| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第12-19页 |
| 1.1 模式识别受体及抗病毒天然免疫 | 第12-15页 |
| 1.1.1 细胞表面TLRs | 第13页 |
| 1.1.2 细胞内TLRs | 第13页 |
| 1.1.3 RLRs | 第13-14页 |
| 1.1.4 炎性小体激活及白介素 1（IL-1） | 第14页 |
| 1.1.5 胞浆内识别病毒DNA诱导IFN-β | 第14-15页 |
| 1.2 转录组学研究进展 | 第15-18页 |
| 1.2.1 转录组的概念与研究内容 | 第15页 |
| 1.2.2 转录组学的研究方法 | 第15-16页 |
| 1.2.3 表达序列标签技术(Expressed Sequence Tags, EST) | 第16页 |
| 1.2.4 基因芯片技术(Genechip) | 第16-17页 |
| 1.2.5 基因表达系列分析(serial analysis of gene expression, SAGE) | 第17页 |
| 1.2.6 大规模平行测序技术(Massively parallel signature sequencing, MPSS) | 第17页 |
| 1.2.7 RNA测序技术（RNA-Seq技术） | 第17-18页 |
| 1.3 本研究目的及意义 | 第18-19页 |
| 第二章 水貂部分TOLL样受体基因的分子克隆、序列分析及组织表达分析 | 第19-31页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-24页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第19页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第19页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.4 引物设计及合成 | 第20-21页 |
| 2.1.5 外周血单个核细胞的提取 | 第21页 |
| 2.1.6 总RNA的提取 | 第21页 |
| 2.1.7 单链cDNA的合成 | 第21-22页 |
| 2.1.8 TLR4、TLR6、TLR7、TLR8基因片段的RT-PCR扩增 | 第22页 |
| 2.1.9 RT-PCR产物的克隆与重组质粒的序列测定 | 第22-23页 |
| 2.1.10 半定量RT-PCR检测健康仔貂和成年貂TLR4、TLR7基因的组织分布 | 第23-24页 |
| 2.2 结果与分析 | 第24-29页 |
| 2.2.1 PBMCs总RNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.2 水貂TLR4、TLR6、TLR7、TLR8基因的PCR扩增 | 第24-25页 |
| 2.2.3 重组质粒的鉴定 | 第25-26页 |
| 2.2.4 水貂TLR4、TLR6、TLR7、TLR8基因的同源性分析 | 第26-27页 |
| 2.2.5 水貂TLR4、TLR6、TLR7、TLR8基因的进化树分析 | 第27-28页 |
| 2.2.6 TLR4、TLR7基因在健康仔貂和成年貂组织中的分布情况 | 第28-29页 |
| 2.3 讨论 | 第29-31页 |
| 第三章 乌苏里貉TLR8基因的分子克隆及其结构与功能预测分析 | 第31-41页 |
| 3.1 材料与方法 | 第31-35页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第31页 |
| 3.1.2 试验试剂 | 第31页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第31页 |
| 3.1.4 引物合成 | 第31-32页 |
| 3.1.5 总RNA的提取和单链cDNA的合成 | 第32页 |
| 3.1.6 乌苏里貉TLR8基因全长序列克隆 | 第32-35页 |
| 3.1.7 乌苏里貉TLR8基因的生物信息学分析 | 第35页 |
| 3.2 结果与分析 | 第35-40页 |
| 3.2.1 PBMCs总RNA的提取 | 第35页 |
| 3.2.2 TLR8基因中间段序列PCR扩增及 3' RACE和 5' RACE扩增 | 第35-36页 |
| 3.2.3 TLR8全长基因的序列验证 | 第36页 |
| 3.2.4 TLR8全长基因编码蛋白的理化特性 | 第36页 |
| 3.2.5 乌苏里貉TLR8编码蛋白的二级结构分析 | 第36-37页 |
| 3.2.6 乌苏里貉TLR8蛋白的信号肽预测 | 第37页 |
| 3.2.7 乌苏里貉TLR8蛋白的跨膜区预测 | 第37-38页 |
| 3.2.8 乌苏里貉TLR8蛋白质结构域预测 | 第38页 |
| 3.2.9 乌苏里貉TLR8基因与其他物种TLR8基因同源性分析 | 第38-40页 |
| 3.3 讨论 | 第40-41页 |
| 第四章 貉外周血单个核细胞转录组 RNA-Seq 测序及分析 | 第41-51页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 4.1.1 试验动物及材料 | 第41页 |
| 4.1.2 试验试剂 | 第41页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第41页 |
| 4.1.4 乌苏里貉外周血单个核细胞总RNA的提取 | 第41页 |
| 4.1.5 cDNA文库的构建和Illumina测序 | 第41-42页 |
| 4.1.6 质量控制和序列的拼接 | 第42页 |
| 4.1.7 转录物功能注释及分类 | 第42页 |
| 4.1.8 ORF预测 | 第42页 |
| 4.1.9 基因表达分析 | 第42页 |
| 4.2 结果与分析 | 第42-49页 |
| 4.2.1 总RNA质量检测 | 第42-43页 |
| 4.2.2 测序数据初步分析 | 第43-45页 |
| 4.2.3 转录物功能注释及分类 | 第45-48页 |
| 4.2.4 ORF预测及基因表达分析 | 第48-49页 |
| 4.2.5 本地BLAST数据库的建立及初步应用 | 第49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-51页 |
| 第五章 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 附录 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简历 | 第60页 |
