| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第1章 绪论 | 第14-18页 |
| 1.1 课题的研究背景和目的 | 第14-16页 |
| 1.1.1 课题研究背景 | 第14-16页 |
| 1.1.2 课题研究目的 | 第16页 |
| 1.2 课题的研究内容和意义 | 第16-17页 |
| 1.2.1 课题研究内容 | 第16页 |
| 1.2.2 课题研究意义 | 第16-17页 |
| 1.3 论文主要内容和组织 | 第17-18页 |
| 第2章 基于MMP14血凝乳酶样区的小分子先导化合物虚拟筛选 | 第18-41页 |
| 2.1 引言 | 第18-19页 |
| 2.2 主要软件及小分子化合物库 | 第19-21页 |
| 2.2.1 DOCK | 第19页 |
| 2.2.2 AutoDock | 第19-20页 |
| 2.2.3 MVD对活性位点进行预测 | 第20页 |
| 2.2.4 openbabel | 第20页 |
| 2.2.5 Corina | 第20页 |
| 2.2.6 Specs化合物库 | 第20-21页 |
| 2.3 研究方法 | 第21-22页 |
| 2.3.1 MMP14的相似性搜索 | 第21页 |
| 2.3.2 配体数据库的处理 | 第21页 |
| 2.3.3 活性位点预测 | 第21页 |
| 2.3.4 MVD对活性位点进行预测 | 第21页 |
| 2.3.5 DOCK初筛Specs化合物库 | 第21-22页 |
| 2.3.6 AutoDock对化合物打分 | 第22页 |
| 2.3.7 AutoDock"blind docking"打分 | 第22页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第22-36页 |
| 2.4.1 MMP14的相似性搜索 | 第22-23页 |
| 2.4.2 DOCK筛选口袋的选择及验证 | 第23-24页 |
| 2.4.3 初筛 | 第24页 |
| 2.4.4 AutoDock打分及配体-受体相互作用研究 | 第24-32页 |
| 2.4.5 AutoDock"blind docking"打分 | 第32-36页 |
| 2.5 讨论 | 第36-40页 |
| 2.6 结论 | 第40-41页 |
| 第3章 靶向MMP14 HPX结构域八肽的噬菌体随机十二肽库筛选 | 第41-50页 |
| 3.1 引言 | 第41页 |
| 3.2 实验材料 | 第41-44页 |
| 3.2.1 主要仪器 | 第41-42页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第42页 |
| 3.2.3 试剂配制 | 第42-44页 |
| 3.3 实验方法 | 第44-47页 |
| 3.3.1 特异性靶标短肽的设计 | 第44页 |
| 3.3.2 宿主菌E.coli ER2738的复苏、培养与保存 | 第44页 |
| 3.3.3 噬菌体滴度测定 | 第44-45页 |
| 3.3.4 噬菌体的扩增 | 第45页 |
| 3.3.5 短肽MMP14的噬菌体随机十二肽库筛选 | 第45-46页 |
| 3.3.6 噬菌体单链NDA测序 | 第46-47页 |
| 3.4 实验结果 | 第47-49页 |
| 3.4.1 特异性靶标短肽的设计 | 第47页 |
| 3.4.2 噬菌体随机十二肽库筛选 | 第47-49页 |
| 3.4.3 结合肤序歹Jl的测定 | 第49页 |
| 3.5 结论 | 第49-50页 |
| 综述 | 第50-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第66页 |
