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基于SCoT标记分析甘蔗种质资源遗传多样性

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
1 前言第12-24页
   ·遗传多样性概述第12-13页
     ·遗传多样性的概念第12页
     ·遗传多样性研究方法第12-13页
       ·形态学水平第12页
       ·细胞学水平第12-13页
       ·生化水平第13页
       ·分子水平第13页
   ·DNA 分子标记技术第13-20页
     ·随机DNA 分子标记第14-17页
       ·限制性片段长度多态性DNA第14-15页
       ·随机扩增多态性DNA第15页
       ·序列特异性扩增区第15页
       ·扩增片段长度多态性第15-16页
       ·相关序列扩增多态性第16页
       ·靶位区域扩增多态性第16页
       ·简单重复序列第16-17页
     ·目的基因分子标记第17-18页
       ·绿色荧光蛋白标记第17-18页
       ·扩增共有序列遗传标记第18页
       ·抗病基因类似物多态性第18页
       ·单链构象多态性第18页
     ·功能性分子标记第18-20页
       ·单核苷酸多态性第19页
       ·酶切扩增多态性序列第19-20页
       ·基于EST 信息的简单序列重复标记第20页
   ·本试验所采用的分子标记技术第20-21页
     ·SCoT 分子标记技术的基本原理第20页
     ·SCoT 分子标记技术的应用现状第20-21页
       ·QTL 定位第20-21页
       ·遗传多样性分析第21页
   ·甘蔗种质资源遗传多样性的研究进展第21-22页
     ·国内甘蔗种质资源遗传多样性的研究进展第21-22页
     ·国外甘蔗种质资源遗传多样性的研究进展第22页
   ·本研究的目的和意义第22-24页
2 材料与方法第24-32页
   ·供试材料第24-27页
     ·供试甘蔗材料第24-27页
     ·主要仪器设备第27页
     ·主要试剂与来源第27页
   ·试验方法第27-32页
     ·试验所采用的标记技术与引物第27-29页
     ·甘蔗基因组DNA 的制备第29-30页
       ·甘蔗基因组DNA 的提取第29-30页
       ·DNA 的质量和浓度检测第30页
     ·PCR 扩增和产物检测第30-31页
       ·SCoT-PCR 退火温度的筛选第30-31页
       ·SCoT-PCR 反应体系的优化第31页
       ·SCoT-PCR 扩增和产物检测第31页
     ·统计分析方法第31-32页
       ·条带的统计和赋值第31-32页
       ·多态性信息量的计算第32页
       ·遗传多样性参数计算方法第32页
       ·聚类分析和主成分分析第32页
3 结果与分析第32-57页
   ·DNA 提取结果与质量检测第32-34页
     ·DNA 提取结果第32-33页
     ·DNA 样品的纯度和浓度第33-34页
   ·SCoT-PCR 体系的优化和引物筛选结果第34-46页
     ·SCoT-PCR 退火温度的筛选第34-36页
     ·SCoT-PCR 反应体系的优化第36-38页
     ·SCoT-PCR 引物的筛选第38-41页
     ·SCoT-PCR 扩增产物的多态性第41-46页
   ·供试甘蔗无性系遗传多样性的SCoT 分析第46-57页
     ·107 份甘蔗无性系的遗传相似性分析第46-49页
     ·107 份甘蔗无性系的SCoT 聚类分析第49-53页
     ·107 份甘蔗无性系的主成分分析第53-54页
     ·107 份甘蔗无性系的遗传多样性分析第54-57页
       ·不同系列甘蔗无性系的遗传多样性分析第54-57页
       ·11 个系列间的遗传多样性分析第57页
4 讨论与结论第57-61页
   ·讨论第57-59页
     ·关于本试验所采用的SCoT 标记技术问题第57-58页
     ·关于107 份甘蔗无性系遗传多样性问题第58-59页
     ·关于我国甘蔗主栽品种和部分自主选育品种的遗传多样性问题第59页
     ·关于后续SCoT 引物的开发和利用问题第59页
   ·结论第59-61页
参考文献第61-68页
致谢第68页

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