基于模块化因子图的多发性骨髓瘤信号通路机制研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3 主要研究内容及创新点 | 第13-15页 |
| 1.3.1 主要研究内容 | 第13-15页 |
| 1.3.2 研究创新点 | 第15页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第15-16页 |
| 第2章 相关研究方法 | 第16-28页 |
| 2.1 蛋白质微阵列技术 | 第16-17页 |
| 2.2 信号通路作用机制 | 第17-18页 |
| 2.3 系统生物学模型 | 第18-22页 |
| 2.3.1 微分方程建模 | 第18-20页 |
| 2.3.2 Petri网建模 | 第20-22页 |
| 2.4 因子图 | 第22-23页 |
| 2.5 参数优化算法 | 第23-27页 |
| 2.5.1 粒子群算法 | 第24-25页 |
| 2.5.2 置信传播算法 | 第25-26页 |
| 2.5.3 遗传算法 | 第26-27页 |
| 2.6 参数分析 | 第27页 |
| 2.6.1 稳定性分析 | 第27页 |
| 2.6.2 敏感性分析 | 第27页 |
| 2.7 本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 信号通路构建 | 第28-36页 |
| 3.1 实验数据来源 | 第28-29页 |
| 3.2 粗粒度筛选关键蛋白质 | 第29-32页 |
| 3.3 构建信号通路 | 第32-34页 |
| 3.3.1 获取一般信号通路 | 第32-33页 |
| 3.3.2 简化信号通路 | 第33-34页 |
| 3.4 本章小结 | 第34-36页 |
| 第4章 模型构建及参数优化 | 第36-60页 |
| 4.1 模块化信号通路 | 第36-43页 |
| 4.1.1 混合函数Petri网建模 | 第36-38页 |
| 4.1.2 常微分方程建模 | 第38-42页 |
| 4.1.3 模块化参数优化 | 第42-43页 |
| 4.2 构造信号通路因子图 | 第43-49页 |
| 4.2.1 信号通路分解 | 第43-44页 |
| 4.2.2 构造信号通路因子图 | 第44-48页 |
| 4.2.3 因子参数优化 | 第48-49页 |
| 4.3 全局参数优化 | 第49-50页 |
| 4.4 参数优化拟合效果比较 | 第50-56页 |
| 4.4.1 实验环境设置 | 第50页 |
| 4.4.2 拟合效果比较 | 第50-54页 |
| 4.4.3 误差比较 | 第54-56页 |
| 4.5 统计检验 | 第56-57页 |
| 4.6 本章小结 | 第57-60页 |
| 第5章 参数分析与实验验证 | 第60-66页 |
| 5.1 参数分析 | 第60-63页 |
| 5.1.1 稳定性分析 | 第60-61页 |
| 5.1.2 敏感性分析 | 第61-62页 |
| 5.1.3 参数变化分析 | 第62-63页 |
| 5.2 免疫组化实验验证 | 第63-65页 |
| 5.3 本章小结 | 第65-66页 |
| 第6章 总结与展望 | 第66-68页 |
| 6.1 论文工作总结 | 第66-67页 |
| 6.2 讨论与展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 附录 | 第74-78页 |
| 附录一：RPPA数据热点图 | 第74-75页 |
| 附录二：伦理证明 | 第75-76页 |
| 附录三：样本的免疫组化染色结果 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78-80页 |
| 研究生期间发表学术论文 | 第80页 |
