| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-7页 |
| 缩略表 | 第8-14页 |
| 第1章 研究背景 | 第14-25页 |
| 1.1 引言 | 第14-15页 |
| 1.2 小桐子的干旱胁迫伤害 | 第15-17页 |
| 1.2.1 生长趋势减缓 | 第15页 |
| 1.2.2 光合作用减弱 | 第15-16页 |
| 1.2.3 膜透性改变 | 第16页 |
| 1.2.4 内源激素代谢失调 | 第16-17页 |
| 1.3.小桐子抗旱性机制研究进展 | 第17-21页 |
| 1.3.1 小桐子的避旱性 | 第17-18页 |
| 1.3.2 小桐子耐旱性形成的机制 | 第18-21页 |
| 1.3.2.1 渗透调节 | 第18-19页 |
| 1.3.2.2 抗氧化系统 | 第19-20页 |
| 1.3.2.3 激素的调控 | 第20页 |
| 1.3.2.4 光保护机制 | 第20-21页 |
| 1.4 干旱锻炼提高植物耐旱性 | 第21页 |
| 1.5 本论文的研究目的及主要研究内容 | 第21-22页 |
| 1.6 研究特色 | 第22-24页 |
| 1.7 研究技术路线 | 第24-25页 |
| 第2章 小桐子干旱胁迫响应和适应过程的转录组及数字表达谱分析 | 第25-58页 |
| 2.1 引言 | 第25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-29页 |
| 2.2.1 植物材料培养 | 第25页 |
| 2.2.2 处理方法 | 第25-26页 |
| 2.2.2.1 干旱锻炼处理 | 第25页 |
| 2.2.2.2 空气干旱胁迫处理 | 第25-26页 |
| 2.2.3 待测材料的制备 | 第26页 |
| 2.2.4 构建文库 | 第26-27页 |
| 2.2.5 文库的测序 | 第27-28页 |
| 2.2.6 序列的功能注释 | 第28页 |
| 2.2.7 基因的表达定量 | 第28页 |
| 2.2.8 差异表达基因 （differentially expressed genes ,DEGs）筛选 | 第28页 |
| 2.2.9 GO富集分析 | 第28-29页 |
| 2.2.10 Pathway分析 | 第29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-54页 |
| 2.3.1 RNA-seq测序数据比对和质控 | 第29-33页 |
| 2.3.1.1 RNA-seq测序数据量汇总 | 第29-30页 |
| 2.3.1.2 RNA-seq测序数据比对 | 第30-31页 |
| 2.3.1.3 RNA-seq测序数据的质控 | 第31-33页 |
| 2.3.2 基因定量分析 | 第33页 |
| 2.3.3 生物学重复性分析 | 第33-35页 |
| 2.3.4 小桐子干旱胁迫下差异表达基因的鉴定 | 第35-36页 |
| 2.3.5 小桐子干旱胁迫代谢或信号转导途径差异基因的聚类分析 | 第36-38页 |
| 2.3.6 DEGs的GO（Gene Ontology）富集分析 | 第38-39页 |
| 2.3.7 DEGs的Pathway显著性富集分析 | 第39-41页 |
| 2.3.8 小桐子抗旱性相关差异表达基因的鉴定 | 第41-52页 |
| 2.3.8.1 抗逆相关蛋白 | 第41-43页 |
| 2.3.8.2 抗氧化系统相应基因分析 | 第43-45页 |
| 2.3.8.3 渗透调节物质基因分析 | 第45页 |
| 2.3.8.4 光合系统相关基因分析 | 第45-47页 |
| 2.3.8.5 激素生物合成和信号转导途径相关基因 | 第47-48页 |
| 2.3.8.6 卡尔文循环、糖酵解和三羧酸循环差异表达基因分析 | 第48-50页 |
| 2.3.8.7 脂肪酸和蜡生物合成 | 第50-51页 |
| 2.3.8.8 干旱胁迫响应转录因子分析 | 第51-52页 |
| 2.3.9 DS72和CDS72的Pathway显著性富集分析 | 第52-54页 |
| 2.4 讨论 | 第54-58页 |
| 第3章 小桐子干旱锻炼及空气干旱胁迫中差异基因的时空表达分析 | 第58-68页 |
| 3.1 引言 | 第58页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第58-62页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第58页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第58-62页 |
| 3.2.2.1 RNA的提取和检测 | 第58-59页 |
| 3.2.2.2 c DNA中第一链的合成 | 第59页 |
| 3.2.2.3 引物设计 | 第59-60页 |
| 3.2.2.4 q RT-PCR验证 | 第60-62页 |
| 3.3 结果 | 第62-67页 |
| 3.3.1 总RNA的提取和逆转录成cDNA | 第62-63页 |
| 3.3.2 22 个候选基因qRT-PCR和RNA-seq的表达量变化分析 | 第63-65页 |
| 3.3.3 干旱锻炼条件下抗旱相关基因qRT-PCR和RNA-seq相关性结果分析 | 第65-67页 |
| 3.4 讨论 | 第67-68页 |
| 第4章 小桐子Jc LEA4基因克隆及表达和功能分析 | 第68-85页 |
| 4.1 引言 | 第68-69页 |
| 4.2 材料与方法 | 第69-75页 |
| 4.2.1 实验所需及待测材料 | 第69-70页 |
| 4.2.2 实验处理及待测材料制备 | 第70页 |
| 4.2.3 实验试剂 | 第70-71页 |
| 4.2.4 实验仪器设备 | 第71页 |
| 4.2.5 实验方法 | 第71-75页 |
| 4.2.5.1 总RNA的提取及反转录 | 第71页 |
| 4.2.5.2 小桐子Jc LEA4基因荧光定量表达分析 | 第71-72页 |
| 4.2.5.3 JcLEA4基因全长克隆 | 第72-73页 |
| 4.2.5.4 酵母表达载体pYES2-JcLEA4的构建 | 第73-74页 |
| 4.2.5.5 重组质粒pYES2-JcLEA4的酵母转化及鉴定 | 第74-75页 |
| 4.3 结果与分析 | 第75-83页 |
| 4.3.1 Jc LEA4基因CDS克隆 | 第75-76页 |
| 4.3.2 Jc LEA4基因序列分析 | 第76-78页 |
| 4.3.3 Jc LEA4蛋白的系统进化树分析 | 第78-80页 |
| 4.3.4 Jc LEA4基因在逆境条件下的表达分析 | 第80-81页 |
| 4.3.5 重组酵母菌的抗旱性初步分析 | 第81-83页 |
| 4.4 讨论 | 第83-85页 |
| 第5章 小桐子一个新的GDSL酯酶/脂肪酶基因JcGLIP的克隆及功能表达分析 | 第85-99页 |
| 5.1 引言 | 第85-86页 |
| 5.2 材料与方法 | 第86-90页 |
| 5.2.1 实验材料（同 4.2.1） | 第86页 |
| 5.2.2 实验试剂（同 4.2.2） | 第86页 |
| 5.2.3 实验仪器设备（同 4.2.3） | 第86页 |
| 5.2.4 实验方法 | 第86-90页 |
| 5.2.4.1 总RNA的提取及反转录（同 4.2.5.1） | 第86页 |
| 5.2.4.2 小桐子Jc GLIP基因荧光定量表达分析 | 第86页 |
| 5.2.4.3 JcGLIP基因全长克隆 | 第86-89页 |
| 5.2.4.4 酵母表达载体pYES2-JcGLIP的构建 | 第89-90页 |
| 5.2.4.5 重组质粒pYES2-JcGLIP的酵母转化及鉴定 | 第90页 |
| 5.3 结果与分析 | 第90-97页 |
| 5.3.1 小桐子JcGLIP基因克隆与序列分析 | 第90-93页 |
| 5.3.2 Jc GLIP蛋白的系统进化树分析 | 第93-94页 |
| 5.3.3 Jc GLIP基因在逆境条件下的表达分析 | 第94-95页 |
| 5.3.4 Jc GLIP重组酵母菌的抗旱性初步分析 | 第95-97页 |
| 5.4 讨论 | 第97-99页 |
| 第6章 研究结论与展望 | 第99-103页 |
| 6.1 研究结论 | 第99-101页 |
| 6.2 研究展望 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
| 课题资助及论文发表情况 | 第111页 |
