嗜热四膜虫基因组重注释及浮萍棘尾虫交配型基因鉴定
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩写词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1.测序技术的发展 | 第12页 |
| 2. 转录组学相关研究 | 第12-16页 |
| 2.1 转录组及其传统测序方法 | 第12-13页 |
| 2.2 新一代转录组测序及分析 | 第13-15页 |
| 2.3 基因组注释 | 第15-16页 |
| 3.可变剪接的研究及进展 | 第16-17页 |
| 4.原生动物——嗜热四膜虫 | 第17-20页 |
| 4.1 原生动物模式生物嗜热四膜虫的研究 | 第18-19页 |
| 4.2 嗜热四膜虫功能基因组学 | 第19-20页 |
| 5.纤毛虫交配型决定机制 | 第20-21页 |
| 6.本研究的意义 | 第21-23页 |
| 第二章 嗜热四膜虫转录组数据的比对及组装 | 第23-29页 |
| 1.材料与方法 | 第23-25页 |
| 1.1 数据来源 | 第23-24页 |
| 1.2 转录组序列的组装 | 第24-25页 |
| 2.结果与分析 | 第25-27页 |
| 2.1 嗜热四膜虫比对结果统计 | 第25页 |
| 2.2 嗜热四膜虫基因组注释结果统计 | 第25-27页 |
| 3.讨论 | 第27-29页 |
| 第三章 嗜热四膜虫基因组重注释 | 第29-41页 |
| 1.材料与方法 | 第29-30页 |
| 1.1 嗜热四膜虫基因组注释模型 | 第29页 |
| 1.2 分析流程及基因筛选标准 | 第29-30页 |
| 2.结果与分析 | 第30-39页 |
| 2.1 基因模型的筛选结果 | 第30-35页 |
| 2.2 新预测基因的功能注释 | 第35页 |
| 2.3 嗜热四膜虫基因组重注释结果统计 | 第35-36页 |
| 2.4 基因组重注释基因长度分析 | 第36-37页 |
| 2.5 基因UTR序列的预测 | 第37-39页 |
| 3.讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 嗜热四膜虫可变剪接基因的鉴定与功能分析 | 第41-49页 |
| 1.材料与方法 | 第41-42页 |
| 1.1 可变剪接基因筛选及其分类 | 第41页 |
| 1.2 可变剪接基因不同生理/发育时期分类 | 第41-42页 |
| 1.3 可变剪接基因功能分析 | 第42页 |
| 2.结果与分析 | 第42-46页 |
| 2.1 可变剪接类型统计鉴定 | 第42-43页 |
| 2.2 不同生理/发育时期可变剪接基因数量统计 | 第43-45页 |
| 2.3 可变剪接基因功能分析 | 第45-46页 |
| 3.讨论 | 第46-49页 |
| 第五章 浮萍棘尾虫交配型基因的筛选 | 第49-57页 |
| 1.材料与方法 | 第49-50页 |
| 1.1 数据来源 | 第49页 |
| 1.2 分析流程 | 第49-50页 |
| 2.结果与分析 | 第50-55页 |
| 2.1 浮萍棘尾虫转录组拼接结果 | 第50-51页 |
| 2.2 转录组数据比对结果 | 第51-54页 |
| 2.3 浮萍棘尾虫交配型相关基因功能分析 | 第54-55页 |
| 3.讨论 | 第55-57页 |
| 第六章 结论 | 第57-60页 |
| 中外文参考文献 | 第60-64页 |
| 在学期间的研究成果 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
