| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一部分 疣猴亚科相关毛色基因分析 | 第10-28页 |
| 第一章 前言 | 第10-15页 |
| 1.1 动物毛色的研究进展 | 第10-13页 |
| 1.1.1 黑色素的形成 | 第10-11页 |
| 1.1.2 黑色素形成的相关基因 | 第11-13页 |
| 1.2 疣猴亚科概述 | 第13-14页 |
| 1.2.1 疣猴亚科简介 | 第13-14页 |
| 1.2.2 疣猴亚科各物种的毛色特征 | 第14页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| 第二章 材料和方法 | 第15-21页 |
| 2.1 实验样品 | 第15页 |
| 2.2 主要仪器与试剂 | 第15-16页 |
| 2.3 实验方法 | 第16-21页 |
| 2.3.1 样品DNA全基因组的扩增 | 第16页 |
| 2.3.2 引物的设计与合成 | 第16-17页 |
| 2.3.3 各基因编码区序列测序结果的获得 | 第17-19页 |
| 2.3.4 测序结果分析 | 第19-21页 |
| 第三章 结果 | 第21-26页 |
| 3.1 样品DNA全基因扩增结果 | 第21页 |
| 3.2 引物的设计与合成 | 第21页 |
| 3.2.1 同源基因的获得 | 第21页 |
| 3.2.2 引物的设计与合成 | 第21页 |
| 3.3 测序结果 | 第21-26页 |
| 3.3.1 编码区序列的获得 | 第21-24页 |
| 3.3.2 祖先序列的计算 | 第24页 |
| 3.3.3 碱基及氨基酸变化 | 第24-25页 |
| 3.3.4 正选择位点的筛选 | 第25-26页 |
| 第四章 讨论 | 第26-28页 |
| 4.1 样品的选择 | 第26页 |
| 4.2 碱基及氨基酸变化分析 | 第26-27页 |
| 4.3 正选择分析 | 第27-28页 |
| 第二部分 采用HRM技术筛选川金丝猴SNP位点及个体识别 | 第28-55页 |
| 第一章 综述 | 第28-36页 |
| 1.1 川金丝猴的研究概述 | 第28-29页 |
| 1.1.1 川金丝猴的分布及生物学特征 | 第28页 |
| 1.1.2 川金丝猴的研究现状 | 第28-29页 |
| 1.2 单核苷酸多态性位点 | 第29-35页 |
| 1.2.1 分子标记的发展简介 | 第29-30页 |
| 1.2.2 单核苷酸多态性的概念和分类 | 第30页 |
| 1.2.3 单核苷酸多态性标记的特点 | 第30-31页 |
| 1.2.4 单核苷酸多态性标记的应用 | 第31-32页 |
| 1.2.5 单核苷酸多态性的检测技术 | 第32-33页 |
| 1.2.6 高分辨率熔解曲线(High resolution Melting,HRM) | 第33-35页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第35-36页 |
| 第二章 材料与方法 | 第36-43页 |
| 2.1 样品收集 | 第36页 |
| 2.2 主要仪器与试剂 | 第36页 |
| 2.3 实验方法 | 第36-43页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第36-38页 |
| 2.3.2 候选SNP位点的筛选 | 第38页 |
| 2.3.3 引物设计与合成 | 第38-39页 |
| 2.3.4 HRM的反应条件 | 第39页 |
| 2.3.5 SNP位点引物的筛选 | 第39-40页 |
| 2.3.6 HRM分型 | 第40页 |
| 2.3.7 HRM分型检测数据分析 | 第40-41页 |
| 2.3.8 粪便样品的个体识别 | 第41-43页 |
| 第三章 结果与分析 | 第43-51页 |
| 3.1 基因组DNA的提取 | 第43-44页 |
| 3.1.1 肝脏组织样品基因组DNA的提取 | 第43页 |
| 3.1.2 粪便样品基因组DNA的提取 | 第43-44页 |
| 3.2 候选SNP位点的筛选 | 第44页 |
| 3.3 引物设计与合成 | 第44页 |
| 3.4 HRM的反应条件 | 第44-45页 |
| 3.4.1 普通PCR确定引物退火温度范围 | 第44-45页 |
| 3.4.2 HRM的退火温度与Mg~+浓度的确定 | 第45页 |
| 3.5 SNP位点引物的筛选 | 第45-46页 |
| 3.6 HRM分型 | 第46-49页 |
| 3.6.1 HRM分型的验证 | 第46-47页 |
| 3.6.2 粪便样品分型及分析 | 第47-49页 |
| 3.7 SNP位点的个体识别应用 | 第49-51页 |
| 3.7.1 粪便样品个体识别 | 第49页 |
| 3.7.2 SNP位点的个体识别能力 | 第49-51页 |
| 第四章 讨论 | 第51-55页 |
| 4.1 关于实验样品的选择 | 第51页 |
| 4.2 HRM分型 | 第51-53页 |
| 4.2.1 HRM分型的敏感性和特异性 | 第51-52页 |
| 4.2.2 HRM基因分型的优势 | 第52-53页 |
| 4.3 SNP位点的应用 | 第53-55页 |
| 4.3.1 个体识别 | 第53-54页 |
| 4.3.2 其他应用 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 附表 | 第62-76页 |
| 读研期间发表的论文 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |