| 摘要 | 第2-5页 |
| Summary | 第5-8页 |
| 前言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-22页 |
| 1.1 VQ蛋白特征 | 第13-14页 |
| 1.2 VQ基因特征 | 第14-16页 |
| 1.3 VQ蛋白的生物学功能 | 第16-19页 |
| 1.3.1 VQ蛋白在植物生长发育中的作用 | 第17-18页 |
| 1.3.2 VQ蛋白在植物响应生物胁迫中的作用 | 第18页 |
| 1.3.3 VQ蛋白在植物响应非生物胁迫中的作用 | 第18-19页 |
| 1.4 VQ蛋白的作用机制 | 第19-20页 |
| 1.5 VQ结构域的重要性 | 第20页 |
| 1.6 本研究立题依据和目的意义 | 第20-22页 |
| 第二章 大白菜VQ基因家族生物信息学分析 | 第22-47页 |
| 2.1 材料 | 第22页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第22页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第22页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第22页 |
| 2.2 方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 序列的获取和鉴定 | 第22-23页 |
| 2.2.2 VQ成员的命名 | 第23页 |
| 2.2.3 VQ成员蛋白序列分析 | 第23页 |
| 2.2.4 VQ成员基因结构分析 | 第23-24页 |
| 2.2.5 VQ成员染色体定位及共线性分析 | 第24页 |
| 2.2.6 系统进化树构建 | 第24页 |
| 2.2.7 大白菜材料处理 | 第24页 |
| 2.2.8 大白菜RNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.9 大白菜cDNA的合成及检测 | 第25页 |
| 2.2.10 实时荧光定量PCR及数据分析 | 第25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-43页 |
| 2.3.1 大白菜VQ基因鉴定及命名 | 第25-26页 |
| 2.3.2 大白菜VQ成员的基因及蛋白序列分析 | 第26-27页 |
| 2.3.3 大白菜VQ成员进化树、基因结构和结构域分析 | 第27-32页 |
| 2.3.4 大白菜VQ蛋白结构域分析 | 第32-33页 |
| 2.3.5 大白菜VQ基因染色体分布 | 第33-34页 |
| 2.3.6 大白菜VQ成员共线性分析 | 第34-35页 |
| 2.3.7 拟南芥、大白菜和水稻VQ蛋白的系统进化树分析 | 第35-36页 |
| 2.3.8 大白菜VQ基因在各组织中的表达量 | 第36-38页 |
| 2.3.9 不同非生物胁迫下大白菜VQ基因的表达 | 第38-39页 |
| 2.3.10 不同激素处理下大白菜VQ基因的表达 | 第39-41页 |
| 2.3.11 大白菜与拟南芥同源VQ基因的表达模式比较 | 第41-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-47页 |
| 2.4.1 大白菜VQ基因的复制 | 第43-44页 |
| 2.4.2 VQ基因在植物生长发育中的作用 | 第44-45页 |
| 2.4.3 VQ基因响应植物生物及非生物胁迫 | 第45-47页 |
| 第三章 拟南芥VQ3基因功能分析 | 第47-67页 |
| 3.1 材料 | 第47页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第47页 |
| 3.1.2 仪器 | 第47页 |
| 3.1.3 试剂 | 第47页 |
| 3.2 方法 | 第47-54页 |
| 3.2.1 拟南芥种子消毒及培养条件 | 第47-48页 |
| 3.2.2 拟南芥基因组DNA提取及检测 | 第48页 |
| 3.2.3 拟南芥总RNA提取及检测 | 第48页 |
| 3.2.4 拟南芥cDNA的合成及检测 | 第48页 |
| 3.2.5 PCR产物回收及测序 | 第48-49页 |
| 3.2.6 质粒提取 | 第49页 |
| 3.2.7 农杆菌LBA4404感受态制备 | 第49-50页 |
| 3.2.8 农杆菌转化 | 第50页 |
| 3.2.9 拟南芥VQ3过量表达载体构建 | 第50-51页 |
| 3.2.10 AtVQ3干扰载体构建 | 第51-52页 |
| 3.2.11 拟南芥花序浸染法 | 第52页 |
| 3.2.12 转基因植株DNA提取及PCR检测 | 第52-53页 |
| 3.2.13 AtVQ3基因组织特异性表达 | 第53页 |
| 3.2.14 AtVQ3基因在不同胁迫和激素处理下的表达 | 第53页 |
| 3.2.15 转基因拟南芥的表型分析 | 第53-54页 |
| 3.3 结果与分析 | 第54-65页 |
| 3.3.1 AtVQ3基因克隆及其过量表达载体构建 | 第54-55页 |
| 3.3.2 AtVQ3干扰片段克隆及其干扰载体构建 | 第55-56页 |
| 3.3.3 转基因植株的筛选 | 第56-57页 |
| 3.3.4 转基因植株DNA鉴定 | 第57-58页 |
| 3.3.5 qRT-PCR检测过量表达植株和干扰植株中AtVQ3的表达量 | 第58-59页 |
| 3.3.6 不同组织中AtVQ3基因表达分析 | 第59-60页 |
| 3.3.7 不同处理下AtVQ3基因表达分析 | 第60页 |
| 3.3.8 转基因拟南芥表型分析 | 第60-65页 |
| 3.4 讨论 | 第65-67页 |
| 第四章 野生型及转基因拟南芥转录组分析 | 第67-82页 |
| 4.1 材料 | 第67页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第67页 |
| 4.1.2 生化试剂 | 第67页 |
| 4.2 方法 | 第67-71页 |
| 4.2.1 总RNA提取 | 第67页 |
| 4.2.2 文库构建 | 第67-68页 |
| 4.2.3 文库信息分析 | 第68-69页 |
| 4.2.4 测序过滤 | 第69页 |
| 4.2.5 数据比对 | 第69页 |
| 4.2.6 基因定量 | 第69页 |
| 4.2.7 差异基因筛选 | 第69-70页 |
| 4.2.8 Gene Ontology分析 | 第70-71页 |
| 4.2.9 差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第71页 |
| 4.3 结果与分析 | 第71-78页 |
| 4.3.1 RNA-Seq测序数据分析 | 第71-72页 |
| 4.3.2 差异表达基因分析 | 第72-73页 |
| 4.3.3 Gene ontology分析 | 第73-75页 |
| 4.3.4 细胞壁合成相关基因 | 第75-76页 |
| 4.3.5 植物激素信号途径相关基因 | 第76页 |
| 4.3.6 转录因子 | 第76页 |
| 4.3.7 开花相关基因 | 第76-77页 |
| 4.3.8 钙离子结合蛋白 | 第77页 |
| 4.3.9 盐胁迫响应基因 | 第77页 |
| 4.3.10 候选基因的qRT-PCR验证 | 第77-78页 |
| 4.4 讨论 | 第78-82页 |
| 第五章 大白菜BrVQ3-1 基因的功能分析 | 第82-90页 |
| 5.1 植物材料 | 第82页 |
| 5.2 方法 | 第82页 |
| 5.3 结果与分析 | 第82-88页 |
| 5.3.1 BrVQ3-1 基因的克隆及序列分析 | 第82-84页 |
| 5.3.2 BrVQ3-1 过量表达株系的获得 | 第84页 |
| 5.3.3 BrVQ3-1 过量表达株系表型分析 | 第84-88页 |
| 5.3.4 候选基因的qRT-PCR验证 | 第88页 |
| 5.4 小结 | 第88-90页 |
| 第六章 结论 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-105页 |
| 附录 | 第105-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 导师简介 | 第109-110页 |
| 作者简介 | 第110-111页 |
