| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 绪论 | 第18-33页 |
| 1.1 引言 | 第18页 |
| 1.2 禽流感概况 | 第18-21页 |
| 1.2.1 禽流感的病原学 | 第18-19页 |
| 1.2.2 禽流感病毒的血凝活性 | 第19页 |
| 1.2.3 禽流感的历史 | 第19-21页 |
| 1.3 禽流感病毒的分子生物学特性 | 第21-28页 |
| 1.3.1 禽流感病毒形态结构 | 第21-22页 |
| 1.3.2 禽流感病毒基因组的结构及其编码蛋白的功能 | 第22-27页 |
| 1.3.3 禽流感病毒的复制 | 第27页 |
| 1.3.4 禽流感病毒的抗原变异 | 第27-28页 |
| 1.4 禽流感的流行病学 | 第28-31页 |
| 1.4.1 禽流感病毒的宿主 | 第28页 |
| 1.4.2 禽流感的传播 | 第28-29页 |
| 1.4.3 人感染禽流感H7N9、H10N8 | 第29-30页 |
| 1.4.4 禽流感在世界各地野鸟中的分布情况 | 第30-31页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第31-33页 |
| 2 实验1 秦皇岛地区野生鸟类禽流感病毒的监测研究 | 第33-46页 |
| 2.1 实验材料和实验仪器 | 第33-36页 |
| 2.1.1 实验样品 | 第33-35页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第35页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第35页 |
| 2.1.4 SPF鸡胚及SPF鸡红细胞 | 第35-36页 |
| 2.2 实验方法 | 第36-39页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第36页 |
| 2.2.2 样品处理 | 第36页 |
| 2.2.3 病毒分离 | 第36页 |
| 2.2.4 凝实验 | 第36-37页 |
| 2.2.5 RT-PCR实验 | 第37-38页 |
| 2.2.6 AIV血凝素亚型及神经氨酸酶亚型的鉴定 | 第38-39页 |
| 2.3 实验结果 | 第39-42页 |
| 2.3.1 病毒分离结果 | 第39-40页 |
| 2.3.2 病毒亚型鉴定结果 | 第40-41页 |
| 2.3.3 HA和NA亚型分布 | 第41-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-45页 |
| 2.4.1 不同年份病毒分离率差异较大,分离率总体水平较低 | 第42-43页 |
| 2.4.2 不同季节病毒分离率不同,春季分离率最高,秋、冬季毒株亚型最丰富 | 第43页 |
| 2.4.3 不同宿主病毒分离率不同,鸻形目和雁形目分离率相对较高 | 第43-44页 |
| 2.4.4 不同监测点病毒分离率不同,七里海湿地公园分离率最高 | 第44页 |
| 2.4.5 秦皇岛地区流感病毒的优势亚型 | 第44页 |
| 2.4.6 七里海红嘴鸥死亡事件 | 第44-45页 |
| 2.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 3 实验2吉林向海地区野生鸟类禽流感病毒的监测研究 | 第46-59页 |
| 3.1 实验材料和实验仪器 | 第46-47页 |
| 3.1.1 实验样品 | 第46-47页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第47页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第47页 |
| 3.1.4 SPF鸡胚及SPF鸡红细胞 | 第47页 |
| 3.2 实验方法 | 第47-48页 |
| 3.2.1 样品采集 | 第47页 |
| 3.2.2 样品处理 | 第47-48页 |
| 3.2.3 病毒分离 | 第48页 |
| 3.2.4 血凝实验 | 第48页 |
| 3.2.5 RT-PCR实验 | 第48页 |
| 3.2.6 AIV血凝素亚型及神经氨酸酶亚型的鉴定 | 第48页 |
| 3.3 实验结果 | 第48-53页 |
| 3.3.1 病毒分离结果 | 第48-49页 |
| 3.3.2 病毒亚型鉴定结果 | 第49-52页 |
| 3.3.3 HA和NA亚型分布 | 第52-53页 |
| 3.4 讨论 | 第53-57页 |
| 3.4.1 不同年份病毒分离率差异较大,分离率总体水平较高 | 第53-54页 |
| 3.4.2 不同季节病毒分离率不同,秋季分离率最高 | 第54-55页 |
| 3.4.3 不同宿主病毒分离率不同,雁形目鸟类分离到的毒株最多,病毒亚型最丰富 | 第55-56页 |
| 3.4.4 咽拭子和泄殖腔拭子的流感病毒分离率没有明显差异 | 第56页 |
| 3.4.5 吉林向海地区流感病毒的优势亚型 | 第56-57页 |
| 3.4.6 秦皇岛和吉林向海地区流感病毒分离率差异的主要原因 | 第57页 |
| 3.5 本章小结 | 第57-59页 |
| 4 实验3代表性分离株的基因克隆及序列分析 | 第59-170页 |
| 4.1 实验材料和实验仪器 | 第59-61页 |
| 4.1.1 实验样品 | 第59-60页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第60-61页 |
| 4.1.3 实验试剂 | 第61页 |
| 4.2 实验方法 | 第61-64页 |
| 4.2.1 RT-PCR实验 | 第61页 |
| 4.2.2 PCR产物回收和纯化 | 第61-62页 |
| 4.2.3 PCR回收产物鉴定 | 第62页 |
| 4.2.4 连接 | 第62页 |
| 4.2.5 转化 | 第62-63页 |
| 4.2.6 质粒提取 | 第63页 |
| 4.2.7 重组质粒鉴定 | 第63页 |
| 4.2.8 序列测定与分析 | 第63-64页 |
| 4.3 实验结果 | 第64-126页 |
| 4.3.1 病毒基因测序结果 | 第64-65页 |
| 4.3.2 同源性比较结果 | 第65-90页 |
| 4.3.3 进化树 | 第90-114页 |
| 4.3.4 血凝素蛋白裂解位点 | 第114页 |
| 4.3.5 糖基化位点分析 | 第114-124页 |
| 4.3.6 受体结合位点 | 第124-126页 |
| 4.4 讨论 | 第126-169页 |
| 4.4.1 H1基因的分子遗传分析 | 第126-128页 |
| 4.4.2 H2基因的分子遗传分析 | 第128-130页 |
| 4.4.3 H3基因的分子遗传分析 | 第130-132页 |
| 4.4.4 H4基因的分子遗传分析 | 第132-133页 |
| 4.4.5 H5基因的分子遗传分析 | 第133-136页 |
| 4.4.6 H6基因的分子遗传分析 | 第136-138页 |
| 4.4.7 H7基因的分子遗传分析 | 第138-140页 |
| 4.4.8 H9基因的分子遗传分析 | 第140-142页 |
| 4.4.9 H10基凶的分子遗传分析 | 第142-144页 |
| 4.4.10 H13基因的分子遗传分析 | 第144-146页 |
| 4.4.11 H16基因的分子遗传分析 | 第146-148页 |
| 4.4.12 N1基因的分子遗传分析 | 第148-149页 |
| 4.4.13 N2基因的分子遗传分析 | 第149-151页 |
| 4.4.14 N3基因的分子遗传分析 | 第151-152页 |
| 4.4.15 N6基因的分子遗传分析 | 第152-154页 |
| 4.4.16 N7基因的分子遗传分析 | 第154-155页 |
| 4.4.17 N8基因的分子遗传分析 | 第155-157页 |
| 4.4.18 N9基因的分子遗传分析 | 第157-158页 |
| 4.4.19 PB2基因的分子遗传分析 | 第158-160页 |
| 4.4.20 PB1基因的分子遗传分析 | 第160-161页 |
| 4.4.21 PA基因的分子遗传分析 | 第161-163页 |
| 4.4.22 NP基因的分子遗传分析 | 第163-165页 |
| 4.4.23 M基因的分子遗传分析 | 第165-166页 |
| 4.4.24 NS基因的分子遗传分析 | 第166-169页 |
| 4.5 本章小结 | 第169-170页 |
| 结论 | 第170-171页 |
| 参考文献 | 第171-183页 |
| 附录A 秦皇岛地区采样明细表 | 第183-185页 |
| 附录B 吉林向海地区采样明细表 | 第185-187页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第187-188页 |
| 致谢 | 第188-189页 |
| 个人简历 | 第189-190页 |
