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ABO血型抗原的生物法合成及其与肠道菌关系的研究

中文摘要第14-17页
ABSTRACT第17-20页
符号说明第21-23页
第一章 绪论第23-50页
    1.1 ABO血型系统第24-30页
        1.1.1 ABO血型抗原及形成第24-25页
        1.1.2 人类的ABO天然抗体第25-26页
        1.1.3 ABO血型与疾病第26-27页
        1.1.4 寡糖的合成第27-30页
    1.2 糖核苷酸及其合成第30-37页
        1.2.1 糖核苷酸的种类及功能第30-31页
        1.2.2 糖核苷酸的化学合成第31-32页
        1.2.3 糖核苷酸的酶法合成第32-36页
        1.2.4 糖核苷酸的发酵法合成第36-37页
    1.3 细菌表面多糖第37-40页
        1.3.1 细菌表面多糖的分类第37-39页
        1.3.2 细菌表面多糖与血型抗体的相互作用第39-40页
    1.4 肠道菌群与人类的关系第40-48页
        1.4.1 肠道菌群的组成第40-42页
        1.4.2 肠道菌的功能第42-44页
        1.4.3 肠道菌群与疾病第44-48页
            1.4.3.1 肠道菌群与肠道疾病第44-46页
            1.4.3.2 肠道菌群与肥胖和2型糖尿病第46-47页
            1.4.3.3 肠道菌群与免疫系统疾病第47-48页
            1.4.3.4 肠道菌群与神经精神疾病第48页
    1.5 论文内容大纲第48-50页
第二章 trGlmU-NahK融合酶的性质研究以及在UDP-GlcNAc合成中的应用第50-65页
    2.0 引言第50-51页
    2.1 实验材料第51-52页
        2.1.1 菌株和载体第51页
        2.1.2 酶、试剂和耗材第51页
        2.1.3 主要仪器第51-52页
    2.2 实验方法第52-57页
        2.2.1 基因克隆与表达载体的构建第52-54页
        2.2.2 NahK- trGlmU融合酶的表达与纯化第54页
        2.2.3 酶的活性检测第54-55页
        2.2.4 定量检测方法第55页
        2.2.5 最适催化条件的摸索第55-56页
        2.2.6 酶活的测定方法第56页
        2.2.7 UDP-GlcNAc的小规模合成第56-57页
        2.2.8 UDP-GlcNAc的纯化第57页
    2.3 结果与讨论第57-63页
        2.3.1 NahK和trGlmU融合片段的克隆第57页
        2.3.2 NahK、GlmU以及trGlmU-NahK融合酶的表达与纯化第57-58页
        2.3.3 NahK、GlmU以及trGlmU-NahK的活性检测第58-60页
        2.3.4 trGlmU-NahK融合酶与NahK和GlmU的生物化学性质比较第60-61页
        2.3.5 UDP-GlcNAc的小规模制备第61-62页
        2.3.6 UDP-GlcNAc的纯化第62-63页
    2.4 本章小结第63-65页
第三章 GDP-Fuc的发酵法合成第65-83页
    3.0 引言第65-67页
    3.1 实验材料第67页
        3.1.1 菌株和载体第67页
        3.1.2 酶、试剂和耗材第67页
        3.1.3 主要仪器第67页
    3.2 实验方法第67-72页
        3.2.1 基因克隆与表达载体的构建第67-70页
        3.2.2 重组菌株诱导条件的摸索第70页
        3.2.3 重组菌株的摇瓶发酵第70页
        3.2.4 重组菌株的分批补料发酵第70-71页
        3.2.5 菌体干重的测量第71页
        3.2.6 发酵液中葡萄糖浓度和岩藻糖浓度的检测第71页
        3.2.7 比生长速率的计算第71-72页
        3.2.8 细胞内GDP-Fuc、GMP和GTP的提取第72页
        3.2.9 GDP-Fuc、GMP和GTP的检测方法第72页
    3.3 结果与讨论第72-81页
        3.3.1 代谢工程菌株的构建第72-74页
        3.3.2 重组酶表达条件的确定第74-76页
        3.3.3 工程菌株生长状况的比较第76-77页
        3.3.4 重组菌株产生GDP-Fuc的比较第77-79页
        3.3.5 菌株B的分批补料发酵第79-81页
        3.3.6 鸟嘌呤核苷酸合成加强的确定第81页
    3.4 本章小结第81-83页
第四章 人类ABO血型与肠道菌群的关系第83-113页
    4.0 引言第83-84页
    4.1 实验材料第84-85页
        4.1.1 实验所用菌株第84页
        4.1.2 抗体、试剂和耗材第84-85页
        4.1.3 主要仪器第85页
    4.2 实验方法第85-92页
        4.2.0 提供样品志愿者的招募第85页
        4.2.1 血型的确认第85-86页
        4.2.2 粪便样品的采集第86页
        4.2.3 DNA的提取与质量检测第86页
        4.2.4 DNA样品16S rDNAV3-V5区的454测序第86-88页
        4.2.5 序列的整理和归并第88-89页
        4.2.6 OTU的获得第89页
        4.2.7 OTU及其丰度分析第89页
        4.2.8 基于OTU的物种组成和丰度分析第89-90页
        4.2.9 样品Alpha多样性分析第90页
        4.2.10 肠道菌群的分离提取第90-91页
        4.2.11 菌体的固定第91页
        4.2.12 菌体表面多糖血型抗原活性的检测第91-92页
    4.3 结果与讨论第92-111页
        4.3.1 收集样品情况第92页
        4.3.2 序列统计第92-93页
        4.3.3 OTU统计第93-94页
        4.3.4 OTU Veen图分析第94-95页
        4.3.5 不同血型样品共有或特有的OTU分析第95-97页
        4.3.6 肠道菌群的系统发育分析第97-98页
        4.3.7 主成分分析第98-99页
        4.3.8 样品的Alpha多样性分析第99-102页
        4.3.9 不同血型组肠道菌群组成在门水平上的差异比较第102-104页
        4.3.10 不同血型组的肠道菌群在钢、目和科水平上的差异比较第104-105页
        4.3.11 不同分组样品在属水平上的有益菌和有害菌的组成差异比较第105-108页
        4.3.12 肠道菌群的ABO血型抗原活性第108-110页
        4.3.13 人类ABO血型与肠道菌群的相互作用第110-111页
    4.4 本章小结第111-113页
全文总结第113-115页
    一、本论文取得的创新性成果第113-114页
    二、本论文的不足与改进方法第114-115页
附录和附图第115-130页
参考文献第130-150页
致谢第150-151页
攻读学位期间发表论文第151-152页
外文论文第152-153页
学位论文评阅及答辩情况表第153页

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