致谢 | 第4-5页 |
中文摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第1章 引言 | 第11-18页 |
1.1 蛋白质的泛素化修饰 | 第11-14页 |
1.2 USP家族成员Usp25和Usp28 | 第14-15页 |
1.2.1 去泛素水解酶Usp25 | 第14页 |
1.2.2 去泛素水解酶Usp28 | 第14-15页 |
1.3 核磁共振技术(NMR)在结构生物学研究中的应用 | 第15-16页 |
1.3.1 NMR在蛋白质结构解析中的应用 | 第15-16页 |
1.3.2 NMR在蛋白质-蛋白质相互作用研究中的应用 | 第16页 |
1.4 拟解决的科学问题 | 第16-18页 |
第2章 去泛素水解酶Usp25的结构与功能研究 | 第18-39页 |
2.1 实验材料 | 第18-21页 |
2.1.1 试剂 | 第18-19页 |
2.1.2 菌株和质粒 | 第19页 |
2.1.3 引物 | 第19-20页 |
2.1.4 仪器 | 第20-21页 |
2.2 实验方法 | 第21-26页 |
2.2.1 质粒信息 | 第21页 |
2.2.2 蛋白质样品制备 | 第21-22页 |
2.2.3 K48-diub和K63-diub样品制备 | 第22-23页 |
2.2.4 NMR化学位移扰动实验 | 第23-24页 |
2.2.5 Usp25_(1-146)溶液结构解析 | 第24-25页 |
2.2.6 等温滴定量热实验 | 第25-26页 |
2.2.7 Ub-AMC水解实验 | 第26页 |
2.2.8 二聚泛素K48-diub水解实验 | 第26页 |
2.3 实验结果 | 第26-37页 |
2.3.1 Usp25_(1-146)的溶液结构 | 第26-28页 |
2.3.2 Usp25_(1-146)与泛素之间的相互作用模式研究 | 第28-31页 |
2.3.3 Usp25_(1-146)与SUMO之间的相互作用模式研究 | 第31-34页 |
2.3.4 SUMO分子调控Usp25酶活功能的分子机制 | 第34-37页 |
2.4 实验小结 | 第37-39页 |
第3章 去泛素水解酶Usp28的结构与功能研究 | 第39-61页 |
3.1 实验材料 | 第39-40页 |
3.1.1 试剂 | 第39页 |
3.1.2 菌株和质粒 | 第39页 |
3.1.3 引物 | 第39-40页 |
3.1.4 仪器 | 第40页 |
3.2 实验方法 | 第40-45页 |
3.2.1 质粒信息 | 第40-41页 |
3.2.2 蛋白质样品制备 | 第41页 |
3.2.3 NMR化学位移扰动实验 | 第41-42页 |
3.2.4 Usp28_(1-120)溶液结构解析 | 第42-43页 |
3.2.5 等温滴定量热实验 | 第43-44页 |
3.2.6 Ub-AMC水解实验 | 第44页 |
3.2.7 二聚泛素K48-diub、K63-diub水解实验 | 第44页 |
3.2.8 荧光淬灭实验 | 第44-45页 |
3.2.9 圆二色谱 | 第45页 |
3.3 实验结果 | 第45-59页 |
3.3.1 Usp28泛素结合结构区域UBR的溶液结构 | 第45-46页 |
3.3.2 Usp28 UBR结构域与泛素之间的相互作用模式研究 | 第46-53页 |
3.3.3 Usp28 UBR结构域与类泛素SUMO之间的相互作用模式研究 | 第53-54页 |
3.3.4 SUMO分子调控Usp28酶活功能的分子机制 | 第54-56页 |
3.3.5 Usp28 UBR与配体蛋白的结合计量比以及结合强度 | 第56-59页 |
3.4 实验小结 | 第59-61页 |
第4章 结果与讨论 | 第61-63页 |
参考文献 | 第63-70页 |
附录 | 第70-123页 |
作者简历 | 第123页 |
教育经历 | 第123页 |
攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第123页 |