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烤烟烘烤特性QTL位点发掘研究

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
英文缩略表第11-12页
第一章 引言第12-19页
    1.1 烤烟烘烤特性第12-14页
        1.1.1 烤烟易烤性的评价机制、遗传分析及QTL定位第12-13页
        1.1.2 烤烟耐烤性的评价机制、遗传分析及QTL定位第13-14页
        1.1.3 烤烟整体烘烤特性的评价机制、遗传分析和QTL定位第14页
    1.2 烤烟烘烤特性位点发掘第14-16页
        1.2.1 遗传标记第14-15页
        1.2.2 全基因组重测序第15页
        1.2.3 简化基因组测序第15-16页
    1.3 全基因组关联分析第16-18页
        1.3.1 连锁不平衡第16页
        1.3.2 关联分析的特点第16-17页
        1.3.3 全基因组关联分析第17页
        1.3.4 关联分析的应用第17页
        1.3.5 功能标记的开发第17-18页
    1.4 本研究的目的与意义第18-19页
第二章 烤烟烘烤特性全基因组关联分析第19-37页
    2.1 试验材料和方法第19-24页
        2.1.1 供试烟草种质第19-22页
        2.1.2 田间试验设计第22页
        2.1.3 烤烟易烤性、耐烤性和整体烘烤特性表型鉴定方法第22页
        2.1.4 SNP检测与基因分型第22-23页
        2.1.5 关联分析方法第23-24页
    2.2 结果与分析第24-34页
        2.2.1 烤烟烘烤特性表型鉴定第24-25页
        2.2.2 全基因组关联分析第25-30页
        2.2.3 关联分析与连锁分析的比较第30-33页
        2.2.4 候选基因预测第33-34页
    2.3 讨论第34-37页
        2.3.1 烘烤特性表型分析第34-35页
        2.3.2 基于GWAS的烘烤特性位点发掘第35-36页
        2.3.3 连锁分析与关联分析对比第36页
        2.3.4 候选基因分析第36-37页
第三章 烤烟易烤性分子标记适用性验证第37-45页
    3.1 供试材料第37-39页
        3.1.1 供试分离群体第37页
        3.1.2 供试自然群体第37-38页
        3.1.3 用于易烤性验证的分子标记第38页
        3.1.4 易烤性表型鉴定第38-39页
        3.1.5 总DNA提取及SSR分析第39页
        3.1.6 统计分析方法第39页
    3.2 结果与分析第39-43页
        3.2.1 供试群体易烤性表型鉴定第39-40页
        3.2.2 供试标记的遗传多样性分析第40-41页
        3.2.3 基于分离群体的供试标记选择效率验证第41-42页
        3.2.4 基于自然群体的供试标记选择效率验证第42-43页
    3.3 讨论第43-45页
第四章 全文结论第45-46页
    4.1 烤烟烘烤特性全基因组关联分析第45页
    4.2 烤烟易烤性连锁标记的适用性验证研究第45-46页
参考文献第46-51页
致谢第51-52页
作者简历第52页

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