| 中文摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 第一部分 基于RNA-Seq的EB病毒感染前后胃癌细胞系AGS中差异表达长链非编码RNA（lncRNA）的筛选 | 第9-48页 |
| 中文摘要 | 第9-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 引言 | 第12-14页 |
| 第一章 材料与方法 | 第14-26页 |
| 1.1 仪器、试剂和耗材 | 第14-15页 |
| 1.2 细胞处理 | 第15页 |
| 1.3 Illumina Hiseq 2000 平台测序流程 | 第15-16页 |
| 1.4 RNA-Seq文库构建及测序数据的生成 | 第16-22页 |
| 1.5 RNA-Seq测序数据的生物信息分析 | 第22-26页 |
| 第二章 结果 | 第26-35页 |
| 2.1 RNA质检 | 第26页 |
| 2.2 测序数据预处理结果 | 第26页 |
| 2.3 与参考基因组对比结果 | 第26-27页 |
| 2.4 各组总lncRNA表达情况 | 第27页 |
| 2.5 差异表达的lncRNA | 第27-30页 |
| 2.6 lncRNA靶基因预测 | 第30页 |
| 2.7 lncRNA靶基因功能富集分析 | 第30-32页 |
| 2.8 mRNA与lnc RNA的表达水平及结构比较分析 | 第32-35页 |
| 第三章 讨论 | 第35-41页 |
| 研究结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 第二部分EB病毒感染调控长链非编码RNA H19参与胃癌的发生及其机制探讨 | 第48-87页 |
| 中文摘要 | 第48-50页 |
| 英文摘要 | 第50-52页 |
| 引言 | 第52-55页 |
| 第一章 材料与方法 | 第55-69页 |
| 1.1 仪器、试剂和耗材 | 第55-56页 |
| 1.2 细胞系及胃癌组织标本 | 第56页 |
| 1.3 原位杂交筛选EBV阳性胃癌标本 | 第56-58页 |
| 1.4 细胞系及新鲜胃癌组织DNA的提取 | 第58页 |
| 1.5 石蜡包埋胃癌组织DNA提取 | 第58-60页 |
| 1.6 RNA提取及qRT-PCR | 第60-62页 |
| 1.7 H19启动子甲基化检测 | 第62-66页 |
| 1.8 H19印记状态检测 | 第66-68页 |
| 1.9 统计学分析 | 第68-69页 |
| 第二章 结果 | 第69-77页 |
| 2.1 EBV阳性细胞系及EBV阴性细胞系中lncRNA H19的表达 | 第69页 |
| 2.2 EBVaGC和EBVn GC组织中lncRNA H19的表达 | 第69-70页 |
| 2.3 EBV阳性细胞系及EBV阴性细胞系H19启动子甲基化分析 | 第70-72页 |
| 2.4 EBVaGC和EBVn GC组织H19启动子甲基化分析 | 第72-73页 |
| 2.5 EBVaGC和EBVn GC组织H19启动子等位基因差异性甲基化 | 第73-74页 |
| 2.6 EBVaGC和EBVn GC组织H19印记状态分析 | 第74-77页 |
| 第三章 讨论 | 第77-82页 |
| 3.1 在EBV阳性及阴性胃癌中lncRNA H19的表达 | 第77-78页 |
| 3.2 EBVaGC及EBVn GC组织中H19基因印记状态分析 | 第78-79页 |
| 3.3 H19启动子甲基化在调控lncRNA H19表达中的作用 | 第79-82页 |
| 研究结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-87页 |
| 综述 | 第87-107页 |
| 参考文献 | 第98-107页 |
| 攻读学位期间的学术成果 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
