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中医调护SD孕鼠PTSD“胎损”的表观遗传机制研究

中文摘要第5-8页
Abstract第8-10页
第一部分 前言第21-34页
    1. 研究背景第21-29页
        1.1 创伤后应激心理障碍症(PTSD)第21-22页
        1.2 PTSD与中医“胎损”第22-23页
        1.3 中医防治PTSD第23-24页
            1.3.1 脏腑辨证与中药治疗第23-24页
            1.3.2 针灸与情志治疗第24页
        1.4 PTSD与表观遗传调控第24-29页
            1.4.1 国内表观遗传研究第25-27页
            1.4.2 国外研究现状及发展动态分析第27-28页
            1.4.3 PTSD表观遗传研究进展第28-29页
    2. 研究意义第29-30页
        2.1 防治PTSD具有重要的医学价值和社会意义第29-30页
        2.2 弘扬中医调护“胎损”的特色方法第30页
    3. 研究假说第30-31页
    4. 可行性分析第31-32页
        4.1 前期研究基础扎实第31页
        4.2 理论依据充分、试验平台先进第31-32页
    5. 本研究的特色与创新之处第32-34页
        5.1 思路创新:首次提出中医调护PTSD恐惧“胎损”研究第32页
        5.2 内容创新:优裕环境模拟情志调护及其表观遗传机制探索第32页
        5.3 方法创新:融合行为遗传学与表观遗传学第32-34页
第二部分 PTSD造模与分组第34-38页
    1. 试验动物第34页
    2. 仪器与药物第34页
    3. PTSD造模第34-35页
    4. 分组第35-38页
        4.1 对照组(空白)第36页
        4.2 PTSD组第36页
        4.3 中药组第36页
        4.4 情志组第36-37页
        4.5 情中组第37-38页
第三部分 行为遗传测试第38-43页
    1. 材料第38页
    2. 行为测试第38-40页
        2.1 旷场测试(Open-field Test, OFT)第38-39页
        2.2 糖水消耗试验(Sucrose Consumption Test, SCT)第39页
        2.3 翻身测试(Turn-over Test, TOT)第39页
        2.4 张耳睁眼检测(Ears Opening and Eyes Opening, EOEO)第39页
        2.5 统计学处理第39-40页
    3. 结果第40-43页
        3.1 旷场试验(OFT)第40-41页
        3.2 糖水试验(SCT)第41页
        3.3 翻身测试(TOT)第41-42页
        3.4 张耳睁眼(EOEO)第42-43页
第四部分 表达谱芯片测试第43-58页
    1. 试验对象第43页
    2. 材料与方法第43-45页
        2.1 标本采集第43页
        2.2 主要仪器与试剂第43-44页
            2.2.1 仪器第43页
            2.2.2 试剂第43-44页
            2.2.3 分析软件第44页
        2.3 分离白细胞第44-45页
        2.4 总RNA提取和纯化第45页
        2.5 表达谱芯片检测第45页
        2.6 表达谱数据分析方法第45页
    3. 结果第45-58页
        3.1 样品RNA质检结果第45-46页
        3.2 芯片试验质控情况第46页
        3.3 PTSD组VS对照组第46-48页
            3.3.1 差异表达基因第46-48页
            3.3.2 差异表达基因GO功能注释第48页
            3.3.3 112个显著基因KEGG通路注释第48页
        3.4 情志组VS PTSD组第48-51页
            3.4.1 差异表达基因第48-49页
            3.4.2 差异表达基因GO功能注释第49-50页
            3.4.3 31个显著基因KEGG通路注释第50页
            3.4.4 起效基因第50-51页
        3.5 中药组VS PTSD组第51-54页
            3.5.1 差异表达基因第51-52页
            3.5.2 差异表达基因GO功能注释第52-53页
            3.5.3 28个显著基因KEGG通路注释第53页
            3.5.4 中药干预起效差异表达基因分析第53-54页
        3.6 情中组VS PTSD组第54-56页
            3.6.1 差异表达基因第54-55页
            3.6.2 差异表达基因GO功能注释第55页
            3.6.3 45个显著基因KEGG通路注释第55页
            3.6.4 联合干预起效差异表达基因分析第55-56页
        3.7 联合分析第56-58页
第五部分 MeDIP- Seq甲基化测序第58-70页
    1. 试验对象第58页
    2. 材料与试剂第58页
    3. 样本质检第58-59页
    4. 测序试验第59页
    5. 数据分析第59-60页
    6. 结果第60-70页
        6.1 DNA质检第60页
        6.2 文库构建结果第60页
        6.3 测序结果质控第60页
        6.4 数据分析及结果第60页
        6.5 Reads处理结果第60页
        6.6 基因组绘图第60-61页
        6.7 PTSD VS对照组甲基化位点第61-65页
            6.7.1 概览第61-62页
            6.7.2 甲基化与表达谱关联分析第62-63页
            6.7.3 基因的注释第63-65页
        6.8 情志组VS PTSD组第65-66页
            6.8.1 概览第65页
            6.8.2 联合分析第65-66页
        6.9 中药组VS PTSD组第66-67页
            6.9.1 概览第66-67页
            6.9.2 联合分析第67页
        6.10 情中组VS PTSD组第67-70页
            6.10.1 概览第67-68页
            6.10.2 关联分析第68-70页
第六部分 RT-PCR验证第70-72页
    1. 材料第70页
    2. 主要试剂与仪器第70页
    3. 试验步骤第70-71页
    4. 表达量计算第71页
    5. 结果第71-72页
第七部分 结论与讨论第72-81页
    1. 结论一第72-75页
        1.1 优裕环境模拟情志调护第72-73页
        1.2 金匮肾气丸补肾第73-74页
        1.3 行为检测第74-75页
    2. 结论二第75-78页
        2.1 PTSD导致子代表达谱广泛异常第75页
        2.2 MAPK信号通路第75-77页
        2.3 细胞内吞通路第77页
        2.4 Ntf3基因第77页
        2.5 Pla2g5基因第77-78页
    3. 结论三第78-79页
    4. 研究局限第79-80页
    5. 展望第80-81页
致谢第81-82页
参考文献第82-96页
综述 中医治疗PTSD的临床研究进展第96-109页
    1. 背景第96-97页
    2. PTSD诊断与辨证分型第97-98页
    3. 中医心理疗法治疗PTSD第98-100页
    4. 针灸治疗第100-101页
    5. 中药治疗第101-103页
    参考文献第103-109页
附件第109-183页
    附件1. 发表论文第109-110页
    附件2. 主持项目第110-111页
    附件3. 获奖情况第111-112页
    附件4. 附表第112-134页
        表5. 原始数据与样品编号对应表第112页
        表6: RNA质检结果第112-113页
        表7. 芯片质控表第113-114页
        表8. 112条差异基因(PTSD组VS对照组)第114-117页
        表10. 31条差异基因(情志组VS PTSD)第117-118页
        表11. 情志干预后97条起效基因第118-121页
        表13. 28条差异基因(中药组VS PTSD组)第121-122页
        表15. 53条差异表达基因第122-124页
        表16. 45条差异基因(情中组VS PTSD组)第124-125页
        表18. 情中组61条起效基因第125-128页
        表20. 差异peak注释表第128-129页
        表21. 15个样本的DNA质检结果第129页
        表22. Qubit(?) 2.0 Fluorometer定量结果第129-130页
        表23. 测序结果质控表第130-131页
        表24. Clean结果统计表第131页
        表25. Mapping统计图第131-134页
    附件5. 附图第134-183页
        图11. RNA质检电泳图(1)第134-135页
        图15. 细胞功能GO涵盖基因分布饼图第135页
        图16. 细胞组件GO涵盖基因分布饼图第135-136页
        图17. 生物学过程GO涵盖基因分布饼图第136-137页
        图18. 胞吞KEGG通路图第137-138页
        图19. MAPK信号通路KEGG图第138-139页
        图20. 胆汁分泌KEGG图第139-140页
        图21. 肥厚型心肌病KEGG通路图第140-141页
        图22. 抗原处理与呈递KEGG通路图第141-142页
        图25. 细胞组件GO涵盖基因分布饼图第142页
        图26. 催化活性GO涵盖基因分布饼图第142-143页
        图27. 生物学过程GO涵盖基因分布饼图第143-145页
        图29. 胞吞KEGG通路第145-146页
        图30. A型流感KEGG通路第146-147页
        图31. MAPK信号通路第147-148页
        图34. 细胞组件涉及基因GO饼图第148-149页
        图35. 细胞因子信号KEGG信号通路第149-150页
        图36. 细胞因子-细胞因子受体相互作用KEGG信号通路第150-151页
        图37. 胞质DNA传感KEGG通路第151-152页
        图38. 组氨酸代谢KEGG通路第152-153页
        图39. 自然杀伤细胞介导细胞毒KEGG通路第153-154页
        图42. 分子功能涉及基因GO饼图第154页
        图43. 细胞组件涉及基因GO饼图第154-155页
        图44. 生物学过程涉及基因GO饼图第155-156页
        图45. 阿尔茨海默通路KEGG通路第156-157页
        图46. MAPK信号KEGG通路第157-158页
        图48. 对照组3个样本的甲基化peak分布图第158-159页
        图49. PTSD组3个样本的甲基化peak分布图第159-160页
        图50. PTSD组3个样本的甲基化peak分布图第160-161页
        图51. PTSD组3个样本的甲基化peak分布图第161-162页
        图52. PTSD组3个样本的甲基化peak分布图第162-163页
        图53. 对照组3个样本的甲基化与CpG岛关联图第163-164页
        图54. PTSD组3个样本的甲基化与CpG岛关联图第164-165页
        图55. 情志组3个样本的甲基化与CpG岛关联图第165-166页
        图56. 中药组3个样本的甲基化与CpG岛关联图第166-167页
        图57. 情中组3个样本的甲基化与CpG岛关联图第167-168页
        图58. PTSD组Peak主峰正态分布图第168-169页
        图59. 情志组Peak主峰正态分布图第169-170页
        图60. 中药组Peak主峰正态分布图第170-171页
        图61. 情中组Peak主峰正态分布图第171-172页
        图62. 对照组Peak主峰正态分布第172-173页
        图63. 对照组测序数据的质盒图第173页
        图64. PTSD组测序数据的质盒图第173-174页
        图65. 情志组测序数据的质盒图第174页
        图66. 中药组组测序数据的质盒图第174-175页
        图67. 情中组测序数据的质盒图第175-176页
        图71. 心律失常性右室心肌病KEGG通路第176-177页
        图72. 扩张性心肌病KEGG通路第177-178页
        图73. 肥大型心肌病KEGG通路第178-179页
        图74. 受体交互作用KEGG通路第179-180页
        图75. 病毒性心肌炎KEGG通路第180-181页
        图76. 神经生长信号通路KEGG通路第181-182页
        图77. 凝血功能KEGG通路第182-183页

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