| 摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-30页 |
| 1 镰孢菌研究的意义 | 第10页 |
| 2 镰孢菌分类的研究进展 | 第10-13页 |
| 2.1 镰孢菌的分类系统 | 第10-12页 |
| 2.2 国内镰孢菌属分类研究进展 | 第12-13页 |
| 2.3 镰孢菌属形态学分类依据 | 第13页 |
| 3 分子生物学技术在镰孢菌研究上的应用 | 第13-16页 |
| 3.1 基于PCR分子标记技术在镰孢菌上的应用 | 第14-15页 |
| 3.2 基于致病基因设计特异性引物在镰孢菌上的应用 | 第15页 |
| 3.3 基于多基因序列构建系统发育树在镰孢菌上的应用 | 第15-16页 |
| 3.4 DNA条形码技术在镰孢菌上的应用 | 第16页 |
| 4 山西镰孢菌研究进展 | 第16-17页 |
| 5 镰孢菌遗传多样性研究进展 | 第17页 |
| 6 DNA条形码研究进展 | 第17-28页 |
| 6.1 概念的提出 | 第18-19页 |
| 6.2 DNA条形码的识别原理 | 第19页 |
| 6.3 DNA条形码筛选标准 | 第19-20页 |
| 6.4 DNA条形码的应用范围 | 第20页 |
| 6.5 DNA条形码的分析方法 | 第20-21页 |
| 6.6 DNA条形码在分类学中的地位 | 第21-25页 |
| 6.7 DNA条形码技术存在的争议 | 第25页 |
| 6.8 DNA条形码应用前景 | 第25-26页 |
| 6.9 动物DNA条形码研究进展 | 第26页 |
| 6.10 植物DNA条形码研究进展 | 第26-27页 |
| 6.11 真菌DNA条形码研究进展 | 第27-28页 |
| 7 本研究的目的意义及主要研究内容 | 第28-29页 |
| 8 技术路线 | 第29-30页 |
| 第二章 镰孢菌DNA条形码的筛选 | 第30-52页 |
| 1 材料与方法 | 第31-41页 |
| 1.1 供试材料 | 第31页 |
| 1.2 仪器设备 | 第31-32页 |
| 1.3 培养基和试剂 | 第32-33页 |
| 1.4 模板DNA的制备 | 第33页 |
| 1.5 DNA质量检测 | 第33-34页 |
| 1.6 PCR扩增与测序 | 第34页 |
| 1.7 克隆测序 | 第34-36页 |
| 1.8 序列拼接及比对 | 第36页 |
| 1.9 候选DNA条形码序列种内及种间变异分析 | 第36页 |
| 1.10 候选条形码序列获得成功率 | 第36页 |
| 1.11 邻接树的构建 | 第36-41页 |
| 2 结果与分析 | 第41-50页 |
| 2.1 各候选基因序列获得成功率 | 第41页 |
| 2.2 序列特征 | 第41页 |
| 2.3 候选DNA条形码序列种内及种间变异分析 | 第41-46页 |
| 2.4 邻接树构建 | 第46-50页 |
| 3 结论与讨论 | 第50-52页 |
| 第三章 镰孢菌种间遗传多样性的多基因序列联合分析 | 第52-68页 |
| 1 材料与方法 | 第52-56页 |
| 1.1 供试菌株及序列信息 | 第52-55页 |
| 1.2 仪器设备 | 第55页 |
| 1.3 培养基、试剂 | 第55页 |
| 1.4 模板DNA的制备 | 第55页 |
| 1.5 PCR扩增与测序 | 第55页 |
| 1.6 数据分析 | 第55页 |
| 1.7 构建系统发育树 | 第55-56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-66页 |
| 2.1 镰孢菌种类鉴定候选基因序列筛选 | 第56-60页 |
| 2.2 多基因序列联合分析 | 第60-66页 |
| 3 结论与讨论 | 第66-68页 |
| 第四章 尖孢镰孢菌种内遗传多样性的EF-1a基因序列分析 | 第68-83页 |
| 1 材料与方法 | 第68-72页 |
| 1.1 供试菌株及序列信息 | 第68页 |
| 1.2 仪器设备 | 第68-69页 |
| 1.3 培养基、试剂 | 第69页 |
| 1.4 模板DNA的制备 | 第69页 |
| 1.5 PCR扩增与测序 | 第69页 |
| 1.6 数据分析 | 第69页 |
| 1.7 构建系统发育树 | 第69-72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-81页 |
| 2.1 国内尖孢镰孢菌遗传多样性分析 | 第72-77页 |
| 2.2 国内外尖孢镰孢菌遗传多样性分析 | 第77-81页 |
| 3 结论与讨论 | 第81-83页 |
| 第五章 山西植物病原镰孢菌种群多样性 | 第83-105页 |
| 1 材料与方法 | 第84-89页 |
| 1.1 供试菌株及序列信息 | 第84-87页 |
| 1.2 仪器设备 | 第87页 |
| 1.3 培养基、试剂 | 第87页 |
| 1.4 单孢菌株获得 | 第87-88页 |
| 1.5 模板DNA的制备 | 第88页 |
| 1.6 DNA质量检测 | 第88页 |
| 1.7 PCR扩增与测序 | 第88页 |
| 1.8 序列分析 | 第88页 |
| 1.9 山西镰孢菌种群分布分析方法 | 第88-89页 |
| 1.10 山西镰孢菌种群多样性 | 第89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-103页 |
| 2.1 山西镰孢菌种的鉴定 | 第89-94页 |
| 2.2 山西镰孢菌种群分布 | 第94-100页 |
| 2.3 山西省不同地区镰孢菌种群多样性 | 第100页 |
| 2.4 山西省不同地区镰孢菌种群相似性 | 第100-103页 |
| 3 结论与讨论 | 第103-105页 |
| 第六章 结论 | 第105-107页 |
| 参考文献 | 第107-118页 |
| Abstract | 第118-119页 |
| 攻读博士期间发表的学术论文 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
