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秦岭金丝猴(Rhinopithecus roxellana)基因组微卫星位点的筛选及亲子鉴定

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
第一章 绪论第10-24页
    1.1 秦岭金丝猴的简介第10页
    1.2 杀婴行为第10-12页
        1.2.1 杀婴行为的假说第11页
        1.2.2 雌性对杀婴行为的应对策略第11页
        1.2.3 杀婴行为研究现状第11-12页
    1.3 单元外交配行为第12-15页
        1.3.1 单元外交配行为的研究现状第13-14页
        1.3.2 雌性交配对象的选择第14-15页
    1.4 遗传标记的选择第15-18页
        1.4.1 用于研究亲缘关系的遗传学标记第15-17页
        1.4.2 各种遗传标记的特点第17-18页
    1.5 开发微卫星位点的方法第18-19页
        1.5.1 从相关已发表文献或数据库中查找微卫星位点第18页
        1.5.2 从相近物种获得微卫星序列第18-19页
        1.5.3 创建基因组文库筛选微卫星位点第19页
    1.6 微卫星位点的检测方法第19-20页
        1.6.1 聚丙烯酰胺凝胶检测第19-20页
        1.6.2 毛细管电泳第20页
    1.7 亲子鉴定第20-21页
        1.7.1 亲子鉴定的定义及原理第20页
        1.7.2 基于微卫星的亲子鉴定方法第20-21页
    1.8 本研究的目的和意义第21-24页
第二章 研究材料与方法第24-38页
    2.1 研究地点第24页
    2.2 研究对象第24-27页
        2.2.1 研究对象介绍第24-25页
        2.2.2 性别年龄组、等级划分第25-26页
        2.2.3 研究群详细信息第26-27页
    2.3 野外研究方法第27页
        2.3.1 样品采集第27页
        2.3.2 雌性秦岭金丝猴生育数据数据收集第27页
    2.4 主要实验仪器、试剂及常用溶液配制第27-29页
    2.5 微卫星序列选取及引物的设计第29-30页
        2.5.1 秦岭金丝猴全基因组序列的获取第29页
        2.5.2 微卫星序列选取第29页
        2.5.3 微卫星引物设计第29-30页
    2.6 基因组DNA的提取第30-31页
        2.6.1 肌肉样品DNA的提取第30-31页
        2.6.2 毛发DNA的提取第31页
        2.6.3 粪便DNA的提取第31页
    2.7 粪便DNA质量的检测第31-32页
        2.7.1 引物选取第32页
        2.7.2 目的片段的扩增与检测第32页
    2.8 秦岭金丝猴基因组微卫星位点的筛选第32-34页
        2.8.1 琼脂糖凝胶电泳检测第32页
        2.8.2 聚丙烯酰氨凝胶电泳(PAGE)检测第32-33页
        2.8.3 毛细管电泳检测第33-34页
    2.9 数据处理第34-38页
        2.9.1 群体遗传多样性统计量第34-35页
        2.9.2 Hardy-Weinberg平衡检验第35页
        2.9.3 亲子鉴定第35-36页
        2.9.4 亲缘关系对比第36-38页
第三章 结果第38-48页
    3.1 基因组微卫星分析第38-39页
    3.2 高多态性基因组微卫星位点的筛选及命名第39-42页
    3.3 亲子鉴定第42-44页
        3.3.1 2015年生育婴猴亲子鉴定第42-44页
        3.3.2 2016年生育死婴亲子鉴定第44页
    3.4 单元外交配行为第44-48页
        3.4.1 影响单元外交配发生的因素第45-47页
        3.4.2 单元外交配对象的选择第47页
        3.4.3 亲缘关系分析第47-48页
第四章 讨论第48-54页
    4.1 微卫星筛选的可靠性及质量第48页
    4.2 单元外交配行为第48-49页
    4.3 亲子鉴定评价第49-50页
    4.4 秦岭雌性金丝猴的杀婴避免机制第50-51页
    4.5 改进与创新点第51-52页
    4.6 不足及展望第52-54页
结论第54-56页
参考文献第56-70页
附录第70-74页
攻读硕士学位期间取得的科研成果第74-76页
致谢第76-77页

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