| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 引言 | 第11-21页 |
| 1.1 转录组测序的发展与应用 | 第11-16页 |
| 1.1.1 转录组与转录组学 | 第11-12页 |
| 1.1.2 测序技术的发展 | 第12-15页 |
| 1.1.3 转录组测序的应用 | 第15-16页 |
| 1.2 溶藻弧菌粘附作用相关研究现状及分析 | 第16-19页 |
| 1.2.1 溶藻弧菌的生物学特性和流行病学 | 第16-17页 |
| 1.2.2 粘附研究进展 | 第17-18页 |
| 1.2.3 细菌粘附研究方法 | 第18-19页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第19页 |
| 1.4 主要研究内容 | 第19-21页 |
| 第2章 胁迫培养条件下致病性溶藻弧菌粘附弱化菌株的筛选 | 第21-29页 |
| 2.1 实验材料与方法 | 第21-22页 |
| 2.1.1 实验用菌和鱼 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第21-22页 |
| 2.2 实验方法与步骤 | 第22-24页 |
| 2.2.1 大黄鱼表皮粘液的制备和蛋白含量测定 | 第22页 |
| 2.2.2 溶藻弧菌毒力检测 | 第22页 |
| 2.2.3 致病性溶藻弧菌胁迫培养处理 | 第22-23页 |
| 2.2.4 溶藻弧菌对大黄鱼粘液的粘附作用测定 | 第23-24页 |
| 2.2.5 数据处理 | 第24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-28页 |
| 2.3.1 粘液蛋白含量测定 | 第24-25页 |
| 2.3.2 溶藻弧菌对大黄鱼的半致死浓度LD50 | 第25页 |
| 2.3.3 初次胁迫培养后溶藻弧菌对大黄鱼粘液粘附作用的影响 | 第25-26页 |
| 2.3.4 二次和三次胁迫培养后溶藻弧菌对大黄鱼粘液粘附作用的影响 | 第26-28页 |
| 2.4 讨论 | 第28-29页 |
| 第3章 基于链特异性测序的溶藻弧菌粘附作用转录组学分析 | 第29-46页 |
| 3.1 实验材料 | 第29页 |
| 3.1.1 测序菌株 | 第29页 |
| 3.1.2 主要试剂和仪器 | 第29页 |
| 3.2 实验方法 | 第29-32页 |
| 3.2.1 样品准备与文库构建 | 第29-30页 |
| 3.2.2 Illumina测序和数据处理 | 第30页 |
| 3.2.3 功能注释和DEGs的富集性分析 | 第30-31页 |
| 3.2.4 实验流程和信息分析流程图 | 第31-32页 |
| 3.3 结果与分析 | 第32-44页 |
| 3.3.1 测序质量评估 | 第32-33页 |
| 3.3.2 Reads的比对参考和差异表达基因的统计检验 | 第33-35页 |
| 3.3.3 差异基因的基因本体论（Gene ontology，GO）划分 | 第35-37页 |
| 3.3.4 差异基因的直系同源基因聚簇 | 第37-38页 |
| 3.3.5 KEGG通路注释 | 第38页 |
| 3.3.6 ABC转运子家族基因与粘附分析 | 第38-44页 |
| 3.4 讨论 | 第44-46页 |
| 第4章 结论与展望 | 第46-47页 |
| 4.1 结论 | 第46页 |
| 4.2 展望 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-55页 |
