| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第12页 |
| 1.2 肠道菌群的研究进展 | 第12-17页 |
| 1.2.1 肠道菌群的认识 | 第12-13页 |
| 1.2.2 肠道菌群的分类 | 第13页 |
| 1.2.2.1 与宿主共生的生理性菌群 | 第13页 |
| 1.2.2.2 与宿主共栖的条件致病菌 | 第13页 |
| 1.2.2.3 病原菌 | 第13页 |
| 1.2.3 肠道菌群的作用 | 第13-15页 |
| 1.2.3.1 消化吸收 | 第13-14页 |
| 1.2.3.2 屏障功能 | 第14页 |
| 1.2.3.3 影响机能代谢 | 第14-15页 |
| 1.2.4 影响肠道菌群的因素 | 第15-16页 |
| 1.2.4.1 遗传因素 | 第15页 |
| 1.2.4.2 饮食因素 | 第15页 |
| 1.2.4.3 年龄因素 | 第15-16页 |
| 1.2.4.4 环境因素 | 第16页 |
| 1.2.4.5 药物因素 | 第16页 |
| 1.2.4.6 疾病因素 | 第16页 |
| 1.2.5 肠道菌群研究方法 | 第16-17页 |
| 1.3 中药与益生菌及热应激对肠道菌群的影响 | 第17-18页 |
| 1.3.1 中药对肠道菌群的影响 | 第17-18页 |
| 1.3.2 益生素对肠道菌群的影响 | 第18页 |
| 1.3.3 热应激对肠道菌群的影响 | 第18页 |
| 1.4 中药与益生素对热应激下肉鸡的影响 | 第18-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-30页 |
| 2.1 试验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第20页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第20-21页 |
| 2.1.3 试验药品与试剂 | 第21页 |
| 2.2 试验方法 | 第21-23页 |
| 2.2.1 中药复方煎液的组成 | 第21页 |
| 2.2.2 动物分组与饲养情况 | 第21-22页 |
| 2.2.3 试验日粮 | 第22-23页 |
| 2.3 测定指标与检测方法 | 第23页 |
| 2.3.1 生产性能的测定 | 第23页 |
| 2.3.2 血清相关指标测定 | 第23页 |
| 2.3.2.1 血清生化指标的测定 | 第23页 |
| 2.3.2.2 血清热休克蛋白、皮质醇的测定 | 第23页 |
| 2.3.3 盲肠切片的制作与观察 | 第23页 |
| 2.4 肠道菌群与多样性检测 | 第23-29页 |
| 2.4.1 肠道内容物采集 | 第23页 |
| 2.4.2 肠道内容物DNA的抽提 | 第23-24页 |
| 2.4.3 抽提样本DNA质检 | 第24-25页 |
| 2.4.4 构建 16S rDNA测序文库 | 第25页 |
| 2.4.5 上机测序 | 第25页 |
| 2.4.6 测序数据进行生物信息学分析 | 第25-29页 |
| 2.4.6.1 Reads拼接 | 第26页 |
| 2.4.6.2 去除嵌合体及短序列分析 | 第26-27页 |
| 2.4.6.3 OTU统计分析及注释 | 第27页 |
| 2.4.6.4 Alpha多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.4.6.5 Beta多样性分析 | 第28-29页 |
| 2.4.6.6 群落组成分析及组间显著性分析 | 第29页 |
| 2.4.6.7 群落功能差异分析 | 第29页 |
| 2.5 数据统计 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-55页 |
| 3.1 中药复方和益生素对热应激下肉鸡盲肠肠道菌群的影响 | 第30-50页 |
| 3.1.1 样品丰度与多样性分析 | 第30-32页 |
| 3.1.2 Alpha多样性分析 | 第32-35页 |
| 3.1.3 Beta多样性分析 | 第35-40页 |
| 3.1.3.1 主成分分析PCA | 第35-37页 |
| 3.1.3.2 主坐标分析PCoA | 第37-40页 |
| 3.1.4 样品微生物群落组成分析 | 第40-49页 |
| 3.1.4.1 门水平上的物种丰度差异 | 第40-43页 |
| 3.1.4.2 纲水平上的物种丰度差异 | 第43页 |
| 3.1.4.3 目水平上的物种丰度差异 | 第43-44页 |
| 3.1.4.4 科水平上的物种丰度差异 | 第44-45页 |
| 3.1.4.5 属水平上的物种丰度差异 | 第45-49页 |
| 3.1.5 肠道群落功能差异分析 | 第49-50页 |
| 3.2 中药复方和益生素对热应激下肉鸡盲肠组织形态结构的影响 | 第50页 |
| 3.3 中药复方与益生素对热应激下肉鸡生长性能的影响 | 第50-52页 |
| 3.4 中药复方与益生素对热应激下肉鸡血液生化指标的影响 | 第52-54页 |
| 3.5 中药复方与益生素对热应激下肉鸡血清HSPs70与Cro的影响 | 第54-55页 |
| 4 讨论 | 第55-60页 |
| 4.1 中药复方与益生素对热应激下肉鸡肠道菌群的影响 | 第55-57页 |
| 4.2 中药和益生素对热应激下盲肠组织形态结构的影响 | 第57-58页 |
| 4.3 中药和益生素对热应激下肉鸡生长性能的影响 | 第58页 |
| 4.4 中药和益生素对热应激下血生化指标的影响 | 第58-59页 |
| 4.5 中药和益生素对热应激下热休克蛋白和皮质醇的影响 | 第59-60页 |
| 5 结论 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-74页 |
| 附录 | 第74页 |
