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小麦淀粉合成关键酶基因SNP多态性及与淀粉合成的相关分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
缩略词表第10-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-25页
    1.1 小麦胚乳淀粉组成及结构第12-14页
        1.1.1 胚乳淀粉的组成第12-13页
        1.1.2 胚乳淀粉的结构第13-14页
        1.1.3 小麦直支链淀粉的区别第14页
    1.2 小麦淀粉合成中的几种关键酶第14-20页
        1.2.1 ADP葡萄糖的合成第15页
        1.2.2 淀粉合成酶和淀粉分支酶酶学研究第15-20页
    1.3 植物中SNP的研究现状第20-22页
        1.3.1 SNP的概念第20页
        1.3.2 SNP的研究方法第20-21页
        1.3.3 SNP在植物研究中的应用第21-22页
    1.4 SNP与关联分析第22-24页
        1.4.1 LD连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)第23页
        1.4.2 关联分析的应用第23-24页
        1.4.3 基于SNP的关联分析在植物中的应用第24页
    1.5 本研究的目的与意义第24-25页
第二章 材料与方法第25-33页
    2.1 试验材料、试剂及仪器第25-26页
        2.1.1 试验材料第25-26页
        2.1.2 试验试剂第26页
        2.1.3 试验仪器第26页
    2.2 实验方法第26-33页
        2.2.1 小麦籽粒直、支链淀粉含量的测定第26-27页
        2.2.2 小麦基因组DNA的提取第27页
        2.2.3 小麦籽粒RNA提取及cDNA合成第27-28页
        2.2.4 目的基因克隆第28页
        2.2.5 扩增片段电泳检测及回收第28页
        2.2.6 目的片段与pEASY-T载体的连接转化第28-29页
        2.2.7 质粒DNA提取第29页
        2.2.8 阳性重组子筛选及酶切验证第29-30页
        2.2.9 生物信息学分析第30页
        2.2.10 特异PCR引物设计第30-32页
        2.2.11 统计学分析第32-33页
第三章 结果与分析第33-42页
    3.1 小麦籽粒淀粉含量及差异分析第33页
    3.2 淀粉合成关键酶基因克隆及生物信息学分析第33-37页
        3.2.1 SSⅡa基因克隆及序列结构分析第33-37页
        3.2.2 SBEⅡa和SBEⅡb基因克隆及序列结构分析第37页
    3.3 SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因序列多态性及单倍型分析第37-40页
        3.3.1 基因序列多态性分析第37-39页
        3.3.2 基因编码区核苷酸多态性分析第39页
        3.3.3 基因序列单倍型分析第39-40页
    3.4 SNP检测及与淀粉含量的关联分析第40-42页
        3.4.1 SNP分型结果第40页
        3.4.2 基因型和等位基因频率分析第40-41页
        3.4.3 SSⅡa-rs31 位点和 SBEⅡa-rs10 位点多态性与支链淀粉含量关联分析第41-42页
第四章 讨论与结论第42-46页
    4.1 影响SNP检测的两个因素第42页
        4.1.1 实验材料的选取第42页
        4.1.2 基因组DNA的提取第42页
    4.2 SNP的检测方法第42-43页
    4.3 SSIIa基因序列差异对淀粉含量的影响第43页
    4.4 SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb编码区核苷酸多态性第43-44页
    4.5 SNP多态性与淀粉含量的相关关系第44-45页
    4.6 SNP多态性关联分析总结与展望第45页
    4.7 结论第45-46页
参考文献第46-53页
附表 1 材料名称及来源第53-55页
附表 2 SNP 扩增引物第55-58页
作者简介第58-59页
致谢第59-60页
附件第60页

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