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芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建及重要基因研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第1章 文献综述第11-24页
    1.1 油菜基因组概况第11-12页
    1.2 油菜基因组作图第12-20页
        1.2.1 遗传图谱第12-14页
        1.2.2 物理图谱第14-15页
        1.2.3 序列图谱第15-20页
    1.3 油菜基因组比较作图第20-21页
    1.4 油菜种皮颜色研究进展第21-22页
    1.5 植物转录因子基因TT8研究进展第22-23页
    1.6 论文选题和研究意义第23-24页
第2章 芥菜型油菜A9染色体遗传图谱构建第24-32页
    2.1 引言第24页
    2.2 材料和方法第24-25页
        2.2.1 供试材料第24页
        2.2.2 DArT标记基因分型第24页
        2.2.3 芥菜型油菜A9染色体遗传图谱构建第24-25页
        2.2.4 油菜A9染色体图谱比较第25页
    2.3 结果与分析第25-26页
        2.3.1 芥菜型油菜遗传图谱构建第25页
        2.3.2 油菜A9染色体图谱比较第25-26页
    2.4 讨论第26-32页
        2.4.1 芸薹属A9染色体高度同源第26-27页
        2.4.2 异源四倍体芥菜型油菜和甘蓝型油菜A9染色体着丝粒附近区域存在倒位第27-32页
第3章 芥菜型油菜A9染色体物理图绘制第32-46页
    3.1 引言第32页
    3.2 材料和方法第32-35页
        3.2.1 供试材料第32页
        3.2.2 芥菜型油菜BAC文库构建第32页
        3.2.3 基于PCR的BAC文库筛选第32-33页
        3.2.4 BAC重叠群构建第33页
        3.2.5 BAC末端序列分析第33页
        3.2.6 BAC克隆插入片段长度检测第33-34页
        3.2.7 BAC克隆全长测序第34页
        3.2.8 BAC重叠群序列注释第34-35页
        3.2.9 芥菜型油菜与甘蓝型油菜和白菜分歧时间估算第35页
    3.3 结果与分析第35-44页
        3.3.1 芥菜型油菜BAC文库构建第35页
        3.3.2 芥菜型油菜A9染色体BAC重叠群构建第35-36页
        3.3.3 BAC全长测序及序列拼接第36-38页
        3.3.4 黄籽基因区域BAC重叠群序列同源比较第38页
        3.3.5 BAC重叠群序列注释第38-44页
        3.3.6 芸薹属A基因组分歧时间估算第44页
    3.4 讨论第44-46页
        3.4.1 基于PCR的芥菜型油菜BAC重叠群构建第44-45页
        3.4.2 芸薹属植物A9染色体进化差异第45-46页
第4章 芥菜型油菜TT8等位基因分析和功能研究第46-61页
    4.1 引言第46页
    4.2 材料和方法第46-54页
        4.2.1 供试材料第46-51页
        4.2.2 基因组DNA和总RNA的提取第51页
        4.2.3 引物设计第51-52页
        4.2.4 芥菜型油菜TT8等位基因克隆及分析第52页
        4.2.5 芥菜型油菜TT8 CDS获取及pGADT7载体的构建第52-53页
        4.2.6 芥菜型油菜DFR、ANS和BAN基因启动子获取及pHIS2载体的构建第53页
        4.2.7 酵母单杂交体系第53-54页
    4.3 结果与分析第54-59页
        4.3.1 芥菜型油菜TT8等位基因分析第54-55页
        4.3.2 芥菜型油菜DFR、ANS和BAN基因启动子序列分析第55-58页
        4.3.3 芥菜型油菜TT8基因与DFR、ANS和BAN基因启动子序列互作第58-59页
    4.4 讨论第59-61页
        4.4.1 芥菜型油菜黄籽起源第59-60页
        4.4.2 TT8基因双突变导致黄籽形成第60-61页
第5章 芥菜型油菜TT4基因克隆第61-68页
    5.1 引言第61页
    5.2 材料和方法第61-62页
        5.2.1 供试材料第61页
        5.2.2 引物设计第61-62页
        5.2.3 芥菜型油菜TT4基因全长序列克隆及染色体位置预测第62页
        5.2.4 芥菜型油菜TT4基因序列进化分析和同源基因鉴定第62页
        5.2.5 芥菜型黄黑籽种皮中TT4基因表达分析第62页
    5.3 结果与分析第62-66页
        5.3.1 芥菜型油菜TT4基因的BAC克隆筛选第62-63页
        5.3.2 芥菜型油菜TT4基因序列及分析第63-66页
        5.3.3 芥菜型油菜TT4基因在种皮中的表达分析第66页
    5.4 讨论第66-68页
第6章 结论与展望第68-70页
    6.1 本研究完成的主要工作和研究结论第68-69页
    6.2 后续研究展望第69-70页
参考文献第70-82页
附录第82-90页
缩写词第90-91页
致谢第91-92页
作者简介第92页

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