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青海湖嗜盐菌多样性与四氢嘧啶的生物合成机制研究

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一章 绪论第14-34页
    1.1 嗜盐微生物第14-25页
        1.1.1 高盐环境多样性第14-15页
        1.1.2 嗜盐微生物分类学(Taxonomy)第15-18页
        1.1.3 渗透压适应机制第18-24页
        1.1.4 嗜盐微生物的生物技术应用第24-25页
    1.2 相溶物质四氢嘧啶第25-32页
        1.2.1 四氢嘧啶的生化特征第25页
        1.2.2 四氢嘧啶的生物代谢途径第25-26页
        1.2.3 ectABC基因簇多样性第26-27页
        1.2.4 doeABCD基因簇多样性第27-29页
        1.2.5 四氢嘧啶合成转录调节第29-30页
        1.2.6 四氢嘧啶工业生产菌株第30-31页
        1.2.7 四氢嘧啶的过量化生产策略第31-32页
        1.2.8 四氢嘧啶的实际应用第32页
    1.3 本研究的立题依据及研究意义第32-34页
第二章 实验材料与方法第34-45页
    2.1 实验材料第34-37页
        2.1.1 菌株与质粒第34页
        2.1.2 主要化学试剂第34页
        2.1.3 培养基第34-35页
        2.1.4 引物第35页
        2.1.5 常用储存液第35-36页
        2.1.6 主要仪器第36页
        2.1.7 常用分子生物学分析软件第36-37页
    2.2 实验方法第37-45页
        2.2.1 样品来源与分离第37-38页
        2.2.2 耐盐梯度与生长特性试验第38页
        2.2.3 基因组DNA抽提、16S rRNA基因PCR扩增与测序第38页
        2.2.4 构建系统发育树第38页
        2.2.5 种群多样性分析第38-39页
        2.2.6 生理生化特性研究第39页
        2.2.7 乙醇法抽提胞内四氢嘧啶第39页
        2.2.8 薄层层析法(TLC)与HPLC定量检测分析第39页
        2.2.9 金属离子影响四氢嘧啶积聚第39-40页
        2.2.10 温度与pH影响四氢嘧啶积聚第40页
        2.2.11 16S rRNA基因PCR-RFLP分析第40页
        2.2.12 16S-23S rRNA ISR多态性分析第40页
        2.2.13 全菌体蛋白SDS-PAGE分析第40-41页
        2.2.14 保守ectB基因的PCR扩增第41页
        2.2.15 染色体步移法扩增ectB基因的侧翼序列第41-42页
        2.2.16 基因簇全序列分析第42页
        2.2.17 重组表达载体的构建第42页
        2.2.18 制备E.coli菌株感受态细胞第42-43页
        2.2.19 重组基因的连接第43页
        2.2.20 重组质粒的转化第43页
        2.2.21 重组质粒的酶切鉴定第43-44页
        2.2.22 基因的诱导表达与SDS-PAGE分析第44-45页
第三章 结果分析与讨论第45-96页
    3.1 青海湖可培养嗜盐微生物系统发育与种群多样性第45-59页
        3.1.1 青海湖嗜盐菌的形态特征和分类第45-49页
        3.1.2 中度嗜盐菌的生长与生理生化特性第49-51页
        3.1.3 青海湖嗜盐微生物的种群系统发育第51-57页
        3.1.4 总结与讨论第57-59页
    3.2 青海湖优势种群Halomonas的种间多样性分析第59-66页
        3.2.1 青海湖优势种群Halomonas的生长特性第59-61页
        3.2.2 青海湖盐单胞菌属的分子鉴定与典型特征分析第61-62页
        3.2.3 青海湖盐单胞菌属的系统发育分析第62-64页
        3.2.4 总结与讨论第64-66页
    3.3 相溶物质四氢嘧啶的积聚检测与影响因素分析第66-76页
        3.3.1 青海湖中度嗜盐菌的四氢嘧啶的积聚分析第66-69页
        3.3.2 菌株H ventosae QHL5胞内积聚四氢嘧啶影响因素研究第69-74页
        3.3.3 总结与讨论第74-76页
    3.4 四氢嘧啶生物合成基因簇ectABC的特征与结构第76-86页
        3.4.1 青海湖盐单胞菌QHL1的四氢嘧啶生物合成特性第76-77页
        3.4.2 盐单胞菌QHL1基因簇ectABC的克隆第77-81页
        3.4.3 启动子预测比对和ect操纵子的结构分析第81-84页
        3.4.4 总结与讨论第84-86页
    3.5 四氢嘧啶生物合成基因的克隆表达与构建基因工程菌第86-94页
        3.5.1 盐单胞菌Halomonas sp.QHL1 ectA/B/C基因克隆第86-89页
        3.5.2 克隆表达基因簇ectABC第89-91页
        3.5.3 重组工程菌耐盐能力与Ectoine积聚量检测第91-92页
        3.5.4 总结与讨论第92-94页
    3.6 结论与展望第94-96页
参考文献第96-106页
主要贡献与创新点第106-107页
攻读学位期间发表的学术论文第107-108页
衷心感谢以下基金资助第108-109页
致谢第109页

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