书第62页

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