| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第1章 引言 | 第10-22页 |
| 1.1 大黄鱼研究概况 | 第11-13页 |
| 1.1.1 养殖现状 | 第11页 |
| 1.1.2 养殖中存在的问题 | 第11-12页 |
| 1.1.3 主要病害 | 第12-13页 |
| 1.2 变形假单胞菌的研究概况 | 第13-14页 |
| 1.2.1 水产流行病 | 第13页 |
| 1.2.2 生物转化 | 第13-14页 |
| 1.3 转录组测序的发展及应用 | 第14-16页 |
| 1.3.1 转录组与转录组学 | 第14页 |
| 1.3.2 测序技术 | 第14-15页 |
| 1.3.3 转录组测序的应用 | 第15-16页 |
| 1.4 铁载体蛋白的研究概况 | 第16-20页 |
| 1.4.1 铁的生物学功能 | 第16页 |
| 1.4.2 铁载体的类型 | 第16-17页 |
| 1.4.3 铁载体的应用价值 | 第17-18页 |
| 1.4.4 假单胞菌铁载体研究进展 | 第18-20页 |
| 1.5 本研究的目的意义及创新性 | 第20-22页 |
| 1.5.1 本研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 1.5.2 本研究的创新性 | 第21-22页 |
| 第2章 变形假单胞菌转录组测序分析 | 第22-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-23页 |
| 2.1.1 菌株 | 第22-23页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-25页 |
| 2.2.1 样品准备与文库构建 | 第23页 |
| 2.2.2 测序及数据处理 | 第23页 |
| 2.2.3 功能注释和DEGs的分析 | 第23-24页 |
| 2.2.4 实验流程和信息分析流程图 | 第24-25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-30页 |
| 2.3.1 双向层次聚类分析和主成分分析 | 第25-26页 |
| 2.3.2 基因的差异表达分析 | 第26-27页 |
| 2.3.3 差异表达基因的基因本体论(Geneontology,GO)分析 | 第27-28页 |
| 2.3.4 差异基因的直系同源基因聚簇(Clustersoforthologousgroups,COG) | 第28-30页 |
| 2.3.5 KEGG分析 | 第30页 |
| 2.3.6 铁载体合成酶编码基因的筛选 | 第30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-32页 |
| 第3章 温度对变形假单胞菌铁载体合成的影响 | 第32-41页 |
| 3.1 实验材料 | 第32-33页 |
| 3.1.1 实验菌株 | 第32页 |
| 3.1.2 试剂和器材 | 第32-33页 |
| 3.2 实验方法 | 第33-37页 |
| 3.2.1 Pyoverdine合成酶编码基因不同温度下的表达分析 | 第33-35页 |
| 3.2.2 CAS蓝色检测平板检测PVD | 第35-36页 |
| 3.2.3 OD400光吸收测PVD | 第36页 |
| 3.2.4 OD630光吸收测PVD | 第36-37页 |
| 3.2.5 数据处理 | 第37页 |
| 3.3 结果与分析 | 第37-39页 |
| 3.3.1 Pyoverdine合成酶编码基因不同温度下的表达分析 | 第37页 |
| 3.3.2 CAS蓝色检测平板检测PVD | 第37-38页 |
| 3.3.3 OD400光吸收测PVD | 第38-39页 |
| 3.3.4 OD630光吸收测PVD | 第39页 |
| 3.4 讨论 | 第39-41页 |
| 第4章 Pyoverdine合成酶编码基因对铁载体合成的影响 | 第41-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 4.1.1 实验用菌和鱼 | 第41-42页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第42页 |
| 4.2 方法与步骤 | 第42-49页 |
| 4.2.1 基因稳定沉默 | 第42-44页 |
| 4.2.2 Pyoverdine合成酶编码基因定量RT-PCR分析 | 第44-47页 |
| 4.2.3 CAS蓝色检测平板检测PVD | 第47页 |
| 4.2.4 OD400光吸收测PVD | 第47-48页 |
| 4.2.5 OD630光吸收测PVD | 第48页 |
| 4.2.6 生长曲线 | 第48页 |
| 4.2.7 生物膜 | 第48页 |
| 4.2.8 基因稳定沉默菌株感染斑马鱼实验 | 第48-49页 |
| 4.3 结果与分析 | 第49-53页 |
| 4.3.1 Pyoverdine合成酶编码基因定量RT-PCR分析 | 第49页 |
| 4.3.2 CAS蓝色检测平板检测PVD | 第49-50页 |
| 4.3.3 OD400光吸收测PVD | 第50-51页 |
| 4.3.4 OD630光吸收测PVD | 第51页 |
| 4.3.5 生长能力 | 第51-52页 |
| 4.3.6 生物膜 | 第52-53页 |
| 4.3.7 攻毒实验 | 第53页 |
| 4.4 讨论 | 第53-55页 |
| 第5章 结论与展望 | 第55-56页 |
| 5.1 结论 | 第55页 |
| 5.2 展望 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 在学期间发表的学术论文 | 第63页 |
