| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 第一章 | 第12-27页 |
| 1 链霉菌研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1 链霉菌简介 | 第12页 |
| 1.2 白色链霉菌及其在生物工程中的应用 | 第12-14页 |
| 1.2.1 白色链霉菌简介 | 第13页 |
| 1.2.2 模式菌株白色链霉菌的异源表达 | 第13-14页 |
| 2 链霉菌的次级代谢产物简介 | 第14-19页 |
| 2.1 聚酮类化合物 | 第15-16页 |
| 2.2 核糖体合成的寡肽类和氨基糖苷类化合物 | 第16-17页 |
| 2.3 非核糖体多肽类化合物 | 第17-19页 |
| 2.3.1 非核糖体多肽化合物SF2768简介 | 第17-18页 |
| 2.3.2 异腈化合物SF2768研究进展 | 第18-19页 |
| 3 代谢组学研究概述 | 第19-22页 |
| 3.1 代谢组概念 | 第19页 |
| 3.2 代谢组学研究的技术手段 | 第19-21页 |
| 3.2.1 质谱 | 第19-20页 |
| 3.2.2 核磁共振 | 第20-21页 |
| 3.3 代谢物的检测和鉴定 | 第21-22页 |
| 3.3.1 代谢物的检测 | 第21-22页 |
| 3.3.2 代谢物的鉴定 | 第22页 |
| 4 代谢组学在微生物研究中的应用 | 第22-25页 |
| 4.1 代谢组学在微生物表型分类中的应用 | 第23页 |
| 4.2 代谢组学在微生物代谢途径研究中的应用 | 第23页 |
| 4.3 代谢组学在微生物基因功能分析中的应用 | 第23-25页 |
| 4.3.1 代谢谱用于分析生物合成基因簇功能 | 第24页 |
| 4.3.2 代谢组用于分析表观沉默型突变株 | 第24-25页 |
| 5 选题依据及研究内容 | 第25-27页 |
| 5.1 选题依据 | 第25页 |
| 5.2 研究内容 | 第25-27页 |
| 第二章 白色链霉菌代谢物质谱数据库的构建 | 第27-41页 |
| 1 引言 | 第27页 |
| 2 材料和方法 | 第27-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第27-29页 |
| 2.1.1 菌种 | 第27页 |
| 2.1.2 培养基 | 第27-28页 |
| 2.1.3 试剂及仪器 | 第28-29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-30页 |
| 2.2.1 样品准备与前处理 | 第29-30页 |
| 2.2.2 数据采集 | 第30页 |
| 2.2.3 代谢物的定性分析 | 第30页 |
| 2.3 实验设计 | 第30-31页 |
| 3 结果与讨论 | 第31-40页 |
| 3.1 方法优化 | 第31-33页 |
| 3.1.1 菌体培养基及培养方式的选择 | 第31-32页 |
| 3.1.2 样品前处理 | 第32页 |
| 3.1.3 数据采集方法 | 第32-33页 |
| 3.2 二级质谱数据的采集与初步处理 | 第33-35页 |
| 3.3 代谢物的鉴定和注释 | 第35-40页 |
| 3.3.1 氨基酸的鉴别 | 第35页 |
| 3.3.2 醇类代谢物的鉴别 | 第35-36页 |
| 3.3.3 酸类物质的鉴定 | 第36-40页 |
| 4 小结 | 第40-41页 |
| 第三章 SF2768生物合成基因簇的功能分析 | 第41-59页 |
| 1 引言 | 第41-42页 |
| 2 材料和方法 | 第42-45页 |
| 2.1 实验材料 | 第42-43页 |
| 2.1.1 菌种 | 第42-43页 |
| 2.1.2 培养基 | 第43页 |
| 2.1.3 试剂及仪器 | 第43页 |
| 2.2 实验方法 | 第43-44页 |
| 2.2.1 样品准备与前处理方法 | 第43页 |
| 2.2.2 LC-MS检测及数据分析方法 | 第43页 |
| 2.2.3 代谢差异分析方法 | 第43-44页 |
| 2.3 实验设计 | 第44-45页 |
| 3 实验结果 | 第45-58页 |
| 3.1 野生菌株与异源表达菌株代谢差异分析 | 第45-50页 |
| 3.1.1 生物活性测试 | 第45-46页 |
| 3.1.2 总离子流图(TIC)比较 | 第46-47页 |
| 3.1.3 内标物提取离子流(EIC)及其定量 | 第47页 |
| 3.1.4 统计学分析 | 第47-48页 |
| 3.1.5 代谢物差异分析 | 第48-50页 |
| 3.2 SF2768生物合成基因簇的功能分析 | 第50-58页 |
| 3.2.1 S.albus::pZMY13C与ΔsfaA代谢差异分析 | 第50-53页 |
| 3.2.2 多组比较(MetaXCMSjob)代谢分析 | 第53-55页 |
| 3.2.3 添加验证 | 第55-57页 |
| 3.2.4 关键代谢差异物的代谢路径 | 第57-58页 |
| 4 小结 | 第58-59页 |
| 第四章 模式菌株与异源表达菌株代谢差异扫描 | 第59-66页 |
| 1 引言 | 第59-60页 |
| 2 材料和方法 | 第60-61页 |
| 2.1 实验材料 | 第60页 |
| 2.1.1 菌种 | 第60页 |
| 2.1.2 培养基 | 第60页 |
| 2.1.3 试剂及仪器 | 第60页 |
| 2.2 实验方法 | 第60-61页 |
| 2.2.1 菌体培养与样品前处理方法 | 第60页 |
| 2.2.2 LC-MS检测及数据分析方法 | 第60页 |
| 2.2.3 代谢差异分析方法 | 第60-61页 |
| 2.3 实验设计 | 第61页 |
| 3 结果与讨论 | 第61-65页 |
| 3.1 异源表达菌株目标产物的质谱扫描 | 第61-62页 |
| 3.2 S.albus与S.albus::pZAY10A3的代谢差异 | 第62-63页 |
| 3.3 S.albus与S.albus::pZAY23F11的代谢差异 | 第63-65页 |
| 4 小结 | 第65-66页 |
| 总结与展望 | 第66-68页 |
| 1 总结 | 第66-67页 |
| 2 展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 附表 | 第78-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
