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小鼠成熟精子中mRNA表达谱的分析及mRNA在早期胚胎发育中潜在功能的研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
符号与缩写第11-12页
第一章 成熟精子 RNA 研究现状第12-20页
    1.1 睾丸、附睾和精子的结构第12-14页
    1.2 精子发生过程和受精过程第14-17页
    1.3 精子的 RNA 的种类与功能第17-20页
第二章 DNA 测序技术的进展第20-32页
    2.1 第一代 DNA 测序技术第20-22页
        2.1.1 化学降解法第20页
        2.1.2 Sanger 测序法第20-22页
    2.2 第二代测序技术第22-27页
        2.2.1 454/ Roche 测序技术第23-24页
        2.2.2 Solexa/Illumina 测序技术第24-26页
        2.2.3 SOLiD 测序技术第26-27页
    2.3 第三代测序技术第27-28页
    2.4 RNA 测序技术第28-29页
    2.5 RNA 测序表达谱分析第29-32页
第三章 小鼠成熟精子中表达谱的分析及早期胚胎发育中潜在功能的研究第32-73页
    3.1 实验方法和材料第32-44页
        3.1.1 小鼠精子样本来源第32页
        3.1.2 小鼠成熟精子,卵子和受精卵样本的收集和纯化第32-33页
        3.1.3 RNA 的提取和检测第33-34页
        3.1.4 cDNA 文库的建立和 RNA 测序第34页
        3.1.5 RNA 序列的组装和定位第34-35页
        3.1.6 RT- PCR 确定 RNA 测序结果第35-36页
        3.1.7 Real-time PCR 确定 RNA 测序结果第36-37页
        3.1.8 确定精子中普遍存在的 RNA 种类第37-38页
        3.1.9 RNA 测序数据的生物信息学分析第38-39页
        3.1.10 RT-PCR 分析胚胎发育相关的基因第39-42页
        3.1.11 蛋白质提取和 SDS-PAGE 电泳第42-43页
        3.1.12 蛋白印迹分析第43页
        3.1.13 免疫荧光分析第43-44页
    3.2 实验结果第44-66页
        3.2.1 精子样品的质量第44-45页
        3.2.2 转录组测序产出、序列组装第45-47页
        3.2.3 RNA 测序结果的检测第47-49页
        3.2.4 精子中 RNA 种类的确定第49页
        3.2.5 RPKM≥6 的 mRNA 在染色体上的分布第49-50页
        3.2.6 RPKM≥6 的 mRNA 编码的蛋白在细胞内定位分析第50-51页
        3.2.7 RPKM≥6 的 mRNA 功能聚类分析第51-52页
        3.2.8 RPKM≥6 的 mRNA 细胞通路分析第52-53页
        3.2.9 RPKM≥6 的 mRNA 表型分析第53-55页
        3.2.10 RPKM≥6 的与精子发生相关 mRNA 的分析第55页
        3.2.11 RPKM≥6 的转录因子分析第55-56页
        3.2.12 精子中高丰度 mRNA 表达谱分析第56-59页
        3.2.13 RPKM≥6、60、600 的生物学过程和表型比较第59-61页
        3.2.14 与胚胎发育相关 mRNA 在卵子中检验第61-62页
        3.2.15 与胚胎发育相关 mRNA 在早期和晚期受精卵中检验第62-63页
        3.2.16 WNT4 和 FOXG1 蛋白在早期和晚期受精卵中检验第63-66页
    3.3 实验结果讨论第66-73页
        3.3.1 小鼠精子中广泛存在的 mRNA 的种类估算第66-67页
        3.3.2 小鼠精子中广泛存在的 mRNA 的表达谱分析第67-69页
        3.3.3 精子中高丰度的 mRNA 的功能分析第69-70页
        3.3.4 精子来源的 mRNA 被运送到受精卵子中并被翻译第70-73页
第四章 总结与展望第73-76页
    4.1 总结第73-74页
    4.2 展望第74-76页
参考文献第76-84页
附录 1:实验仪器第84-85页
附录 2:实验试剂的配置方法第85-87页
致谢第87-88页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第88-89页
附件第89页

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