| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-23页 |
| 1 课题的提出 | 第13-14页 |
| 2 前人研究进展 | 第14-22页 |
| 2.1 芽变与果实成熟 | 第14-15页 |
| 2.2 果实成熟机理研究进展 | 第15-20页 |
| 2.2.1 果实成熟相关组学方面研究进展 | 第15-16页 |
| 2.2.2 果实成熟相关果实品质研究进展 | 第16-17页 |
| 2.2.3 果实成熟相关转录因子及小RNA研究进展 | 第17-19页 |
| 2.2.4 果实成熟相关植物激素研究进展 | 第19-20页 |
| 2.3 转录组测序与SSR分子标记开发 | 第20-22页 |
| 2.3.1 转录组测序的研究进展 | 第20-21页 |
| 2.3.2 基于新一代测序技术的SSR分子标记的开发及应用 | 第21-22页 |
| 3 本研究的目的和内容 | 第22-23页 |
| 第二章 锦橙及其晚熟芽变果实成熟过程中内外品质比较分析 | 第23-55页 |
| 1 引言 | 第23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-26页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23-24页 |
| 2.1.2 主要生化试剂及实验仪器 | 第24-26页 |
| 2.2 试验方法 | 第26-39页 |
| 2.2.1 砧木遗传背景鉴定 | 第26-31页 |
| 2.2.2 果实外观品质测定 | 第31页 |
| 2.2.3 果实内在品质测定 | 第31-35页 |
| 2.2.4 果实成熟相关基因表达谱测定 | 第35-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-50页 |
| 3.1 普通锦橙及其晚熟芽变砧木遗传背景分析 | 第39-40页 |
| 3.2 锦橙及其晚熟芽变果实外观品质分析 | 第40-41页 |
| 3.2.1 果实色泽参数测定 | 第40-41页 |
| 3.2.2 单果重及果形指数测定 | 第41页 |
| 3.3 锦橙及其晚熟芽变果实内在品质分析 | 第41-45页 |
| 3.3.1 果实常规品质分析 | 第41-43页 |
| 3.3.2 果实可溶性糖酸含量分析 | 第43-45页 |
| 3.3.3 果肉中内源ABA，JA及IAA含量分析 | 第45页 |
| 3.4 果实成熟相关基因表达谱分析 | 第45-50页 |
| 3.4.1 果实成熟过程中蔗糖合成及信号转导途径关键基因表达谱分析.33 | 第45-46页 |
| 3.4.2 果实成熟过程中ABA合成及信号转导途径关键基因的表达谱分析 | 第46-47页 |
| 3.4.3 果实成熟过程中JA合成及信号转导途径关键基因表达谱分析 | 第47-50页 |
| 4 讨论 | 第50-55页 |
| 4.1 锦橙果实发育成熟过程中的果实品质变化 | 第50页 |
| 4.2 锦橙果实发育成熟过程中内源激素变化 | 第50-52页 |
| 4.3 锦橙果实成熟过程中蔗糖，ABA和JA可能的互作模式 | 第52-55页 |
| 第三章 锦橙及其晚熟芽变果实成熟早期转录组分析及SSR分子标记的开发 | 第55-98页 |
| 1 引言 | 第55-56页 |
| 2 材料与方法 | 第56-62页 |
| 2.1 实验材料 | 第56页 |
| 2.2 试验方法 | 第56-62页 |
| 2.2.1 转录组测序 | 第56-58页 |
| 2.2.2 锦橙转录组SSR分布 | 第58页 |
| 2.2.3 SSR分子标记的开发 | 第58-61页 |
| 2.2.4 qRT-PCR分析基因表达 | 第61页 |
| 2.2.5 基因启动子区顺式作用元件分析 | 第61-62页 |
| 3 结果与分析 | 第62-91页 |
| 3.1 转录组测序 | 第62-74页 |
| 3.1.1 转录组测序结果统计 | 第62-63页 |
| 3.1.2 Unigene注释 | 第63-66页 |
| 3.1.3 差异表达基因分析 | 第66-74页 |
| 3.1.4 qRT-PCR验证 | 第74页 |
| 3.2 锦橙SSR分布 | 第74-77页 |
| 3.2.1 SSR位点搜索 | 第74-75页 |
| 3.2.2 SSR重复基序长度及类型分布 | 第75-77页 |
| 3.3 SSR分子标记的开发 | 第77-82页 |
| 3.3.1 SSR引物的设计 | 第77-78页 |
| 3.3.2 SSR引物的筛选 | 第78-79页 |
| 3.3.3 SSR引物多态性评价及其应用 | 第79-82页 |
| 3.4 熟期候选基因CsTCP2 分析 | 第82-91页 |
| 3.4.1 CsTC2P基因在果实发育过程中的表达谱分析 | 第82-83页 |
| 3.4.2 CsTCP2 基因及ABA，JA合成及信号转导途径相关基因启动子区顺式作用元件分析 | 第83-91页 |
| 4 讨论 | 第91-98页 |
| 4.1 锦橙果实成熟早期转录组水平 | 第91-92页 |
| 4.2 基于转录组测序结果的柑橘SSR分子标记的开发及应用 | 第92-95页 |
| 4.3 柑橘TCP2 功能探讨 | 第95-97页 |
| 4.4 后续研究设想及展望 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-118页 |
| 图版 | 第118-121页 |
| 附录Ⅰ 相关数据列表 | 第121-136页 |
| 附录II攻读博士期间发表的论文 | 第136-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
