基于RNA-seq的棉花陆海渐渗系黄萎病抗性及纤维品质研究
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-30页 |
| 1.1 棉花的起源与驯化 | 第13-14页 |
| 1.2 植物染色体片段代换系的研究进展 | 第14-17页 |
| 1.2.1 染色体片段代换系的构建和特点 | 第14-15页 |
| 1.2.2 染色体片段代换系的应用 | 第15-17页 |
| 1.3 棉花黄萎病抗性相关的研究进展 | 第17-25页 |
| 1.3.1 棉花黄萎病的研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3.2 棉花黄萎病致病机理 | 第19-21页 |
| 1.3.3 棉花抗黄萎病分子机制 | 第21-22页 |
| 1.3.4 棉花黄萎病相关转录组研究 | 第22-25页 |
| 1.4 棉花纤维发育过程及相关转录组研究 | 第25-28页 |
| 1.4.1 棉花纤维发育过程 | 第25-26页 |
| 1.4.2 棉花纤维发育的转录组研究 | 第26-28页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| 第二章 陆海渐渗系黄萎病抗性研究 | 第30-84页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第30-31页 |
| 2.1.2 棉花黄萎病菌株 | 第31-32页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第32-33页 |
| 2.1.4 实验仪器 | 第33-34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-48页 |
| 2.2.1 棉花黄萎病抗性鉴定 | 第34-36页 |
| 2.2.2 陆海渐渗系遗传背景鉴定 | 第36-38页 |
| 2.2.3 棉花纤维品质性状检测 | 第38页 |
| 2.2.4 棉花黄萎病相关生理生化指标检测 | 第38-43页 |
| 2.2.5 棉花黄萎病转录组测序和分析 | 第43-48页 |
| 2.3 结果与分析 | 第48-76页 |
| 2.3.1 棉花黄萎病抗性鉴定 | 第48-53页 |
| 2.3.2 陆海渐渗系遗传背景鉴定 | 第53-57页 |
| 2.3.3 棉花纤维品质检测 | 第57-58页 |
| 2.3.4 棉花生理生化指标检测结果 | 第58-60页 |
| 2.3.5 棉花黄萎病转录组测序分析 | 第60-76页 |
| 2.4 讨论 | 第76-84页 |
| 2.4.1 实验条件和表型评价 | 第76-77页 |
| 2.4.2 与V991侵染相关的生理生化抗性机制 | 第77-79页 |
| 2.4.3 与V991侵染相关的基因表达变化 | 第79-80页 |
| 2.4.4 与V991侵染相关的苯丙烷代谢通路 | 第80-81页 |
| 2.4.5 与V991侵染相关的氧化还原过程 | 第81-82页 |
| 2.4.6 与V991侵染相关的植物抗性基因 | 第82-84页 |
| 第三章 棉花陆海渐渗系的纤维转录组分析 | 第84-110页 |
| 3.1 材料与方法 | 第84-85页 |
| 3.1.1 实验材料和取样 | 第84-85页 |
| 3.1.2 主要试剂耗材 | 第85页 |
| 3.2 实验方法 | 第85-88页 |
| 3.2.1 RNA的提取与检测 | 第85页 |
| 3.2.2 cDNA文库构建与测序 | 第85-86页 |
| 3.2.3 数据质量控制与参考基因组比对 | 第86页 |
| 3.2.4 差异表达基因分析 | 第86-87页 |
| 3.2.5 渐渗基因的预测 | 第87页 |
| 3.2.6 qRT-PCR验证转录组测序数据 | 第87-88页 |
| 3.3 结果与分析 | 第88-105页 |
| 3.3.1 渐渗系的表型特征和渐渗背景 | 第88-90页 |
| 3.3.2 RNA-seq和序列比对 | 第90-93页 |
| 3.3.3 差异表达基因分析 | 第93-98页 |
| 3.3.4 基因时序表达模式分析 | 第98-101页 |
| 3.3.5 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第101-102页 |
| 3.3.6 渐渗基因分析 | 第102-105页 |
| 3.4 讨论 | 第105-110页 |
| 第四章 全文总结与讨论 | 第110-113页 |
| 4.1 棉花黄萎病抗性相关研究 | 第110-112页 |
| 4.2 棉花纤维品质相关研究 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-130页 |
| 附录：作者简介及在读期间发表的文章 | 第130-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
