摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
缩略词表 | 第10-11页 |
引言 | 第11-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-25页 |
1.1 小麦胚乳淀粉组成及结构 | 第12-14页 |
1.1.1 胚乳淀粉的组成 | 第12-13页 |
1.1.2 胚乳淀粉的结构 | 第13-14页 |
1.1.3 小麦直支链淀粉的区别 | 第14页 |
1.2 小麦淀粉合成中的几种关键酶 | 第14-20页 |
1.2.1 ADP葡萄糖的合成 | 第15页 |
1.2.2 淀粉合成酶和淀粉分支酶酶学研究 | 第15-20页 |
1.3 植物中SNP的研究现状 | 第20-22页 |
1.3.1 SNP的概念 | 第20页 |
1.3.2 SNP的研究方法 | 第20-21页 |
1.3.3 SNP在植物研究中的应用 | 第21-22页 |
1.4 SNP与关联分析 | 第22-24页 |
1.4.1 LD连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD) | 第23页 |
1.4.2 关联分析的应用 | 第23-24页 |
1.4.3 基于SNP的关联分析在植物中的应用 | 第24页 |
1.5 本研究的目的与意义 | 第24-25页 |
第二章 材料与方法 | 第25-33页 |
2.1 试验材料、试剂及仪器 | 第25-26页 |
2.1.1 试验材料 | 第25-26页 |
2.1.2 试验试剂 | 第26页 |
2.1.3 试验仪器 | 第26页 |
2.2 实验方法 | 第26-33页 |
2.2.1 小麦籽粒直、支链淀粉含量的测定 | 第26-27页 |
2.2.2 小麦基因组DNA的提取 | 第27页 |
2.2.3 小麦籽粒RNA提取及cDNA合成 | 第27-28页 |
2.2.4 目的基因克隆 | 第28页 |
2.2.5 扩增片段电泳检测及回收 | 第28页 |
2.2.6 目的片段与pEASY-T载体的连接转化 | 第28-29页 |
2.2.7 质粒DNA提取 | 第29页 |
2.2.8 阳性重组子筛选及酶切验证 | 第29-30页 |
2.2.9 生物信息学分析 | 第30页 |
2.2.10 特异PCR引物设计 | 第30-32页 |
2.2.11 统计学分析 | 第32-33页 |
第三章 结果与分析 | 第33-42页 |
3.1 小麦籽粒淀粉含量及差异分析 | 第33页 |
3.2 淀粉合成关键酶基因克隆及生物信息学分析 | 第33-37页 |
3.2.1 SSⅡa基因克隆及序列结构分析 | 第33-37页 |
3.2.2 SBEⅡa和SBEⅡb基因克隆及序列结构分析 | 第37页 |
3.3 SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因序列多态性及单倍型分析 | 第37-40页 |
3.3.1 基因序列多态性分析 | 第37-39页 |
3.3.2 基因编码区核苷酸多态性分析 | 第39页 |
3.3.3 基因序列单倍型分析 | 第39-40页 |
3.4 SNP检测及与淀粉含量的关联分析 | 第40-42页 |
3.4.1 SNP分型结果 | 第40页 |
3.4.2 基因型和等位基因频率分析 | 第40-41页 |
3.4.3 SSⅡa-rs31 位点和 SBEⅡa-rs10 位点多态性与支链淀粉含量关联分析 | 第41-42页 |
第四章 讨论与结论 | 第42-46页 |
4.1 影响SNP检测的两个因素 | 第42页 |
4.1.1 实验材料的选取 | 第42页 |
4.1.2 基因组DNA的提取 | 第42页 |
4.2 SNP的检测方法 | 第42-43页 |
4.3 SSIIa基因序列差异对淀粉含量的影响 | 第43页 |
4.4 SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb编码区核苷酸多态性 | 第43-44页 |
4.5 SNP多态性与淀粉含量的相关关系 | 第44-45页 |
4.6 SNP多态性关联分析总结与展望 | 第45页 |
4.7 结论 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-53页 |
附表 1 材料名称及来源 | 第53-55页 |
附表 2 SNP 扩增引物 | 第55-58页 |
作者简介 | 第58-59页 |
致谢 | 第59-60页 |
附件 | 第60页 |