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大豆油脂合成基因家族的适应性进化研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
引言第10-11页
第1章 文献综述第11-20页
    1.1 植物油脂第11-13页
        1.1.1 植物油脂简介第11页
        1.1.2 植物油脂合成途径第11-13页
    1.2 油脂合成关键基因的研究第13-15页
        1.2.1 乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)第13-14页
        1.2.2 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)第14页
        1.2.3 转录因子的研究第14-15页
    1.3 生物信息学第15-17页
        1.3.1 基因组学第15-16页
        1.3.2 基因家族第16页
        1.3.3 基因组加倍第16-17页
        1.3.4 自然选择第17页
    1.4 研究大豆油脂合成基因家族的意义第17-20页
        1.4.1 大豆的广泛用途第17-18页
        1.4.2 大豆供求现状及中国大豆市场面临的严峻问题第18-20页
第2章 物种中油脂合成基因分布及系统发育分析第20-27页
    2.1 研究方法第20-22页
        2.1.1 确定研究对象及其系统发育关系第20页
        2.1.2 获取并处理基因组数据第20-22页
        2.1.3 确定油脂合成基因家族成员第22页
        2.1.4 油脂合成基因的系统发育分析第22页
    2.2 结果与分析第22-25页
        2.2.1 油脂合成基因家族成员的确定及分布情况第22-24页
        2.2.2 每个物种中油脂合成相关基因相对于葡萄的丢失率第24-25页
        2.2.3 油脂合成基因的系统发育分析第25页
    2.3 本章小结第25-27页
第3章 基因组加倍和油脂合成基因的关联性分析第27-37页
    3.1 研究方法第27页
        3.1.1 基因组结构解析第27页
        3.1.2 大豆油脂合成基因的相似性分析第27页
        3.1.3 大豆油脂合成基因中重复基因分析第27页
    3.2 结果与分析第27-36页
        3.2.1 基因组结构解析第28-35页
        3.2.2 大豆油脂合成基因的相似性分析第35-36页
        3.2.3 大豆油脂合成基因中重复基因分析第36页
    3.3 本章小结第36-37页
第4章 油脂合成基因的适应性进化分析第37-49页
    4.1 材料与方法第37-39页
        4.1.1 部分油脂合成基因的系统发育分析第37-38页
        4.1.2 正选择分析第38-39页
        4.1.3 基因置换分析第39页
    4.2 结果与分析第39-48页
        4.2.1 油脂合成基因的系统发育分析第39-41页
        4.2.2 基因正选择分析第41-45页
        4.2.3 基因置换分析第45-48页
    4.3 本章小结第48-49页
第5章 大豆中油脂储存基因的生物信息学分析第49-54页
    5.1 材料与方法第49页
        5.1.1 油脂储存基因的结构分析第49页
        5.1.2 大豆中油脂储存蛋白质的生物信息学分析第49页
        5.1.3 油脂储存功能相关基因系统发育分析第49页
    5.2 结果与分析第49-52页
        5.2.1 大豆油脂储存基因信息第49-50页
        5.2.2 大豆油脂储存蛋白质一级结构分析第50-51页
        5.2.3 大豆油脂储存蛋白质二级结构预测分析第51-52页
        5.2.4 大豆油脂储存基因系统发育分析第52页
    5.3 本章小结第52-54页
结论第54-55页
参考文献第55-64页
附录A 大豆中油脂合成基因第64-72页
致谢第72-73页
导师简介第73-74页
作者简介第74-75页
学位论文数据集第75页

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