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光棘球海胆基于转录组测序的PUFA合成相关基因的克隆及表达分析

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第一章 文献综述第12-26页
    1.1 光棘球海胆概述第12-15页
        1.1.1 光棘球海胆的分类地位与分布第12页
        1.1.2 光棘球海胆的形态特征与生理生化特性第12-13页
        1.1.3 光棘球海胆的研究概况第13-15页
    1.2 高通量测序技术在棘皮动物转录组学研究中的应用第15-21页
        1.2.1 测序技术的发展第15-17页
        1.2.2 转录组学及其研究方法第17-19页
        1.2.3 RNA-Seq技术在棘皮动物研究中的应用第19-20页
        1.2.4 海胆转录组测序的研究进展第20-21页
    1.3 多不饱和脂肪酸在生物体中合成途径的研究进展第21-25页
        1.3.1 多不饱和脂肪酸的分类及功能第21-22页
        1.3.2 多不饱和脂肪酸在生物体中的合成途径第22-24页
        1.3.3 海洋无脊椎动物体内LC-PUFAs合成的研究进展第24-25页
    1.4 本研究的目的与意义第25-26页
第二章 性腺转录组测序及数据分析第26-49页
    2.1 材料与试剂第26-27页
        2.1.1 实验材料第26-27页
        2.1.2 仪器设备第27页
        2.1.3 主要试剂第27页
    2.2 实验方法第27-33页
        2.2.1 性腺组织生理性状测定第27页
        2.2.2 性腺总RNA的提取及质量检测第27页
        2.2.3 cDNA文库的构建及Illumina测序第27-28页
        2.2.4 测序数据处理及分析第28-33页
    2.3 实验结果第33-47页
        2.3.1 性腺发育阶段鉴定第33-34页
        2.3.2 性腺中脂肪酸种类及含量检测第34-36页
        2.3.3 测序评估及序列拼接第36-37页
        2.3.4 基因注释与功能分类第37-42页
        2.3.5 差异表达基因挖掘、功能注释及qPCR验证第42-45页
        2.3.6 两种主要分子标记的预测第45-47页
    2.4 讨论第47-48页
        2.4.1 海胆性腺理化特性及转录组测序第47页
        2.4.2 测序序列注释第47-48页
        2.4.3 测序序列的功能分析第48页
    2.5 小结第48-49页
第三章 PUFA相关基因的克隆与表达分析第49-70页
    3.1 材料与试剂第49-50页
        3.1.1 实验材料第49页
        3.1.2 主要仪器设备第49页
        3.1.3 所需试剂药品第49-50页
    3.2 试验方法第50-55页
        3.2.1 总RNA提取与cDNA第一链合成第50页
        3.2.2 基因克隆第50-51页
        3.2.3 序列分析及系统进化树构建第51-52页
        3.2.4 定量PCR检测基因的组织分布第52-53页
        3.2.5 酵母真核表达3个PUFA相关基因第53-55页
    3.3 实验结果第55-68页
        3.3.1 组织RNA的提取第55页
        3.3.2 基因克隆第55-58页
        3.3.3 氨基酸序列分析第58-66页
        3.3.4 PUFA相关3个基因的组织表达特性第66-67页
        3.3.5 基因表达验证第67-68页
    3.4 讨论第68-69页
        3.4.1 PUFA合成关键基因的序列特征及功能特性第68-69页
        3.4.2 基因的组织分布第69页
    3.5 小结第69-70页
第四章 结论与创新点第70-71页
    4.1 结论第70页
    4.2 创新点第70页
    4.3 进一步研究内容第70-71页
参考文献第71-78页
附录第78-84页
致谢第84-85页
作者简介第85页

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